腸道菌群在宿主營(yíng)養(yǎng)吸收、免疫和發(fā)育等方面具有重要作用,是當(dāng)前的研究熱點(diǎn)。馬氏珠母貝是重要的養(yǎng)殖品種,用于培育海水珍珠,具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,目前尚未有關(guān)于馬氏珠母貝腸道菌群的研究報(bào)道。本論文以海區(qū)養(yǎng)殖和人工飼料養(yǎng)殖的馬氏珠母貝為研究對(duì)象,首先分析了自然海區(qū)養(yǎng)殖的馬氏珠母貝腸道及水體環(huán)境中的菌群結(jié)構(gòu);然后比較了不同配方微膠囊飼料養(yǎng)殖的馬氏珠母貝生長(zhǎng)、生理指標(biāo)以及腸道菌群結(jié)構(gòu)差異,最后將各期實(shí)驗(yàn)獲得的馬氏珠母貝腸道菌群數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了聯(lián)合分析。結(jié)果顯示馬氏珠母貝腸道菌群結(jié)構(gòu)可塑性較強(qiáng),菌群組成和相對(duì)豐度受到養(yǎng)殖方式、餌料種類的影響較大,同時(shí),也存在相對(duì)穩(wěn)定的核心菌群。本研究首次從多角度認(rèn)識(shí)馬氏珠母貝腸道菌群的結(jié)構(gòu)組成和演替規(guī)律,為開展馬氏珠母貝的健康養(yǎng)殖和疾病防控、開發(fā)微生態(tài)制劑和優(yōu)化飼料配方積累了基礎(chǔ)資料。主要結(jié)果如下:1、分別采集雷州后洪和徐聞大井海區(qū)養(yǎng)殖的馬氏珠母貝腸道（HP和DP）與海水菌群（HW和DW）,16S rRNA-V4區(qū)測(cè)序和分析結(jié)果顯示:（1）HP和DP的優(yōu)勢(shì)菌均隸屬于藍(lán)細(xì)菌門、柔膜菌門和變形菌門,優(yōu)勢(shì)菌屬均為聚球藻屬,浮霉?fàn)罹鷮俸椭гw屬。（2）HW和DW的優(yōu)勢(shì)菌均隸屬于藍(lán)... 

【文章頁(yè)數(shù)】：119 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 研究背景
    1.2 本研究的目的和意義
    1.3 文獻(xiàn)綜述
        1.3.1 馬氏珠母貝應(yīng)用研究進(jìn)展
        1.3.2 腸道菌群研究
        1.3.3 益生菌
        1.3.4 微生物的研究方法
2 海區(qū)養(yǎng)殖馬氏珠母貝腸道與水體菌群的多樣性
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 樣品采集
        2.2.2 樣品總DNA提取、PCR擴(kuò)增及高通量測(cè)序
        2.2.3 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 基因組DNA和 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量檢測(cè)
        2.3.2 樣品測(cè)序質(zhì)量分析
        2.3.3 馬氏珠母貝腸道和養(yǎng)殖水體多樣性估計(jì)
        2.3.4 菌群組成
        2.3.5 Venn圖分析
        2.3.6 OTU相對(duì)豐度分析
        2.3.7 聚類分析與主成分分析
    2.4 討論
3 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝腸道菌群的影響
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 飼料來(lái)源
        3.2.2 飼養(yǎng)管理
        3.2.3 存活率和增長(zhǎng)率
        3.2.4 樣品采集
        3.2.5 消化酶和免疫酶活力分析
        3.2.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)
        3.2.7 基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增和高通量測(cè)序
        3.2.8 數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝特定生長(zhǎng)率的影響
        3.3.2 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝消化酶活性的影響
        3.3.3 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝免疫酶活性和免疫相關(guān)基因的影響
        3.3.4 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝腸道菌群的影響
    3.4 討論
        3.4.1 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝生長(zhǎng)性狀的影響
        3.4.2 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝消化酶活性的影響
        3.4.3 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝免疫酶和免疫相關(guān)基因表達(dá)的影響
        3.4.4 不同蛋白源飼料對(duì)馬氏珠母貝腸道菌群的影響
4 不同碳水化合物/蛋白水平飼料對(duì)馬氏珠母貝腸菌群的影響
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 飼料來(lái)源
        4.2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
        4.2.3 存活率和增長(zhǎng)率
        4.2.4 樣品采集
        4.2.5 消化酶和免疫酶活力分析
        4.2.6 基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增和高通量測(cè)序
        4.2.7 數(shù)據(jù)分析
    4.3 結(jié)果
        4.3.1 不同C/P比例飼料對(duì)馬氏珠母貝存活率和生長(zhǎng)性狀的影響
        4.3.2 不同C/P比例飼料對(duì)馬氏珠母貝酶活的影響
        4.3.3 不同C/P比例飼料對(duì)馬氏珠母貝腸道菌群的影響
    4.4 討論
        4.4.1 不同C/P比例水平飼料對(duì)馬氏珠母貝生長(zhǎng)和酶活的影響
        4.4.2 不同C/P比例飼料對(duì)馬氏珠母貝腸道菌群的影響
5 馬氏珠母貝腸道核心菌群
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
    5.3 結(jié)果
        5.3.1 門水平上各組共有菌群
        5.3.2 屬水平上各組共有菌群
    5.4 討論
6 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]蝦夷扇貝幼體及育苗池水體細(xì)菌群落動(dòng)態(tài)及潛在益生菌篩選[D]. 孫雪瑩.大連海洋大學(xué) 2016
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[6]不同豆粕水平的飼料中添加一種酵母培養(yǎng)物（益康XP）對(duì)大菱鲆生長(zhǎng)、組織學(xué)結(jié)構(gòu)以及腸道菌群的影響[D]. 趙貴萍.中國(guó)海洋大學(xué) 2008
[7]復(fù)合益生菌與酵母培養(yǎng)物對(duì)牙鲆（Paralichthys olivaceus）生長(zhǎng)、免疫及抗病力的影響[D]. 溫俊.中國(guó)海洋大學(xué) 2007



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