AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對文蛤遺傳多樣性評價的效果分析
發(fā)布時間:2022-10-08 11:22
以文蛤山東種群(SD)和廣西種群(GX)為實驗材料,比較分析了AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對遺傳多樣性的評價效果。結(jié)果顯示,AFLP熒光標(biāo)記法在選擇性擴(kuò)增引物5’端加了FAM熒光標(biāo)記,產(chǎn)物直接在DNA測序儀上檢測,自動采集圖像和數(shù)據(jù),較銀染法的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度更高、穩(wěn)定性更好。從遺傳參數(shù)來看,銀染法和熒光標(biāo)記法獲得的GX種群的多態(tài)位點比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均高于SD種群,表明兩種方法遺傳多樣性評價的結(jié)果一致。AFLP熒光標(biāo)記法在文蛤兩種群中共獲得244個擴(kuò)增位點,多態(tài)位點比例為94.26%,均高于銀染法(177個擴(kuò)增位點,多態(tài)位點比例85.31%)。文蛤SD和GX種群的擴(kuò)增位點數(shù)、多態(tài)位點比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均是熒光標(biāo)記法>銀染法。
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.2.1 基因組DNA的提取
1.2.2 酶切、連接、預(yù)擴(kuò)增和選擇性擴(kuò)增
1.2.3 PCR產(chǎn)物檢測
1.3 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AFLP熒光標(biāo)記法和銀染法的指紋圖譜和多態(tài)性比較分析
2.2 AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對文蛤種群遺傳多樣性評價的效果分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4個殼色花紋品系的遺傳差異分析[J]. 朱東麗,林志華,董迎輝,姚韓韓. 海洋與湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4個快速生長家系的遺傳變異分析[J]. 姚韓韓,董迎輝,林志華,朱東麗. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[3]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國強(qiáng),林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[4]廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志華,黃曉婷,董迎輝,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2009(01)
[5]基于形態(tài)參數(shù)和AFLP標(biāo)記的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群體遺傳變異分析[J]. 林志華,董迎輝,李寧,陸榮茂,肖國強(qiáng),柴雪良,劉保忠,孫長森,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2008(03)
[6]簾蛤科4種養(yǎng)殖蛤群體遺傳多樣性和種間關(guān)系的fAFLP分析[J]. 彭永興,程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國. 海洋科學(xué). 2008(01)
[7]兔熒光擴(kuò)增片段長度多態(tài)性分析體系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,張嘉保. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報. 2007(03)
[8]合浦珠母貝遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 喻達(dá)輝,王小玉,黃桂菊,郭奕惠,龔世園,王愛民. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2007(03)
[9]我國沿海不同群體文蛤遺傳差異RAPD分析[J]. 馮建彬,李家樂,王美珍,陳漢春. 海洋漁業(yè). 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP標(biāo)記初步構(gòu)建太平洋牡蠣的遺傳連鎖圖譜[J]. 李莉,郭希明. 海洋與湖沼. 2003(05)
本文編號:3687628
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.2.1 基因組DNA的提取
1.2.2 酶切、連接、預(yù)擴(kuò)增和選擇性擴(kuò)增
1.2.3 PCR產(chǎn)物檢測
1.3 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AFLP熒光標(biāo)記法和銀染法的指紋圖譜和多態(tài)性比較分析
2.2 AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對文蛤種群遺傳多樣性評價的效果分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4個殼色花紋品系的遺傳差異分析[J]. 朱東麗,林志華,董迎輝,姚韓韓. 海洋與湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4個快速生長家系的遺傳變異分析[J]. 姚韓韓,董迎輝,林志華,朱東麗. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[3]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國強(qiáng),林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[4]廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志華,黃曉婷,董迎輝,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2009(01)
[5]基于形態(tài)參數(shù)和AFLP標(biāo)記的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群體遺傳變異分析[J]. 林志華,董迎輝,李寧,陸榮茂,肖國強(qiáng),柴雪良,劉保忠,孫長森,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2008(03)
[6]簾蛤科4種養(yǎng)殖蛤群體遺傳多樣性和種間關(guān)系的fAFLP分析[J]. 彭永興,程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國. 海洋科學(xué). 2008(01)
[7]兔熒光擴(kuò)增片段長度多態(tài)性分析體系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,張嘉保. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報. 2007(03)
[8]合浦珠母貝遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 喻達(dá)輝,王小玉,黃桂菊,郭奕惠,龔世園,王愛民. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2007(03)
[9]我國沿海不同群體文蛤遺傳差異RAPD分析[J]. 馮建彬,李家樂,王美珍,陳漢春. 海洋漁業(yè). 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP標(biāo)記初步構(gòu)建太平洋牡蠣的遺傳連鎖圖譜[J]. 李莉,郭希明. 海洋與湖沼. 2003(05)
本文編號:3687628
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