紅鰭東方鲀是我國北方的經(jīng)濟養(yǎng)殖品種,為了提高種質(zhì)質(zhì)量,減少養(yǎng)殖過程中產(chǎn)生的經(jīng)濟損失,實驗從紅鰭東方鲀系譜認證、耐寒基因篩選及低溫相關調(diào)節(jié)機制開展相關研究。利用微衛(wèi)星標記技術、實時熒光定量技術和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析等對紅鰭東方鲀養(yǎng)殖家系進行科學研究。選取18℃、8℃、5℃脅迫下的肝臟組織進行轉(zhuǎn)錄組測序,通過KEGG數(shù)據(jù)庫對差異基因進行Pathway分析,結(jié)果顯示差異基因主要集中在新陳代謝通路,而且在信號轉(zhuǎn)導、運輸和代謝方面差異基因存在較多。通過GO功能顯著性富集分析,結(jié)果顯示隨著溫度降低,與分子功能有關的部分消化酶活性均有不同程度的下調(diào),這在一定程度上對魚類自身機體的代謝強度產(chǎn)生了相關影響,酶活與調(diào)節(jié)機制代謝,信號轉(zhuǎn)導等有著重要的聯(lián)系作用。在溫度下降的過程中,鐵離子的結(jié)合和血紅素的結(jié)合能力也呈下調(diào)趨勢,這與低溫環(huán)境下魚類的活動減弱有著密不可分的關系。在低溫脅迫下,魚類活動減弱,呼吸變慢,吸入魚體內(nèi)部的氧氣也隨之減少,整個魚體的溶氧情況對魚體自身也起了一定的調(diào)節(jié)作用,魚體在低溫條件下,大部分的能量作為熱能來平衡體內(nèi)內(nèi)環(huán)境與外界水溫造成的溫度差,鰓呼吸現(xiàn)象減弱,使得水中的氧氣擴散到血液中的機會變少... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
第一章 綜述
    第一節(jié) 轉(zhuǎn)錄組學相關研究
        1.轉(zhuǎn)錄組學研究現(xiàn)狀
        2.魚類的轉(zhuǎn)錄組學研究
    第二節(jié) 耐寒基因相關研究進展
        1.魚類低溫脅迫的相關研究進展
        2.低溫脅迫對魚類生長的影響
        3.耐寒基因相關研究進展
    第三節(jié) 系譜認證相關研究進展
        1.選擇育種和雜交育種相關研究進展
        2.分子標記輔助育種相關研究進展
        3.系譜認證在人工選育中的作用
第二章 基于紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)低溫轉(zhuǎn)錄組的調(diào)控機制的研究
    1.前言
    2.實驗材料和方法
        2.1 實驗材料
        2.2 實驗方法
    3.數(shù)據(jù)處理
        3.1 數(shù)據(jù)預處理以及質(zhì)量控制
        3.2 基因定量、差異基因篩選、功能富集及聚類分析
        3.3 基因結(jié)構優(yōu)化及新轉(zhuǎn)錄本預測
        3.4 可變剪切分析以及SNP、INDEL分析
    4 結(jié)果
        4.1 基因表達水平分析
        4.2 差異表達基因分析
    5 討論
第三章 紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)AFP、CIRP、Y-box和HMGB1基因的表達分析
    1.前言
    2.實驗材料和方法
        2.1 實驗材料
        2.2 總RNA的提取及CDNA文庫的構建
        2.3 實時熒光定量表達
    3.數(shù)據(jù)處理
    4.結(jié)果
        4.1 低溫脅迫情況下AFP基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達
        4.2 低溫脅迫情況下CIRP基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達
        4.3 低溫脅迫情況下HMGB1基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達
        4.4 低溫脅迫情況下Y-BOX基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達
    5.討論
        5.1 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中AFP基因表達的情況
        5.2 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中CIRP基因表達的情況
        5.3 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中HMGB1基因表達的情況
        5.4 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中Y-BOX基因表達的情況
    小結(jié)
第四章 紅鰭東方鲀和暗紋東方鲀的系譜認證
    第一節(jié) 紅鰭東方鲀（Takifugu rubripes）的系譜認證研究
        1.前言
        2.材料與方法
            2.1 樣品選取
            2.2 引物與試劑
            2.3 基因組DNA的提取
            2.4 PCR反應及電泳
            2.5 數(shù)據(jù)分析
        3.結(jié)果
            3.1 遺傳多樣性分析
            3.2 家系特異性鑒別
            3.3 推斷缺失親本基因型
        4.討論
    第二節(jié) 暗紋東方鲀(Takifugu obscurus)的系譜認證研究
        1.前言
        2.材料和方法
            2.1 樣品選取
            2.2 引物與試劑
            2.3 基因組DNA的提取
            2.4 PCR反應及電泳
            2.5 數(shù)據(jù)分析
        3.結(jié)果
            3.1 遺傳多樣性分析
            3.2 家系鑒別
            3.3 推斷缺失親本基因型
        4.討論
    小結(jié)
參考文獻
碩士期間科研產(chǎn)出情況
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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[2]利用微衛(wèi)星標記的魁蚶混交家系鑒定[J]. 孫楠,李琪,于紅,孔令鋒.  中國海洋大學學報(自然科學版). 2015(09)
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[4]利用微衛(wèi)星標記指導紅鰭東方鲀親本選配[J]. 劉永新,劉奕,周勤,張紅濤.  大連海洋大學學報. 2015(02)
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碩士論文
[1]大黃魚選育群體SSR遺傳多樣性分析、耐低溫分子標記篩選和耐低溫基因CIRP表達[D]. 胡謀.寧波大學 2014
[2]暗紋東方鲀養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析及生長性狀微衛(wèi)星標記篩選[D]. 鄒杰.上海海洋大學 2014
[3]擬穴青蟹SNP和SSR標記開發(fā)及系譜認證技術的建立研究[D]. 馬群群.上海海洋大學 2012
[4]低溫脅迫對奧尼羅非魚的生長、肌肉組成和血液生理生化指標的影響[D]. 賈明亮.廣東海洋大學 2010



本文編號：3515221