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煙臺(tái)近海周叢類(lèi)纖毛蟲(chóng)物種多樣性及系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-22 20:44
【摘要】:纖毛蟲(chóng)隸屬于原生生物界,纖毛門(mén),是形態(tài)最復(fù)雜和最高等的單細(xì)胞真核生物,在所處微食物網(wǎng)的物質(zhì)循環(huán)和能量傳遞中起重要的樞紐性作用。作為一種良好的模式生物,纖毛蟲(chóng)被廣泛應(yīng)用于細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)和分子系統(tǒng)學(xué)等科學(xué)領(lǐng)域當(dāng)中,且在生物的起源與進(jìn)化等方向上具有獨(dú)特的研究地位。本研究以煙臺(tái)近海周叢類(lèi)纖毛蟲(chóng)為研究對(duì)象,對(duì)煙臺(tái)近海的20種周叢類(lèi)纖毛蟲(chóng)(涉及3綱8目16屬)進(jìn)行了傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定,同時(shí)也對(duì)相關(guān)類(lèi)群進(jìn)行了分子系統(tǒng)學(xué)的研究。主要研究成果如下:1.發(fā)現(xiàn)并建立了一個(gè)新種—掌狀聚縮蟲(chóng)Zoothamnium palmphlatum n.sp.,形態(tài)學(xué)描述如下:群體交替分支,側(cè)枝發(fā)達(dá),高度可達(dá)1.3 mm。蟲(chóng)體大小71~86×33~49μm,雙層口圍緣。單一伸縮泡位于蟲(chóng)體頂端。大核“C”形,橫位。口圍緣到反口纖毛環(huán)的銀線數(shù)目為74~102,反口纖毛環(huán)到帚胚的銀線數(shù)目為35~45;口區(qū)小膜3由兩條平行的動(dòng)基列組成。本研究將這一新種與其形態(tài)學(xué)相似種和序列相似度最高種的二級(jí)結(jié)構(gòu)的各區(qū)段進(jìn)行對(duì)比研究,發(fā)現(xiàn):(1)序列相似度和二級(jí)結(jié)構(gòu)相似度沒(méi)有必然聯(lián)系,即序列相似度越高并不意味著二級(jí)結(jié)構(gòu)越相似,反之亦然;(2)18S rDNA二級(jí)結(jié)構(gòu)可能為分析聚縮蟲(chóng)屬系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系提供依據(jù),進(jìn)一步說(shuō),某些呈現(xiàn)種內(nèi)物種特異性的二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)段,在一定程度上有助于物種區(qū)分。2.結(jié)合系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),分析聚縮蟲(chóng)三大類(lèi)群、累枝蟲(chóng)兩大類(lèi)群、鞘居蟲(chóng)、蓋蟲(chóng)等二級(jí)結(jié)構(gòu)在種間和種內(nèi)的差異關(guān)系,得到如下結(jié)論:(1)聚縮蟲(chóng)的三大類(lèi)群(聚縮蟲(chóng)clade I、聚縮蟲(chóng)clade II和聚縮蟲(chóng)clade III)可通過(guò)H10區(qū)、H25區(qū)、H47區(qū)加以區(qū)分;(2)累枝蟲(chóng)兩大類(lèi)群(累枝蟲(chóng)clade I和累枝蟲(chóng)clade II)可通過(guò)E10_1區(qū)、H10區(qū)、H12區(qū)、H17區(qū)、H37區(qū)加以區(qū)分;(3)聚縮蟲(chóng)clade III和累枝蟲(chóng)clade II可通過(guò)E23_1-2區(qū)和H44區(qū)加以區(qū)分;(4)鞘居蟲(chóng)和聚縮蟲(chóng)三大類(lèi)群、累枝蟲(chóng)clade II可通過(guò)E10_1區(qū)加以區(qū)分;(5)累枝蟲(chóng)clade I、蓋蟲(chóng)科和上述其它類(lèi)群可通過(guò)H10區(qū)加以區(qū)分。本研究結(jié)合系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)上的各物種的系統(tǒng)發(fā)生位置,對(duì)緣毛類(lèi)纖毛蟲(chóng)中的重要類(lèi)群的可區(qū)分二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)段做了匯總,研究發(fā)現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)段也是進(jìn)行緣毛類(lèi)纖毛蟲(chóng)類(lèi)群區(qū)分的良好標(biāo)記;同時(shí),首次用現(xiàn)代分類(lèi)學(xué)方法完整研究并報(bào)道了一種聚縮蟲(chóng)屬纖毛蟲(chóng)新種,增加了該屬的物種多樣性及分子數(shù)據(jù)。
【圖文】:

路線圖,實(shí)驗(yàn)技術(shù),路線圖


2.材料與方法2 材料與方法2.1 樣品采集結(jié)合纖毛蟲(chóng)的生活習(xí)性特點(diǎn)及煙臺(tái)氣候特征,確定樣品的采集時(shí)間為每年的 3月中下旬到 10 月上旬,采集地為逛蕩河口、辛安河口、海參養(yǎng)殖場(chǎng);采樣方法為原位采樣法和掛載玻片法。依據(jù)采集到的樣品種類(lèi)特征,用相對(duì)應(yīng)的方法進(jìn)行分離、對(duì)于實(shí)驗(yàn)條件下可培養(yǎng)的種類(lèi)可進(jìn)行純培養(yǎng),對(duì)于不可培養(yǎng)的種類(lèi)則直接進(jìn)行相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)操作。2.2 活體觀察與染色制片活體觀察采用 Olympus DP72 顯微鏡,放大倍數(shù)為 40~1000×;蛋白銀染色采用Wilbert (1975)蛋白銀法,技術(shù)路線如下圖所示。

模型圖,二級(jí)結(jié)構(gòu),模型圖,四膜蟲(chóng)


6圖 2.2 SSU rRNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)模型圖Fig. 2.2 SSU rRNA scoondary structure model2.4.2 各區(qū)段二級(jí)結(jié)構(gòu)保守序列的篩選纖毛蟲(chóng)各區(qū)段二級(jí)結(jié)構(gòu)劃分參照四膜蟲(chóng)(Tetrahymenna canadensis),,其序列號(hào)為M26359。將測(cè)序得到的纖毛蟲(chóng)及其相關(guān)種類(lèi)的序列與四膜蟲(chóng)的序列用 Bioedit 軟件進(jìn)
【學(xué)位授予單位】:煙臺(tái)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:Q958.8

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