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果桑SSR分子標記開發(fā)與應用

發(fā)布時間:2021-03-27 01:34
  當前果桑生產(chǎn)上不同品種種源關系較為混亂,傳統(tǒng)的技術方法難以進行準確區(qū)分。本研究利用?艵ST數(shù)據(jù)庫信息開發(fā)引物,了解SSR分布特點,采用Popgene軟件分析SSR位點的多態(tài)性,且利用基于EST-SSR分子標記人工繪制植物品種鑒別圖(MCID)法對33個果桑種質資源進行遺傳多樣性分析,結果表明:1.在2350條非冗余序列中,總共搜查到965個SSR位點,分布頻率為38.14%。在桑樹EST-SSR中,二、三核苷酸重復類型占主導地位。其中二核苷酸重復類型的SSR最多,為635個,占全部SSR的65.8%,出現(xiàn)頻率為25.1%;其次是三核苷酸重復類型,共有309個,占全部SSR的32.02%,出現(xiàn)頻率為12.21%;四核苷酸重復類型共21個,出現(xiàn)頻率0.83%,占SSR總數(shù)的2.18%。2.從中選取30對并結合文獻報道的39對EST-SSR引物,合成69對候選引物,篩選出15對多態(tài)性好的引物,共擴增出166個位點,其中多態(tài)性位點123個,多態(tài)性比率為74.10%,每個引物擴增出的條帶在619條之間,平均每對引物擴增出的條帶為11.1條,多態(tài)性豐富。3.檢測了果桑SSR... 

【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省

【文章頁數(shù)】:47 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

果桑SSR分子標記開發(fā)與應用


果桑DNA的瓊脂糖凝膠電泳圖譜

擴增圖譜,引物,長果桑,葉用


1圖 3-2 引物 E3、E5 在 33 個果桑品種間的擴增圖譜Figure 3-2Amplication profiles of 33 mulberry variteis with primers E3 and E51.白玉王;2.白果桑;3.白龍桑;4.朝金;5.蛋白桑;6.大 10 ;7.觀賞果桑;8.印度桑;9.黑珍珠;10.會澤 7 號;11.紅瑪瑙;12.紅果桑 2;13.九紋龍桑;14.龍桑;15.遼 10 號;16.孟簡;17.四季果桑;18.石棉 24 號;19.石棉 3號;20.勝寒;21.臺灣四季果桑;22.臺 14-1;23.蛋白桑 2 ;24.葉用桑 1;25.葉用桑 2 ;26. 遼桑育 171 號;27意大利桑;28.云南長果桑 29.中桑 5801; 30.10 ;31.長果桑 32.蛋白桑 3 ;33.紅果桑 1;M: Marker本試驗總共采集到 37 份果桑材料,其中重名品種有四個各 2 份材料,分別為白玉王、長果桑、中桑 5801 和葉用桑 1。利用引物 E3 驗證四個品種,這兩對引物分別可以把這四個不確定的品種與確定名稱的品種區(qū)分開,分別是白玉王、葉用桑 1、長果桑、中桑 5801(圖 3-3)。

擴增圖譜,引物,葉用,位點


圖 3-3 引物 E3 在 8 個同名材料間的擴增圖譜e 3-3Amplication profiles of primer E3 among 8 mulberry variteis;2.白玉王(重名);3.葉用桑 1;4.葉用桑(重名)5.長果桑;68.中桑 5801(重名)傳多樣性分析e 軟件對 SSR 位點進行遺傳多樣性研究(表 3 33 個果桑材料中擴增出的譜帶清晰、多態(tài)性好基因(Na),平均每個位點擴增出 8 個等位基平均值為 0.874;He 的變化范圍是 0.452-0.926均出現(xiàn)在位點 P61,其次為 E3,最小值出現(xiàn) 可知,等位基因在供試材料中分布相對均勻;性較高。IC 值是衡量 SSR 位點多態(tài)性的一個重要指標5<PIC<0.5 時為中度多態(tài)性位點,當 PIC>0.5,PIC 的范圍為 0.389-0.913,其中引物 P23 的

【參考文獻】:
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本文編號:3102623

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