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海洋瓊膠降解菌的分離、瓊膠酶研究及三株新菌的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2020-07-17 09:11
【摘要】:海洋是生命的起源地,其中蘊(yùn)含著豐富的資源,積極開發(fā)海洋資源,大力發(fā)展藍(lán)色經(jīng)濟(jì),是推動(dòng)強(qiáng)國戰(zhàn)略的重要方面。海洋生物中含有大量可利用的海洋多糖,瓊膠是其中重要的組成成分之一,具有廣闊的開發(fā)應(yīng)用前景。瓊膠降解菌可產(chǎn)生瓊膠酶,為實(shí)現(xiàn)瓊膠多糖的綠色、高效的生物降解提供了有力的工具,受到了廣泛關(guān)注。本文以瓊膠降解菌為主要研究對(duì)象,進(jìn)行一系列研究工作。首先,以分離瓊膠降解細(xì)菌為出發(fā)點(diǎn),采集威海及日照沿海樣品進(jìn)行海洋微生物的篩選分離,共得到14株潛在新物種和7株瓊膠降解菌。對(duì)其中的2株海洋新物種O448T和F02T及1株新型瓊膠降解菌RQJ05T進(jìn)行多相分類。經(jīng)鑒定,菌株0448T呈革蘭氏染色陰性、好氧性、無運(yùn)動(dòng)性,氧化酶和過氧化氫酶呈陽性,主要的呼吸醌是Q-10,主要的脂肪酸成為是C18:1ω7c,極性脂組成主要有磷脂酰乙醇胺、磷脂酰膽堿和磷脂酰甘油,結(jié)合生理生化特征及遺傳學(xué)特征分析,菌株0448T確定為紅桿菌科中的新屬新種,命名為沉積物大洋桿菌(Oceanibium sediminis gen.nov.,sp.nov.);菌株F02T細(xì)胞呈革蘭氏陰性、嚴(yán)格需氧菌,具有運(yùn)動(dòng)性和氧化酶與過氧化氫酶活性,主要的呼吸醌是Q-8,主要的脂肪酸成分是C18:11ω7c、C16:1ω7c、C15:o和C18:1ω9c,主要的極性脂組成有磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和一種未被鑒定的磷脂,結(jié)合生理生化特征及遺傳學(xué)特征分析,確定為--變形菌綱中的新屬新種,命名為沉積物海棲桿菌(Maribactrumsediminisgen.nov.,sp.nov.);菌株RQJ05T革蘭氏染色陰性、好氧型細(xì)菌,有運(yùn)動(dòng)性,氧化酶呈陽性但過氧化氫酶呈陰性,主要的呼吸醌是Q-8,主要的脂肪酸成分是Summed Feature 3(C16:1ω71 and/or C16:1ω6c)、C16:0 和 Summed Feature 8(C18:1 ω7c and/or C18:1ω6c),極性脂種類主要有磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油和磷脂,結(jié)合生理生化特征及遺傳學(xué)特征分析,確定為交替單胞菌科中的新屬新種,命名為嗜瓊膠藻生菌(Algilactibacter agarilytica gen.nov.sp.nov.)。對(duì)瓊膠降解菌QM202T和RQJ05.T進(jìn)行基因組測序,對(duì)瓊膠酶基因進(jìn)行預(yù)測分析,共預(yù)測出28條潛在瓊膠酶基因,其中菌株QM202T中有4條,RQJ05T中有24條。對(duì)預(yù)測得到的所有瓊膠酶基因進(jìn)行外源表達(dá),對(duì)表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行酶活檢測,結(jié)果顯示共有11個(gè)瓊膠酶具有瓊膠降解活性,其中菌株QM202T中有4個(gè),RQJ05T中有7個(gè)。然后用親和層析的方式成功純化出重組瓊膠酶QM202-1與RQJ05-21。最后對(duì)純化后的重組瓊膠酶的結(jié)構(gòu)與酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行探究,結(jié)果顯示,瓊膠酶QM202-1屬于GH50家族,最適反應(yīng)溫度為30-40℃,最適反應(yīng)pH為7.0,DTT能大幅度增加酶活,降解產(chǎn)物為新瓊四糖,比酶活為34.7U/mg。瓊膠酶RQJ05-21屬于GH16家族,最適反應(yīng)溫度為50℃,最適反應(yīng)pH為8.0,Co2+、Fe2+、DTT能大幅度增加酶活,具有瓊膠降解能力的同時(shí)也有一定程度降解淀粉、卡拉膠、海藻酸鈉的能力,降解瓊膠時(shí)比酶活為66.5 U/mg且產(chǎn)物為新瓊四糖與新瓊六糖。本研究分離并得到多株瓊膠降解菌與多條瓊膠酶蛋白,為實(shí)現(xiàn)瓊膠多糖的綠色、高效的生物降解提供了有力的工具。
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q93
【圖文】:

瓊膠酶,降解模式


模式和產(chǎn)物的不同,將瓊膠酶分類為a-瓊膠酶(E.C.3.2.1.158)和(3-瓊膠酶逡逑(E.C.3.2N81),a-瓊膠酶可以將瓊膠中的a-1,3糖苷鍵斷裂,而p-瓊膠酶可逡逑以識(shí)別瓊膠中的P-1,4糖苷鍵并使其斷裂,如圖1-2所示叩】。其中P-瓊膠酶及逡逑其作用形成的低聚糖吸引了相當(dāng)多的行業(yè)。在藻類、海水和海洋沉積物等海洋環(huán)逡逑境中有著豐富的瓊膠酶基因資源,將這些基因轉(zhuǎn)入合適的表達(dá)宿主所產(chǎn)生的重組逡逑瓊膠酶在惡劣環(huán)境中的催化效率和穩(wěn)定性得到了提高,因此適用于大規(guī)模的工業(yè)逡逑生產(chǎn)。逡逑Chemical邋liquefaction邋or邐,逡逑Enzymatic邋liquefaction邋bya-agarase邐Enzymatic邋liquefaction邋by邋p-agarase逡逑Agarose邐Agarose逡逑i邐i逡逑O^K>#邋CMKMX>#邐(SKMXXD^逡逑Agarooligosaccharides邐Neoagarooligosaccharides逡逑Cleavage邋site邋Terminal邋end邐Monomeric邋sugar逡逑|邋a-1,3-linkage邋0邋Non-reducing邋end邋Galactose逡逑|邐卩-1.4-linkage邐?邋Reducing邋end邋(^)邐AHG逡逑圖1-2瓊膠酶的降解模式圖M逡逑Fig邋1-2邋Degradation邋model邋of邋agarase逡逑1.2.2瓊膠酶的分類逡逑目前

瓊膠酶,多糖,瓊脂酶


子多糖直接降解為低聚糖聚合物,然后逐漸降解;外切型瓊膠酶的底物結(jié)合裂縫逡逑相對(duì)較小,或者是是以桶狀結(jié)構(gòu)呈現(xiàn),只能作用于瓊膠多糖的尾端使其斷裂,逐逡逑步降解,產(chǎn)物較為單一[53];谧饔媚J胶铜傊复呋瘷C(jī)制的分類描述如圖1-3逡逑所示。逡逑■苷水解酵逡逑作用方式邐o<化機(jī)制逡逑I邐邋f邐?逡逑一邋T?邐Processivc逡逑(^GH50^)邐I邐U逡逑T邐|內(nèi)切酶逡逑j ̄ ̄r邐T邋;r逡逑(^7^)逡逑圖1-3瓊膠酶所在家族的分類逡逑Fig邋1-3邋Classifcation邋of邋GH邋families邋of邋agarases逡逑4逡逑

菌體形態(tài),菌體形態(tài),菌落,菌株


面沒有觀察到鞭毛,符合沒有運(yùn)動(dòng)性這一特性。菌株04481'在MA培養(yǎng)基上在逡逑33邋°C培養(yǎng)2天后,平板上形成微凸、表面光滑、米黃色、直徑大約0.8邋mm左逡逑右的圓形菌落。菌落形態(tài)與菌體形態(tài)如圖3-1所示。該菌株除在本實(shí)驗(yàn)室保藏之逡逑夕卜,新鮮菌體送至MCCC與KCTC成功保藏,保藏編號(hào)分別為MCCC邋1H00233逡逑與邋KCTC邋62076。逡逑i逡逑i邋md哪逡逑11邐NIHHN)邋?邐.INI逡逑圖3-1菌株0448T的菌落和菌體形態(tài)逡逑Fig.邋3-1邋The邋clony邋and邋cell邋morphyology邋of邋strain邋04481逡逑23逡逑

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