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基于橄欖果實轉錄組的多酚代謝相關差異基因表達分析

發(fā)布時間:2021-03-09 02:22
  橄欖是中國南方的一種具有重要經濟價值和藥理作用的亞熱帶果樹,然而不同品種之間的多酚含量和口感風味差異較大,且缺少基因組和轉錄組水平等遺傳信息,嚴重阻礙了優(yōu)質橄欖品種的選育以及果實品質特征的研究,比如多酚類物質的代謝調控。本研究以普通‘長營’品種和它的芽變品種‘清欖’作為實驗材料,測定其果實多酚和黃酮含量,并首次利用Illumina高通量轉錄組測序(RNA-seq)技術來篩選兩種橄欖品種多酚代謝過程中差異表達的基因。主要研究結果如下:1.采用紫外分光光度法測定‘長營’和‘清欖’果實不同發(fā)育階段多酚和黃酮含量。結果表明,從花后40d開始,‘長營’和‘清欖’果實的多酚含量隨著生長而逐漸升高,到130d左右達到最高峰,隨后開始降低;‘長營’的黃酮含量變化趨勢也是如此,雖然‘清欖’的黃酮含量在70d-100d階段稍微下降,但是總體含量依然呈上升趨勢,均到130d左右達到最高峰,然后開始下降,且‘長營’果實的多酚和黃酮含量約是‘清欖’的2倍。2.針對橄欖果實富含酚類、多糖、蛋白質等次生代謝物的特點,本試驗采用了百泰克總RNA抽提試劑盒法,Trizol法和CTAB法三種方法對橄欖果實總RNA進行提取... 

【文章來源】:福建農林大學福建省

【文章頁數】:86 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
縮略詞
摘要
Abstract
第一章 前言
    1 研究背景
    2 植物多酚代謝途徑相關研究進展
    3 基因測序技術研究進展
        3.1 第一代測序技術
        3.2 第二代測序技術
        3.3 第三代測序技術
        3.4 第二代測序技術的轉錄組研究
            3.4.1 RNA-seq技術的原理
            3.4.2 RNA-seq技術的標準分析流程
            3.4.3 RNA-seq技術的優(yōu)勢
    4 本研究的目的和意義
第二章 橄欖果實多酚和黃酮含量的測定
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器與試劑
        1.3 方法
            1.3.1 多酚含量測定
            1.3.2 黃酮含量測定
    2 結果與分析
        2.1 多酚含量
        2.2 黃酮含量
第三章 橄欖多酚類物質代謝途徑關鍵基因的篩選
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器與試劑
        1.3 方法
            1.3.1 橄欖果實總RNA提取方法的比較
            1.3.2 cDNA文庫構建
            1.3.3 De novo組裝和注釋
            1.3.4 差異表達基因的篩選
    2 結果與分析
        2.1 橄欖果實總RNA質量分析
            2.1.1 凝膠電泳分析
            2.1.2 紫外分光光度計分析
        2.2 建庫及De novo組裝結果
        2.3 功能注釋
        2.4 功能分類及代謝通路富集分析
            2.4.1 KOG注釋
            2.4.2 GO注釋
            2.4.3 KEGG代謝通路富集分析
        2.5 候選差異表達基因的篩選與鑒定
            2.5.1 主成分分析(PCA)
            2.5.2 差異表達基因的篩選
            2.5.3 多酚類物質代謝相關基因的鑒定
第四章 橄欖多酚類物質代謝關鍵基因熒光定量PCR驗證
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器和試劑
        1.3 方法
            1.3.1 橄欖果實總RNA的提取
            1.3.2 cDNA的合成
            1.3.3 熒光定量PCR
    2 結果與分析
第五章 討論與結論
    1 討結
    2 結論
參考文獻
附錄
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]橄欖果實過氧化物酶和多酚氧化酶酶學特性研究[J]. 謝倩,陳清西,王威,葉玲,黃麗娜,袁亞芳.  熱帶作物學報. 2013(08)
[2]橄欖鮮食新品種“清欖1號”選育初報[J]. 許長同,肖振林,朱宗良,楊文榮.  中國南方果樹. 2013(03)
[3]金絲桃苷藥理作用研究進展[J]. 林萍,易宏偉,張斐.  中國現代中藥. 2012(10)
[4]MeJA處理對枇杷果實采后抗氧化活性的影響[J]. 陳偉,金文淵,楊震峰,曹士峰.  中國食品學報. 2012(01)
[5]金絲桃苷藥理作用研究進展[J]. 黃凱,楊新波,黃正明.  醫(yī)藥導報. 2009(08)
[6]橄欖果實膳食纖維含量及動態(tài)變化研究[J]. 歐高政,陳清西.  福建農業(yè)學報. 2009(01)
[7]淺談橄欖栽培與管理技術[J]. 陳志松.  現代園藝. 2009(02)
[8]植物次生代謝途徑的遺傳修飾研究進展[J]. 劉蓉蓉.  生物技術通報. 2008(06)
[9]鞣花酸及其衍生物研究進展[J]. 丁運生,孫小虎,李有桂,朱凱.  合肥工業(yè)大學學報(自然科學版). 2008(11)
[10]黃酮類化合物生理活性及合成研究進展[J]. 延璽,劉會青,鄒永青,任占華.  有機化學. 2008(09)

博士論文
[1]橄欖酚類化合物的分離純化和結構研究[D]. 何志勇.江南大學 2007

碩士論文
[1]安吉白茶階段性返白期間酚類物質代謝關鍵酶基因表達的動態(tài)變化研究[D]. 熊立瑰.湖南農業(yè)大學 2012
[2]橄欖中多酚類物質的分離純化及功能性研究[D]. 陳崗.西南大學 2009
[3]橄欖葉總黃酮代謝和提取工藝優(yōu)化及其抗氧化作用[D]. 林烽.福建農林大學 2008



本文編號:3072081

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