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AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對文蛤遺傳多樣性評價的效果分析

發(fā)布時間:2022-10-08 11:22
  以文蛤山東種群(SD)和廣西種群(GX)為實驗材料,比較分析了AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對遺傳多樣性的評價效果。結(jié)果顯示,AFLP熒光標(biāo)記法在選擇性擴(kuò)增引物5’端加了FAM熒光標(biāo)記,產(chǎn)物直接在DNA測序儀上檢測,自動采集圖像和數(shù)據(jù),較銀染法的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度更高、穩(wěn)定性更好。從遺傳參數(shù)來看,銀染法和熒光標(biāo)記法獲得的GX種群的多態(tài)位點比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均高于SD種群,表明兩種方法遺傳多樣性評價的結(jié)果一致。AFLP熒光標(biāo)記法在文蛤兩種群中共獲得244個擴(kuò)增位點,多態(tài)位點比例為94.26%,均高于銀染法(177個擴(kuò)增位點,多態(tài)位點比例85.31%)。文蛤SD和GX種群的擴(kuò)增位點數(shù)、多態(tài)位點比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均是熒光標(biāo)記法>銀染法。 

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 實驗材料
    1.2 實驗方法
        1.2.1 基因組DNA的提取
        1.2.2 酶切、連接、預(yù)擴(kuò)增和選擇性擴(kuò)增
        1.2.3 PCR產(chǎn)物檢測
    1.3 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 AFLP熒光標(biāo)記法和銀染法的指紋圖譜和多態(tài)性比較分析
    2.2 AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對文蛤種群遺傳多樣性評價的效果分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國強(qiáng),林志華.  海洋科學(xué). 2009(10)
[4]廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志華,黃曉婷,董迎輝,包振民,胡景杰.  海洋與湖沼. 2009(01)
[5]基于形態(tài)參數(shù)和AFLP標(biāo)記的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群體遺傳變異分析[J]. 林志華,董迎輝,李寧,陸榮茂,肖國強(qiáng),柴雪良,劉保忠,孫長森,包振民,胡景杰.  海洋與湖沼. 2008(03)
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[10]利用RAPD和AFLP標(biāo)記初步構(gòu)建太平洋牡蠣的遺傳連鎖圖譜[J]. 李莉,郭希明.  海洋與湖沼. 2003(05)



本文編號:3687628

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