AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對(duì)文蛤遺傳多樣性評(píng)價(jià)的效果分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-08 11:22
以文蛤山東種群(SD)和廣西種群(GX)為實(shí)驗(yàn)材料,比較分析了AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對(duì)遺傳多樣性的評(píng)價(jià)效果。結(jié)果顯示,AFLP熒光標(biāo)記法在選擇性擴(kuò)增引物5’端加了FAM熒光標(biāo)記,產(chǎn)物直接在DNA測(cè)序儀上檢測(cè),自動(dòng)采集圖像和數(shù)據(jù),較銀染法的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度更高、穩(wěn)定性更好。從遺傳參數(shù)來(lái)看,銀染法和熒光標(biāo)記法獲得的GX種群的多態(tài)位點(diǎn)比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均高于SD種群,表明兩種方法遺傳多樣性評(píng)價(jià)的結(jié)果一致。AFLP熒光標(biāo)記法在文蛤兩種群中共獲得244個(gè)擴(kuò)增位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)比例為94.26%,均高于銀染法(177個(gè)擴(kuò)增位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)比例85.31%)。文蛤SD和GX種群的擴(kuò)增位點(diǎn)數(shù)、多態(tài)位點(diǎn)比例、Nei’s基因多樣性指數(shù)和香儂信息指數(shù)均是熒光標(biāo)記法>銀染法。
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 基因組DNA的提取
1.2.2 酶切、連接、預(yù)擴(kuò)增和選擇性擴(kuò)增
1.2.3 PCR產(chǎn)物檢測(cè)
1.3 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AFLP熒光標(biāo)記法和銀染法的指紋圖譜和多態(tài)性比較分析
2.2 AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對(duì)文蛤種群遺傳多樣性評(píng)價(jià)的效果分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4個(gè)殼色花紋品系的遺傳差異分析[J]. 朱東麗,林志華,董迎輝,姚韓韓. 海洋與湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4個(gè)快速生長(zhǎng)家系的遺傳變異分析[J]. 姚韓韓,董迎輝,林志華,朱東麗. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2011(03)
[3]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國(guó)強(qiáng),林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[4]廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志華,黃曉婷,董迎輝,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2009(01)
[5]基于形態(tài)參數(shù)和AFLP標(biāo)記的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群體遺傳變異分析[J]. 林志華,董迎輝,李寧,陸榮茂,肖國(guó)強(qiáng),柴雪良,劉保忠,孫長(zhǎng)森,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2008(03)
[6]簾蛤科4種養(yǎng)殖蛤群體遺傳多樣性和種間關(guān)系的fAFLP分析[J]. 彭永興,程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國(guó). 海洋科學(xué). 2008(01)
[7]兔熒光擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析體系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,張嘉保. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(03)
[8]合浦珠母貝遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 喻達(dá)輝,王小玉,黃桂菊,郭奕惠,龔世園,王愛民. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2007(03)
[9]我國(guó)沿海不同群體文蛤遺傳差異RAPD分析[J]. 馮建彬,李家樂(lè),王美珍,陳漢春. 海洋漁業(yè). 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP標(biāo)記初步構(gòu)建太平洋牡蠣的遺傳連鎖圖譜[J]. 李莉,郭希明. 海洋與湖沼. 2003(05)
本文編號(hào):3687628
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1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 基因組DNA的提取
1.2.2 酶切、連接、預(yù)擴(kuò)增和選擇性擴(kuò)增
1.2.3 PCR產(chǎn)物檢測(cè)
1.3 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AFLP熒光標(biāo)記法和銀染法的指紋圖譜和多態(tài)性比較分析
2.2 AFLP銀染法和熒光標(biāo)記法對(duì)文蛤種群遺傳多樣性評(píng)價(jià)的效果分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4個(gè)殼色花紋品系的遺傳差異分析[J]. 朱東麗,林志華,董迎輝,姚韓韓. 海洋與湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4個(gè)快速生長(zhǎng)家系的遺傳變異分析[J]. 姚韓韓,董迎輝,林志華,朱東麗. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2011(03)
[3]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國(guó)強(qiáng),林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[4]廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志華,黃曉婷,董迎輝,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2009(01)
[5]基于形態(tài)參數(shù)和AFLP標(biāo)記的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群體遺傳變異分析[J]. 林志華,董迎輝,李寧,陸榮茂,肖國(guó)強(qiáng),柴雪良,劉保忠,孫長(zhǎng)森,包振民,胡景杰. 海洋與湖沼. 2008(03)
[6]簾蛤科4種養(yǎng)殖蛤群體遺傳多樣性和種間關(guān)系的fAFLP分析[J]. 彭永興,程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國(guó). 海洋科學(xué). 2008(01)
[7]兔熒光擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析體系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,張嘉保. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(03)
[8]合浦珠母貝遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 喻達(dá)輝,王小玉,黃桂菊,郭奕惠,龔世園,王愛民. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2007(03)
[9]我國(guó)沿海不同群體文蛤遺傳差異RAPD分析[J]. 馮建彬,李家樂(lè),王美珍,陳漢春. 海洋漁業(yè). 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP標(biāo)記初步構(gòu)建太平洋牡蠣的遺傳連鎖圖譜[J]. 李莉,郭希明. 海洋與湖沼. 2003(05)
本文編號(hào):3687628
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