瘤背石磺代謝蛋白PAK2基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 03:38
p21活化蛋白激酶2(PAK2)在生物中具有促進(jìn)細(xì)胞增殖生長(zhǎng)、抗凋亡等重要作用,可激活細(xì)胞增殖生長(zhǎng)相關(guān)基因的表達(dá)。為探究PAK2基因在石磺細(xì)胞增殖代謝中的作用,通過(guò)RACE技術(shù)克隆得到瘤背石磺(Onchidium reevesii)PAK2基因的cDNA全長(zhǎng),并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(q RT-PCR)技術(shù)分析PAK2基因在不同組織中的相對(duì)表達(dá)情況。結(jié)果表明,瘤背石磺PAK2基因cDNA全長(zhǎng)1 809 bp,包含1 488 bp的開(kāi)放閱讀框,共編碼495個(gè)氨基酸,基因序列較為保守。序列分析結(jié)果顯示,瘤背石磺和光滑雙臍螺(Biomphalaria glabrata)PAK2基因相似度達(dá)到83%,氨基酸序列同源性高達(dá)88%。通過(guò)生物進(jìn)化分析研究得出瘤背石磺與綠色海蝸牛(Elysia chlorotica)的進(jìn)化關(guān)系相對(duì)較近。q RT-PCR結(jié)果顯示,腸道和背部PAK2基因表達(dá)量明顯高于其他組織,其次為神經(jīng)組織和肝胰腺,腹足、口器和性腺的表達(dá)量處于中等水平,而蛋白腺表達(dá)最低。初步闡明了瘤背石磺PAK2基因的生物信息學(xué)特征以及在各組織中的表達(dá)水平,為研究其在石磺科貝類(lèi)中的具體作用機(jī)理奠定了基礎(chǔ)...
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,47(02)CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【圖文】:
PAK2序列和推測(cè)編碼的氨基酸序列
PAK2三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
瘤背石磺PAK2所編碼氨基酸和其他物種的PAK2所編碼氨基酸具有相似序列,瘤背石磺、光滑雙臍螺(Biomphalaria glabrata)、綠色海蝸牛(Elysia chlorotica)和加州海兔(Aplysia californica)PAK2氨基酸序列預(yù)測(cè)分析(圖3),序列同源性分別為88%、85%和84%。運(yùn)用ML法構(gòu)建瘤背石磺PAK2氨基酸序列與光滑雙臍螺、綠色海蝸牛、加州海兔、福壽螺(Pomacea canaliculata)和長(zhǎng)牡蠣(Crassostrea gigas)等軟體動(dòng)物門(mén)12種動(dòng)物的PAK2序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖4)分析結(jié)果顯示,腹足綱類(lèi)、瓣鰓綱類(lèi)以及頭足類(lèi)生物分別聚類(lèi)為一支。其中腹足綱類(lèi)動(dòng)物中瘤背石磺和綠色海蝸牛的PAK2聚類(lèi)為一支,再與光滑雙臍螺和加州海兔聚類(lèi)為一大支。通過(guò)氨基酸序列對(duì)比以及進(jìn)化樹(shù)分析可以得出瘤背石磺與綠色海蝸牛的進(jìn)化關(guān)系相對(duì)較近。
本文編號(hào):3515155
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,47(02)CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【圖文】:
PAK2序列和推測(cè)編碼的氨基酸序列
PAK2三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
瘤背石磺PAK2所編碼氨基酸和其他物種的PAK2所編碼氨基酸具有相似序列,瘤背石磺、光滑雙臍螺(Biomphalaria glabrata)、綠色海蝸牛(Elysia chlorotica)和加州海兔(Aplysia californica)PAK2氨基酸序列預(yù)測(cè)分析(圖3),序列同源性分別為88%、85%和84%。運(yùn)用ML法構(gòu)建瘤背石磺PAK2氨基酸序列與光滑雙臍螺、綠色海蝸牛、加州海兔、福壽螺(Pomacea canaliculata)和長(zhǎng)牡蠣(Crassostrea gigas)等軟體動(dòng)物門(mén)12種動(dòng)物的PAK2序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖4)分析結(jié)果顯示,腹足綱類(lèi)、瓣鰓綱類(lèi)以及頭足類(lèi)生物分別聚類(lèi)為一支。其中腹足綱類(lèi)動(dòng)物中瘤背石磺和綠色海蝸牛的PAK2聚類(lèi)為一支,再與光滑雙臍螺和加州海兔聚類(lèi)為一大支。通過(guò)氨基酸序列對(duì)比以及進(jìn)化樹(shù)分析可以得出瘤背石磺與綠色海蝸牛的進(jìn)化關(guān)系相對(duì)較近。
本文編號(hào):3515155
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