小麥赤霉病菌Rab互作溶酶體蛋白對DON毒素生物合成的影響
【學位授予單位】:河南工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S435.121.45;TQ455;TS201.6
【圖文】:
2 材料與方法 實驗材料.1 供試菌株禾谷鐮刀菌野生型(PH-1)菌株由許金榮博士贈予。大腸桿菌菌株 DH5α, AH109 由福建農(nóng)林大學功能基因組學研究中心王宗華研究員惠贈。.2 致病性鑒定材料小麥種子(鄭麥矮抗 58 號)從河南省農(nóng)業(yè)科學院購買,西紅柿由鄭州市高小麥麥穗在鄭州高新區(qū)采摘。.3 質(zhì)粒載體pKNT-RP27-GFP、pGBKT7、pGADT7 載體,由福建農(nóng)林大學功能基因組學贈,本實驗室保存,質(zhì)粒圖譜如圖 1 所示。
名為 FgRILP,其 ORF 全長為 3742bp,cDNA 為 3579bp,編碼含有 1192 個氨基酸的蛋白。利用 NCBI 上的 CDD 功能對 FgRILP 蛋白進行保守域分析(圖 2),發(fā)現(xiàn) FgRILP具有多個保守域,在 175-273aa 區(qū)間有一個 NST1 保守域,NST1 屬鹽耐受調(diào)節(jié)因子,推測該基因在鹽脅迫下具有調(diào)控作用;在 568-691aa 區(qū)間有一個 TolA_full 的保守域結(jié)構(gòu),TolA 將自身的內(nèi)膜復合體與 TolQ 和 TolR 偶聯(lián)到 TolB 和 Oprl 的外膜復合體(又稱 PAl),Tol-PAl 復合物是維持外膜完整性所必需的,推測該保守域與物質(zhì)轉(zhuǎn)運和致病性相關(guān);在 577-807aa 區(qū)間有一個 MIP-T3(Microtubule-binding protein)蛋白,其 N末端區(qū)域是微管結(jié)合結(jié)構(gòu)域并且是保守的,C 末端 100 個殘基也很保守,構(gòu)成了與TRAF3 結(jié)合的卷曲螺旋區(qū)。在 709-1018aa 區(qū)間存在 Atrophin-1 蛋白保守域,該蛋白在動物中是進行性神經(jīng)退行性疾病基因(Dentatorubral-pallidoluysian atrophy gene-DRPLA)的蛋白產(chǎn)物,其中 CAG(谷氨酰胺)重復序列與致病性相關(guān),該保守域在真菌中的功能未知。
運用 softberry 在線軟件中的 protein localization 分析顯示,該基因編碼的蛋白定位在細胞質(zhì)(圖 4)。XP 003042199.1 hypothetical protein NECHADRAFT 81283 Nectria haematococca mpVI 77-13-4KKP05144.1 hypothetical protein THAR02 02739 Trichoderma harzianumXP 013947360.1 hypothetical protein TRIATDRAFT 171742 partial Trichoderma atroviride IMI 20KFG80470.1 stress response protein nst1 Metarhizium anisopliaePOR33676.1 Stress response protein NST1 Tolypocladium paradoxumPNY25131.1 Stress response protein NST1 Tolypocladium capitatum100100870.05注:禾谷鐮刀菌(Fusarium graminearum)、黃色鐮孢菌(Fusarium culmorum)、長柄鐮刀菌(Fusariulangsethiae)、黎孢鐮刀菌(Fusarium pose)、燕麥鐮孢菌(Fusarium avenaceum)、尖孢鐮刀菌(Fusariuoxysporum)、血鏈球菌(Nectria haematococca)、串珠鐮刀菌(Fusariμm verticillioides)、層生鐮刀菌(Fusariuproliferatum)、水稻惡苗病菌(Fusarium fujikμroi)、哈茨木霉(Trichoderma harzianum)、綠僵菌(Metarhiziuanisopliae)、綠色木霉(Trichoderma viride)、頭狀蟲草(Tolypocladium capitatum)、大團囊蟲草(Tolypocladiuparadoxum)。圖 3 FgRILP 系統(tǒng)發(fā)育樹FIg. 3 Phylogenetic tree of FgRILP
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