利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)分析了網(wǎng)箱養(yǎng)殖花鱸(Lateolabrax japonicus)和日本黃姑魚(Nibea japonica)腸道細(xì)菌組成,同時(shí)分析了配合飼料和網(wǎng)箱中海水的細(xì)菌組成,以確定魚類腸道細(xì)菌與環(huán)境之間的關(guān)系�；|投喂冰鮮魚,日本黃姑魚投喂配合飼料。從花鱸和日本黃姑魚前腸、中腸、后腸、配合飼料和網(wǎng)箱內(nèi)海水中共鑒定出886個(gè)細(xì)菌OTU (operational taxonomic unit),分別隸屬8個(gè)門、40個(gè)屬,其中從花鱸和日本黃姑魚腸道中鑒定出的550個(gè)細(xì)菌OTUs分別隸屬5個(gè)門、15個(gè)屬。在門的水平上,厚壁菌門(Firmicutes)在兩種魚類腸道中均占優(yōu)勢(shì);在屬的水平上,梭菌屬(Clostridium_sensu_stricto₁)在花鱸腸道中占優(yōu)勢(shì),芽孢桿菌屬(Bacillus)在日本黃姑魚腸道中占優(yōu)勢(shì)。花鱸與日本黃姑魚之間腸道細(xì)菌的相似性高于日本黃姑魚腸道細(xì)菌與配合飼料中細(xì)菌的相似性,也高于花鱸或日本黃姑魚腸道細(xì)菌與其養(yǎng)殖網(wǎng)箱內(nèi)海水中細(xì)菌的相似性。日本黃姑魚腸道與配合飼料中共...

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 魚類腸道、飼料和海水的采樣
    1.2 細(xì)菌基因組DNA的提取
    1.3 PCR擴(kuò)增和16S rDNA測(cè)序
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 魚類腸道、配合飼料和海水中的細(xì)菌組成
    2.2 魚類腸道、配合飼料和海水中的細(xì)菌多樣性
    2.3 魚類腸道細(xì)菌的空間異質(zhì)性
    2.4 魚類腸道、配合飼料和養(yǎng)殖網(wǎng)箱海水中細(xì)菌之間的關(guān)系
3 討論
4 結(jié)論



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