刺參微衛(wèi)星親子鑒定應(yīng)用及高溫脅迫下表觀遺傳調(diào)控探討
發(fā)布時(shí)間:2022-07-29 12:41
一、微衛(wèi)星標(biāo)記在刺參人工繁育中親本識(shí)別的應(yīng)用親子鑒定最早應(yīng)用于司法鑒定領(lǐng)域,隨著其技術(shù)發(fā)展成熟,現(xiàn)在已經(jīng)廣泛地應(yīng)用到動(dòng)物學(xué)、植物學(xué)及生態(tài)學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域。在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中,隨著現(xiàn)代生物科技的不斷發(fā)展,親子鑒定也廣泛的為良種選育、系譜追蹤提供技術(shù)支持,應(yīng)用親子鑒定技術(shù)鑒別個(gè)體身份,清晰系譜信息有著極為重要的現(xiàn)實(shí)意義。本研究選取8個(gè)高多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn),對(duì)240頭刺參幼體和14頭疑似親本進(jìn)行親緣關(guān)系的鑒定。通過(guò)檢測(cè),8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共得到53個(gè)等位基因,平均等位基因數(shù)為6.63;觀察雜合度在0.730-0.902之間;各位點(diǎn)的多態(tài)信息含量為0.696-0.836。通過(guò)親緣關(guān)系分析軟件CERVUS3.0分析,微衛(wèi)星位點(diǎn)累積排除概率分別為0.9934,0.9997,0.99999。基于排除法個(gè)體基因型判定,有37個(gè)子代有1個(gè)候選親本,194個(gè)子代有2個(gè)及以上候選親本;基于似然法判定,置信度為80%時(shí),有198個(gè)子代個(gè)體找到最似親本。綜合排除法和似然法的親權(quán)鑒定,成功為229個(gè)子代個(gè)體找到它們的親本,鑒定成功率達(dá)95%以上,研究結(jié)果可為刺參良種選育中混養(yǎng)群體優(yōu)勢(shì)性狀溯源、系譜明晰提供便捷可靠的工具...
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
上海海洋大學(xué) 李雪燕碩士學(xué)位論文答辯委員會(huì)成員名單
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1 刺參(Apostichopus japonicus)概述
2 微衛(wèi)星標(biāo)記在刺參人工繁育中親本識(shí)別的應(yīng)用
2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)
2.2 利用微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行親緣關(guān)系鑒定
2.3 親子鑒定方法的簡(jiǎn)介
2.4 影響親子鑒定準(zhǔn)確性的因素
2.5 親子鑒定的目的和意義
3 刺參對(duì)溫度適應(yīng)的研究
3.1 溫度對(duì)刺參生長(zhǎng)的影響
3.2 刺參在夏眠過(guò)程中的調(diào)控
4 表觀遺傳調(diào)控
4.1 表觀遺傳學(xué)
4.2 表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因
4.3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR
4.4 研究的目的和意義
第二章 微衛(wèi)星標(biāo)記在刺參人工繁育中親本識(shí)別的應(yīng)用
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)方法
1.4.1 成參 DNA 的提取
1.4.2 幼參 DNA 的提取
1.4.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)
1.4.4 PCR 擴(kuò)增條件
1.5 電泳檢測(cè)與條帶統(tǒng)計(jì)
1.5.1 配制非變性聚丙烯酰胺膠
1.5.2 凝膠電泳
1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 DNA 的提取檢測(cè)及位點(diǎn)擴(kuò)增結(jié)果
2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增結(jié)果分析
2.3 排除概率和累積排除概率
2.4 基于排除法的親子鑒定結(jié)果
2.5 基于似然法的親子鑒定結(jié)果
3 討論
第三章 表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因在不同脅迫溫度下的表達(dá)
1 材料與方法
1.1 主要儀器
1.2 主要試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)樣品
1.4 總 RNA 提取
1.5 逆轉(zhuǎn)錄合成 cDNA 模板
1.6 Real-time PCR
1.6.1 引物
1.6.2 real-time PCR 反應(yīng)體系
1.7 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 RNA 提取與反轉(zhuǎn)錄
2.2 不同溫度脅迫下的刺參表觀調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá)
3 討論
第四章 刺參表觀遺傳調(diào)控基因在不同脅迫時(shí)間下的表達(dá)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
1.2 總 RNA 的提取
1.3 逆轉(zhuǎn)錄合成 cDNA 模板
1.4 Real-time PCR
1.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 RNA 提取與反轉(zhuǎn)錄
2.2 高溫脅迫過(guò)程中表觀遺傳調(diào)控基因的表達(dá)
3 討論
4 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
已完成文章
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黑龍江野鯉與德國(guó)鏡鯉雜交組合的親子鑒定分析[J]. 葛會(huì)爭(zhēng),賈智英,李池陶,柏盈盈,武耀,石連玉. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(04)
[2]微衛(wèi)星標(biāo)記在不同殼色蝦夷扇貝家系親權(quán)鑒定的適用性[J]. 程鵬,楊?lèi)?ài)國(guó),吳彪,周麗青,李霞. 水生生物學(xué)報(bào). 2011(05)
[3]大菱鲆親子鑒定的微衛(wèi)星多重PCR技術(shù)建立及應(yīng)用[J]. 苗貴東,杜民,楊景峰,徐營(yíng),樊廷俊,陳松林. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(Z1)
[4]微衛(wèi)星標(biāo)記在穿山甲個(gè)體識(shí)別中的應(yīng)用[J]. 高賽飛,于冬梅,王瑩,彭建軍. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(12)
[5]基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的人工圈養(yǎng)豚鹿親子關(guān)系鑒定[J]. 余建秋,王強(qiáng),劉選珍,鄧家波,趙波,牛李麗,連虹,阮向東. 獸類(lèi)學(xué)報(bào). 2010(02)
[6]刺參基因組DNA提取的探討[J]. 孫孝德,孫國(guó)華,楊建敏,吉成龍,王衛(wèi)軍,宋志樂(lè). 生物技術(shù)通報(bào). 2010(03)
[7]薩羅羅非魚(yú)(Sarotherodon melanotheron)與其他5種羅非魚(yú)遺傳多樣性比較研究[J]. 李學(xué)軍,李?lèi)?ài)景,李思發(fā),蔡完其. 海洋與湖沼. 2010(01)
[8]DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)調(diào)控及主要生物學(xué)功能[J]. 蘇玉,王溪,朱衛(wèi)國(guó). 遺傳. 2009(11)
[9]微衛(wèi)星DNA標(biāo)記在大口黑鱸親權(quán)鑒定中的應(yīng)用[J]. 何小燕,白俊杰,劉小林,樊佳佳,何小平,李勝杰,葉星. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(08)
[10]Abscisic Acid-mediated Epigenetic Processes in Plant Development and Stress Responses[J]. Viswanathan Chinnusamy. Journal of Integrative Plant Biology. 2008(10)
碩士論文
[1]應(yīng)用微衛(wèi)星確定中國(guó)西門(mén)塔爾牛親緣關(guān)系[D]. 賀建寧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
本文編號(hào):3666487
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
上海海洋大學(xué) 李雪燕碩士學(xué)位論文答辯委員會(huì)成員名單
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1 刺參(Apostichopus japonicus)概述
2 微衛(wèi)星標(biāo)記在刺參人工繁育中親本識(shí)別的應(yīng)用
2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)
2.2 利用微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行親緣關(guān)系鑒定
2.3 親子鑒定方法的簡(jiǎn)介
2.4 影響親子鑒定準(zhǔn)確性的因素
2.5 親子鑒定的目的和意義
3 刺參對(duì)溫度適應(yīng)的研究
3.1 溫度對(duì)刺參生長(zhǎng)的影響
3.2 刺參在夏眠過(guò)程中的調(diào)控
4 表觀遺傳調(diào)控
4.1 表觀遺傳學(xué)
4.2 表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因
4.3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR
4.4 研究的目的和意義
第二章 微衛(wèi)星標(biāo)記在刺參人工繁育中親本識(shí)別的應(yīng)用
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)方法
1.4.1 成參 DNA 的提取
1.4.2 幼參 DNA 的提取
1.4.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)
1.4.4 PCR 擴(kuò)增條件
1.5 電泳檢測(cè)與條帶統(tǒng)計(jì)
1.5.1 配制非變性聚丙烯酰胺膠
1.5.2 凝膠電泳
1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 DNA 的提取檢測(cè)及位點(diǎn)擴(kuò)增結(jié)果
2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增結(jié)果分析
2.3 排除概率和累積排除概率
2.4 基于排除法的親子鑒定結(jié)果
2.5 基于似然法的親子鑒定結(jié)果
3 討論
第三章 表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因在不同脅迫溫度下的表達(dá)
1 材料與方法
1.1 主要儀器
1.2 主要試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)樣品
1.4 總 RNA 提取
1.5 逆轉(zhuǎn)錄合成 cDNA 模板
1.6 Real-time PCR
1.6.1 引物
1.6.2 real-time PCR 反應(yīng)體系
1.7 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 RNA 提取與反轉(zhuǎn)錄
2.2 不同溫度脅迫下的刺參表觀調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá)
3 討論
第四章 刺參表觀遺傳調(diào)控基因在不同脅迫時(shí)間下的表達(dá)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
1.2 總 RNA 的提取
1.3 逆轉(zhuǎn)錄合成 cDNA 模板
1.4 Real-time PCR
1.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 RNA 提取與反轉(zhuǎn)錄
2.2 高溫脅迫過(guò)程中表觀遺傳調(diào)控基因的表達(dá)
3 討論
4 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
已完成文章
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黑龍江野鯉與德國(guó)鏡鯉雜交組合的親子鑒定分析[J]. 葛會(huì)爭(zhēng),賈智英,李池陶,柏盈盈,武耀,石連玉. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(04)
[2]微衛(wèi)星標(biāo)記在不同殼色蝦夷扇貝家系親權(quán)鑒定的適用性[J]. 程鵬,楊?lèi)?ài)國(guó),吳彪,周麗青,李霞. 水生生物學(xué)報(bào). 2011(05)
[3]大菱鲆親子鑒定的微衛(wèi)星多重PCR技術(shù)建立及應(yīng)用[J]. 苗貴東,杜民,楊景峰,徐營(yíng),樊廷俊,陳松林. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(Z1)
[4]微衛(wèi)星標(biāo)記在穿山甲個(gè)體識(shí)別中的應(yīng)用[J]. 高賽飛,于冬梅,王瑩,彭建軍. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(12)
[5]基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的人工圈養(yǎng)豚鹿親子關(guān)系鑒定[J]. 余建秋,王強(qiáng),劉選珍,鄧家波,趙波,牛李麗,連虹,阮向東. 獸類(lèi)學(xué)報(bào). 2010(02)
[6]刺參基因組DNA提取的探討[J]. 孫孝德,孫國(guó)華,楊建敏,吉成龍,王衛(wèi)軍,宋志樂(lè). 生物技術(shù)通報(bào). 2010(03)
[7]薩羅羅非魚(yú)(Sarotherodon melanotheron)與其他5種羅非魚(yú)遺傳多樣性比較研究[J]. 李學(xué)軍,李?lèi)?ài)景,李思發(fā),蔡完其. 海洋與湖沼. 2010(01)
[8]DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)調(diào)控及主要生物學(xué)功能[J]. 蘇玉,王溪,朱衛(wèi)國(guó). 遺傳. 2009(11)
[9]微衛(wèi)星DNA標(biāo)記在大口黑鱸親權(quán)鑒定中的應(yīng)用[J]. 何小燕,白俊杰,劉小林,樊佳佳,何小平,李勝杰,葉星. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(08)
[10]Abscisic Acid-mediated Epigenetic Processes in Plant Development and Stress Responses[J]. Viswanathan Chinnusamy. Journal of Integrative Plant Biology. 2008(10)
碩士論文
[1]應(yīng)用微衛(wèi)星確定中國(guó)西門(mén)塔爾牛親緣關(guān)系[D]. 賀建寧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
本文編號(hào):3666487
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