當(dāng)前果桑生產(chǎn)上不同品種種源關(guān)系較為混亂,傳統(tǒng)的技術(shù)方法難以進(jìn)行準(zhǔn)確區(qū)分。本研究利用�？艵ST數(shù)據(jù)庫信息開發(fā)引物,了解SSR分布特點,采用Popgene軟件分析SSR位點的多態(tài)性,且利用基于EST-SSR分子標(biāo)記人工繪制植物品種鑒別圖（MCID）法對33個果桑種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明:1.在2350條非冗余序列中,總共搜查到965個SSR位點,分布頻率為38.14%。在桑樹EST-SSR中,二、三核苷酸重復(fù)類型占主導(dǎo)地位。其中二核苷酸重復(fù)類型的SSR最多,為635個,占全部SSR的65.8%,出現(xiàn)頻率為25.1%;其次是三核苷酸重復(fù)類型,共有309個,占全部SSR的32.02%,出現(xiàn)頻率為12.21%;四核苷酸重復(fù)類型共21個,出現(xiàn)頻率0.83%,占SSR總數(shù)的2.18%。2.從中選取30對并結(jié)合文獻(xiàn)報道的39對EST-SSR引物,合成69對候選引物,篩選出15對多態(tài)性好的引物,共擴(kuò)增出166個位點,其中多態(tài)性位點123個,多態(tài)性比率為74.10%,每個引物擴(kuò)增出的條帶在6¹9條之間,平均每對引物擴(kuò)增出的條帶為11.1條,多態(tài)性豐富。3.檢測了果桑SSR... 

【文章來源】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：47 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

果桑DNA的瓊脂糖凝膠電泳圖譜

1圖 3-2 引物 E3、E5 在 33 個果桑品種間的擴(kuò)增圖譜Figure 3-2Amplication profiles of 33 mulberry variteis with primers E3 and E51.白玉王；2.白果桑；3.白龍桑；4.朝金；5.蛋白桑；6.大 10 ；7.觀賞果桑；8.印度桑；9.黑珍珠；10.會澤 7 號；11.紅瑪瑙；12.紅果桑 2；13.九紋龍桑；14.龍桑；15.遼 10 號；16.孟簡；17.四季果桑；18.石棉 24 號；19.石棉 3號；20.勝寒；21.臺灣四季果桑；22.臺 14-1；23.蛋白桑 2 ；24.葉用桑 1；25.葉用桑 2 ；26. 遼桑育 171 號；27意大利桑；28.云南長果桑 29.中桑 5801； 30.10 ；31.長果桑 32.蛋白桑 3 ；33.紅果桑 1；M: Marker本試驗總共采集到 37 份果桑材料，其中重名品種有四個各 2 份材料，分別為白玉王、長果桑、中桑 5801 和葉用桑 1。利用引物 E3 驗證四個品種，這兩對引物分別可以把這四個不確定的品種與確定名稱的品種區(qū)分開，分別是白玉王、葉用桑 1、長果桑、中桑 5801（圖 3-3）。

圖 3-3 引物 E3 在 8 個同名材料間的擴(kuò)增圖譜e 3-3Amplication profiles of primer E3 among 8 mulberry variteis；2.白玉王（重名）；3.葉用桑 1；4.葉用桑（重名）5.長果桑；68.中桑 5801（重名）傳多樣性分析e 軟件對 SSR 位點進(jìn)行遺傳多樣性研究（表 3 33 個果桑材料中擴(kuò)增出的譜帶清晰、多態(tài)性好基因（Na），平均每個位點擴(kuò)增出 8 個等位基平均值為 0.874；He 的變化范圍是 0.452-0.926均出現(xiàn)在位點 P61，其次為 E3，最小值出現(xiàn) 可知，等位基因在供試材料中分布相對均勻；性較高。IC 值是衡量 SSR 位點多態(tài)性的一個重要指標(biāo)5<PIC<0.5 時為中度多態(tài)性位點，當(dāng) PIC>0.5，PIC 的范圍為 0.389-0.913，其中引物 P23 的

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]桑樹EST-SSR引物開發(fā)[J]. 高麗霞.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2013(08)
[2]果桑不同品種表型性狀研究[J]. 張瑞娟,李吉鵬,于天水.  科技信息. 2012(30)
[3]利用基于DNA標(biāo)記的人工繪制植物品種鑒別圖（MCID）法快速鑒定歐亞葡萄品種[J]. 張曉瑩,張彥,宋長年,劉崇懷,房經(jīng)貴,上官凌飛.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2012(06)
[4]SNP分子標(biāo)記的研究及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 唐立群,肖層林,王偉平.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2012(12)
[5]深水稻品種赤禾紋枯病抗性QTLs定位[J]. 陸崗,李丹婷,農(nóng)保選,夏秀忠,梁耀懋,黎坤愛.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2009(06)
[6]湖南省10個現(xiàn)行栽培桑樹品種的AFLP指紋圖譜分析[J]. 黃仁志,顏新培,李健,張學(xué)文.  蠶業(yè)科學(xué). 2009(04)
[7]AFLP與SSR標(biāo)記及其在油菜研究中的應(yīng)用[J]. 李麗,黃先群,Chokchai Wannup,黃團(tuán).  貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(11)
[8]分子標(biāo)記技術(shù)及在水稻遺傳研究中的應(yīng)用[J]. 呂瑞玲,吳小鳳,劉敏超.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(04)
[9]植物EST-SSR技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 姜春芽,廖嬌,徐小彪,辜青青,劉善軍,陳金印.  分子植物育種. 2009(01)
[10]SNP的研究進(jìn)展及其在家畜育種中的應(yīng)用[J]. 石磊,岳文斌.  畜禽業(yè). 2007(03)

博士論文
[1]番茄遺傳多樣性及幾個重要農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王濤.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]柑橘高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及落葉性狀的QTL定位[D]. 劉升銳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]小麥—長穗偃麥草雜種后代的分子細(xì)胞遺傳學(xué)分析及種質(zhì)材料的篩選鑒定[D]. 何方.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]梅花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和表型性狀QTLs分析[D]. 孫麗丹.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[5]馬鈴薯雜交種ISSR鑒定與高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)株系選育研究[D]. 甘霖.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]大豆對疫病的抗性評價、抗病基因挖掘及候選基因分析[D]. 張吉清.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[7]長白山牛皮杜鵑的遺傳多樣性與分子親緣地理學(xué)研究[D]. 劉雁飛.吉林大學(xué) 2013
[8]作物品種分子標(biāo)記鑒定及指紋圖譜構(gòu)建研究[D]. 朱巖芳.浙江大學(xué) 2013
[9]基于分子標(biāo)記和DNA條形碼的大別山特產(chǎn)柿種質(zhì)的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)[D]. 袁錄霞.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[10]中國核桃品種的遺傳多樣性研究[D]. 馬慶國.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2012

碩士論文
[1]基于EST-SSR的紫斑牡丹品種遺傳多樣性研究[D]. 安宗燕.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]15個果桑品種的EST-SSR和SRAP遺傳多樣性分析[D]. 延娜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]甜瓜主栽品種指紋圖譜庫的構(gòu)建及遺傳多樣性分析[D]. 李瑞峰.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]向日葵SRAP分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 于志賢.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]西（籽）瓜雜交種種子純度鑒定及指紋圖譜構(gòu)建的研究[D]. 張高原.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]茄子種質(zhì)資源遺傳多樣性SSR和SRAP分析[D]. 管志坤.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]荷花種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP和ISSR研究[D]. 孫祖霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[8]果桑種質(zhì)資源的研究[D]. 陳藝.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
[9]基于AFLP標(biāo)記的鹽膚木種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 段立柱.山西大學(xué) 2010
[10]厚樸遺傳多樣性和遺傳關(guān)系研究及ITS序列分析[D]. 于華會.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2010



本文編號：3102623