天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

當(dāng)前位置:主頁(yè) > 理工論文 > 生物學(xué)論文 >

白屈菜(Chelidonium majus)油質(zhì)體和種子轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及脂肪酸合成分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-19 00:03
  油質(zhì)體(elaiosomes)是由螞蟻散布的一種特殊的肉質(zhì)的可食用的種子附屬物,同時(shí)也是種子上吸引螞蟻的主要結(jié)構(gòu),其主要成分為油脂,油脂主要由脂肪酸構(gòu)成。白屈菜(Chelidonium majus L.)是一種習(xí)見(jiàn)的多年生草本植物,廣泛分布于歐亞大陸,是典型的蟻播植物,其種子上含有油質(zhì)體作為種子附屬物,且由螞蟻傳播。前人通過(guò)對(duì)白屈菜的研究已經(jīng)確定了其油質(zhì)體的主要成分為脂肪酸,且其中主要脂肪酸棕櫚酸水平與昆蟲(chóng)的棕櫚酸水平相近。然而,油質(zhì)體中的脂肪酸生物合成的分子機(jī)制尚不清楚。在前期對(duì)白屈菜種子和油質(zhì)體發(fā)育觀察研究的基礎(chǔ)上,本研究選擇白屈菜花和種子生長(zhǎng)發(fā)育的四個(gè)時(shí)期,即花蕾期(Ch01)、盛花期(Ch02)、近成熟種子期(Ch03)和成熟種子期(Ch04),采集相應(yīng)時(shí)期的樣本,對(duì)每個(gè)時(shí)期的樣本做三個(gè)生物學(xué)重復(fù),通過(guò)RNA-seq技術(shù)對(duì)所獲全部材料進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序并對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析。擬通過(guò)白屈菜油質(zhì)體和種子在不同生長(zhǎng)時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,對(duì)油質(zhì)體中飽和脂肪酸和不飽和脂肪酸生物合成及代謝的主要時(shí)期進(jìn)行探究,同時(shí)通過(guò)分析不同時(shí)期的基因差異表達(dá)情況,篩選調(diào)控脂肪酸合成的關(guān)鍵基因。本研究取得的結(jié)果... 

【文章來(lái)源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

白屈菜(Chelidonium majus)油質(zhì)體和種子轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及脂肪酸合成分析


圖1-1白屈菜

白屈菜,完整性檢測(cè),樣本


?4結(jié)果與分析???4結(jié)果與分析??4.1轉(zhuǎn)錄組測(cè)序注釋結(jié)果??4.1.1?RNA質(zhì)量及濃度檢測(cè)??以1%的瓊脂糖凝膠電泳對(duì)12個(gè)白屈菜油質(zhì)體和種子樣本的RNA進(jìn)行完整??性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)提取的總RNA均呈現(xiàn)兩條清晰、無(wú)明顯拖尾現(xiàn)象的條帶,無(wú)雜質(zhì)??污染,如色素、糖類(lèi)、蛋白等,OD260/23021.5,OD260/28021.8,28/23S?亮度??大于18/16S,?RIN值28.0,總量滿足白屈菜物種建庫(kù)需求,可以進(jìn)行后續(xù)上機(jī)測(cè)??序?qū)嶒?yàn)。說(shuō)明獲得的總RNA樣本完整性良好。高質(zhì)量的RNA是RNA-seq測(cè)序??的基礎(chǔ),低質(zhì)量的RNA可能影響RNA-seq中GE磁珠分離mRNA及反轉(zhuǎn)錄效??率,可能造成全基因組表達(dá)譜分析方法測(cè)定不準(zhǔn)或RNA-seq文庫(kù)隨機(jī)性差異,??重復(fù)比例高,甚至建庫(kù)失敗。??

代謝過(guò)程,分類(lèi)圖,數(shù)據(jù)庫(kù),蛋白質(zhì)


??圖4-2白屈菜umgenes比對(duì)到NR數(shù)據(jù)庫(kù)的同源特性圖??A:?E-value值統(tǒng)計(jì)圖;B:相似度統(tǒng)計(jì)圖;C:比對(duì)物種分布圖。??Fig.4-2?Characteristics?of?sequence?homology?of?C.?majus?unigenes?against?the?NR?database??(A)?E-value?distribution?of?BLAST?hits?for?each?unigenes.?(B)?Similarity?distribution?of?the??top?BLAST?hits?for?each?unigene.?(C)?Species?distribution?of?the?top?BLAST?hits.??100????258??〇?,?,,—i—ifL?5??S?44?十}山2?丨??I?i??丨H??biological?process?ciiIIiiIhi?componen首?moteculai?luiiction??圖4-3?GO數(shù)據(jù)庫(kù)注釋情況分類(lèi)圖??Fig.4-3?GO?classification?of?assembled?unigenes.??在BP分類(lèi)中,大部分基因編碼的蛋白質(zhì)參與到代謝過(guò)程中,包括177個(gè)??unigenes,占總:注釋的68.6%;其次是參與到細(xì)胞過(guò)程的基因,包括169個(gè)unigenes,??占總注釋數(shù)的65.5%;以及參與到單一組織過(guò)程的基因,包括156個(gè)unigenes,??占總注釋數(shù)的60.47%。在MF分類(lèi)中,注釋到的基因被分到了?9個(gè)功能分類(lèi)中,??其中以催化活性功能(165個(gè)unigenes


本文編號(hào):2985926

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2985926.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶(hù)92df6***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com