利用方差異質(zhì)性全基因組關聯(lián)分析解析玉米籽粒油份合成的遺傳機理
發(fā)布時間:2024-01-25 17:05
玉米油份是重要的品質(zhì)性狀,富含多種維生素、礦物質(zhì)及不飽和脂肪酸,具有極高的營養(yǎng)價值,解析油份合成的遺傳機理對提高玉米籽粒油份含量和品質(zhì)具有重要意義。傳統(tǒng)的連鎖和關聯(lián)分析方法側(cè)重于挖掘與油份性狀平均值差異關聯(lián)的遺傳位點,而研究表明方差異質(zhì)性也是影響數(shù)量性狀表型變異的重要因素。本研究以368份具有廣泛表型和基因型變異的玉米自交系為材料,對21個油份相關性狀進行方差異質(zhì)性全基因組關聯(lián)分析(variance-heterogeneity geno me-wide association study,v GWAS),挖掘控制油份性狀方差異質(zhì)性的遺傳位點,解析玉米籽粒油份合成和累積的分子基礎,闡述方差異質(zhì)性形成的遺傳機制,驗證基因與基因的互作模式,最終為玉米油份品質(zhì)性狀的選擇育種提供基因資源和理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.基于兩套基因型檢測平臺檢測到的最小等位基因頻率(minor allele frequenc y,MAF)大于0.05的56萬個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphi sm,SNP)標記,利用Levene’s檢驗對21個油份相關性狀中進行v GWA...
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學位級別】:碩士
本文編號:3885215
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圖1.1兩個不同的數(shù)量性狀的分布的例子(EkWE,etal.2018)
圖3.179個獨立位點在染色體上的分布
圖3.2vGWAS和GWAS中檢測到的位點的P值分布與解釋表型方差比例的相關性
圖3.3五個位點與對應油份相關性狀的小提琴圖
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