p21活化蛋白激酶2（PAK2）在生物中具有促進細胞增殖生長、抗凋亡等重要作用,可激活細胞增殖生長相關基因的表達。為探究PAK2基因在石磺細胞增殖代謝中的作用,通過RACE技術克隆得到瘤背石磺（Onchidium reevesii）PAK2基因的cDNA全長,并利用實時熒光定量PCR（q RT-PCR）技術分析PAK2基因在不同組織中的相對表達情況。結果表明,瘤背石磺PAK2基因cDNA全長1 809 bp,包含1 488 bp的開放閱讀框,共編碼495個氨基酸,基因序列較為保守。序列分析結果顯示,瘤背石磺和光滑雙臍螺（Biomphalaria glabrata）PAK2基因相似度達到83%,氨基酸序列同源性高達88%。通過生物進化分析研究得出瘤背石磺與綠色海蝸牛（Elysia chlorotica）的進化關系相對較近。q RT-PCR結果顯示,腸道和背部PAK2基因表達量明顯高于其他組織,其次為神經組織和肝胰腺,腹足、口器和性腺的表達量處于中等水平,而蛋白腺表達最低。初步闡明了瘤背石磺PAK2基因的生物信息學特征以及在各組織中的表達水平,為研究其在石磺科貝類中的具體作用機理奠定了基礎... 

【文章來源】：安徽農業(yè)大學學報. 2020,47(02)CSCD

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【圖文】：

PAK2序列和推測編碼的氨基酸序列

PAK2三級結構預測

瘤背石磺PAK2所編碼氨基酸和其他物種的PAK2所編碼氨基酸具有相似序列，瘤背石磺、光滑雙臍螺（Biomphalaria glabrata）、綠色海蝸牛（Elysia chlorotica）和加州海兔（Aplysia californica)PAK2氨基酸序列預測分析（圖3），序列同源性分別為88%、85%和84%。運用ML法構建瘤背石磺PAK2氨基酸序列與光滑雙臍螺、綠色海蝸牛、加州海兔、福壽螺（Pomacea canaliculata）和長牡蠣（Crassostrea gigas）等軟體動物門12種動物的PAK2序列的系統(tǒng)進化樹（圖4）分析結果顯示，腹足綱類、瓣鰓綱類以及頭足類生物分別聚類為一支。其中腹足綱類動物中瘤背石磺和綠色海蝸牛的PAK2聚類為一支，再與光滑雙臍螺和加州海兔聚類為一大支。通過氨基酸序列對比以及進化樹分析可以得出瘤背石磺與綠色海蝸牛的進化關系相對較近。


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