紅鰭東方鲀是我國北方的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖品種,為了提高種質(zhì)質(zhì)量,減少養(yǎng)殖過程中產(chǎn)生的經(jīng)濟(jì)損失,實(shí)驗(yàn)從紅鰭東方鲀系譜認(rèn)證、耐寒基因篩選及低溫相關(guān)調(diào)節(jié)機(jī)制開展相關(guān)研究。利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)、實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析等對(duì)紅鰭東方鲀養(yǎng)殖家系進(jìn)行科學(xué)研究。選取18℃、8℃、5℃脅迫下的肝臟組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,通過KEGG數(shù)據(jù)庫對(duì)差異基因進(jìn)行Pathway分析,結(jié)果顯示差異基因主要集中在新陳代謝通路,而且在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、運(yùn)輸和代謝方面差異基因存在較多。通過GO功能顯著性富集分析,結(jié)果顯示隨著溫度降低,與分子功能有關(guān)的部分消化酶活性均有不同程度的下調(diào),這在一定程度上對(duì)魚類自身機(jī)體的代謝強(qiáng)度產(chǎn)生了相關(guān)影響,酶活與調(diào)節(jié)機(jī)制代謝,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等有著重要的聯(lián)系作用。在溫度下降的過程中,鐵離子的結(jié)合和血紅素的結(jié)合能力也呈下調(diào)趨勢(shì),這與低溫環(huán)境下魚類的活動(dòng)減弱有著密不可分的關(guān)系。在低溫脅迫下,魚類活動(dòng)減弱,呼吸變慢,吸入魚體內(nèi)部的氧氣也隨之減少,整個(gè)魚體的溶氧情況對(duì)魚體自身也起了一定的調(diào)節(jié)作用,魚體在低溫條件下,大部分的能量作為熱能來平衡體內(nèi)內(nèi)環(huán)境與外界水溫造成的溫度差,鰓呼吸現(xiàn)象減弱,使得水中的氧氣擴(kuò)散到血液中的機(jī)會(huì)變少... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
第一章 綜述
    第一節(jié) 轉(zhuǎn)錄組學(xué)相關(guān)研究
        1.轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究現(xiàn)狀
        2.魚類的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
    第二節(jié) 耐寒基因相關(guān)研究進(jìn)展
        1.魚類低溫脅迫的相關(guān)研究進(jìn)展
        2.低溫脅迫對(duì)魚類生長的影響
        3.耐寒基因相關(guān)研究進(jìn)展
    第三節(jié) 系譜認(rèn)證相關(guān)研究進(jìn)展
        1.選擇育種和雜交育種相關(guān)研究進(jìn)展
        2.分子標(biāo)記輔助育種相關(guān)研究進(jìn)展
        3.系譜認(rèn)證在人工選育中的作用
第二章 基于紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)低溫轉(zhuǎn)錄組的調(diào)控機(jī)制的研究
    1.前言
    2.實(shí)驗(yàn)材料和方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2 實(shí)驗(yàn)方法
    3.數(shù)據(jù)處理
        3.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理以及質(zhì)量控制
        3.2 基因定量、差異基因篩選、功能富集及聚類分析
        3.3 基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化及新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)
        3.4 可變剪切分析以及SNP、INDEL分析
    4 結(jié)果
        4.1 基因表達(dá)水平分析
        4.2 差異表達(dá)基因分析
    5 討論
第三章 紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)AFP、CIRP、Y-box和HMGB1基因的表達(dá)分析
    1.前言
    2.實(shí)驗(yàn)材料和方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2 總RNA的提取及CDNA文庫的構(gòu)建
        2.3 實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)
    3.數(shù)據(jù)處理
    4.結(jié)果
        4.1 低溫脅迫情況下AFP基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達(dá)
        4.2 低溫脅迫情況下CIRP基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達(dá)
        4.3 低溫脅迫情況下HMGB1基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達(dá)
        4.4 低溫脅迫情況下Y-BOX基因在紅鰭東方鲀各組織中的表達(dá)
    5.討論
        5.1 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中AFP基因表達(dá)的情況
        5.2 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中CIRP基因表達(dá)的情況
        5.3 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中HMGB1基因表達(dá)的情況
        5.4 低溫脅迫下紅鰭東方鲀各組織中Y-BOX基因表達(dá)的情況
    小結(jié)
第四章 紅鰭東方鲀和暗紋東方鲀的系譜認(rèn)證
    第一節(jié) 紅鰭東方鲀（Takifugu rubripes）的系譜認(rèn)證研究
        1.前言
        2.材料與方法
            2.1 樣品選取
            2.2 引物與試劑
            2.3 基因組DNA的提取
            2.4 PCR反應(yīng)及電泳
            2.5 數(shù)據(jù)分析
        3.結(jié)果
            3.1 遺傳多樣性分析
            3.2 家系特異性鑒別
            3.3 推斷缺失親本基因型
        4.討論
    第二節(jié) 暗紋東方鲀(Takifugu obscurus)的系譜認(rèn)證研究
        1.前言
        2.材料和方法
            2.1 樣品選取
            2.2 引物與試劑
            2.3 基因組DNA的提取
            2.4 PCR反應(yīng)及電泳
            2.5 數(shù)據(jù)分析
        3.結(jié)果
            3.1 遺傳多樣性分析
            3.2 家系鑒別
            3.3 推斷缺失親本基因型
        4.討論
    小結(jié)
參考文獻(xiàn)
碩士期間科研產(chǎn)出情況
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]南極魚Ⅲ型抗凍基因真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及其細(xì)胞表達(dá)[J]. 楊敏,黃巧,陳良標(biāo).  浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(11)
[2]利用微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶混交家系鑒定[J]. 孫楠,李琪,于紅,孔令鋒.  中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(09)
[3]溫度和鹽度對(duì)4種殼色馬氏珠母貝谷胱甘肽過氧化物酶基因表達(dá)的影響[J]. 孫宗紅,劉志剛,白成,李健強(qiáng),劉超.  廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]利用微衛(wèi)星標(biāo)記指導(dǎo)紅鰭東方鲀親本選配[J]. 劉永新,劉奕,周勤,張紅濤.  大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析3個(gè)暗紋東方鲀（Takifugu obscurus）養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性[J]. 鄒杰,馬愛軍,趙艷飛,何偉國,王婷,岳亮,劉大勇,郭正龍.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[6]牙鲆耐寒相關(guān)基因CIRP、HMGB1的克隆及表達(dá)特征分析[J]. 胡金偉,尤鋒,王倩,王麗娟,翁申達(dá),辛夢(mèng)嬌.  海洋科學(xué). 2015(01)
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碩士論文
[1]大黃魚選育群體SSR遺傳多樣性分析、耐低溫分子標(biāo)記篩選和耐低溫基因CIRP表達(dá)[D]. 胡謀.寧波大學(xué) 2014
[2]暗紋東方鲀養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析及生長性狀微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[D]. 鄒杰.上海海洋大學(xué) 2014
[3]擬穴青蟹SNP和SSR標(biāo)記開發(fā)及系譜認(rèn)證技術(shù)的建立研究[D]. 馬群群.上海海洋大學(xué) 2012
[4]低溫脅迫對(duì)奧尼羅非魚的生長、肌肉組成和血液生理生化指標(biāo)的影響[D]. 賈明亮.廣東海洋大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3515221