馬氏珠母貝殼基質(zhì)蛋白基因的克隆和表達(dá)模式研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-13 19:28
馬氏珠母貝是最重要的海水珍珠貝,然而至今還不能從分子水平徹底闡明珍珠的形成。珍珠的形成屬于生物礦化過(guò)程(biomineralization),是由一系列基質(zhì)蛋白指導(dǎo)CaCO3結(jié)晶的過(guò)程,但關(guān)于它們?cè)诜肿铀缴系淖饔脵C(jī)理,多個(gè)基質(zhì)蛋白相互之間的關(guān)系,與其他物種相關(guān)蛋白之間的進(jìn)化關(guān)系,表達(dá)水平的調(diào)控,目前的研究成果都無(wú)法給與充分的解釋。本實(shí)驗(yàn)主要完成2方面的工作:(1)考察多種環(huán)境因子對(duì)馬氏珠母貝一種重要基質(zhì)蛋白基因表達(dá)模式的影響;(2)發(fā)現(xiàn)一種新的殼基質(zhì)蛋白,并進(jìn)一步預(yù)測(cè)和分析其結(jié)構(gòu)和功能。我們擬通過(guò)開(kāi)展這樣的工作,為研究貝殼和珍珠的形成機(jī)理做出初步的研究。利用5’RACE技術(shù),克隆出一種馬氏珠母貝殼基質(zhì)蛋白基因的cDNA全長(zhǎng),通過(guò)預(yù)測(cè)該蛋白質(zhì)序列,發(fā)現(xiàn)其N(xiāo)端含有一段19個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽,含有典型的Gly-rich區(qū)和C端RKKKY保守序列,同源性分析表明,這是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的Shematrin家族成員,和Shematrin-2同屬一個(gè)亞家族,故命名為Shematrin-2β。進(jìn)一步的比對(duì)發(fā)現(xiàn),Shematrin-2β和MSI7有著局部高度匹配的區(qū)域,推測(cè)二者在進(jìn)化上有著特殊的關(guān)系。氨基...
【文章來(lái)源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Nacrein作用機(jī)理模式圖
可能會(huì)賦予其與 Ca2+極強(qiáng)的結(jié)合能力。N 端和 C 端各一個(gè) Cys 可能也意味著子內(nèi)或者分子間的二硫鍵。N16[10]是經(jīng)過(guò) pH 呈弱堿性的 10%EDTA-4Na 脫鈣處理后獲得的水不溶性(WISM),分子量 16kDa,故因此而得名 N16。該家族首次發(fā)現(xiàn) 3 個(gè)成員 131,299 和 299 個(gè)氨基酸,信號(hào)肽均為 N 端的 23 個(gè)氨基酸。RT-PCR 結(jié)果顯示外套膜背部區(qū)域(dorsal region)含量極高,而在邊緣區(qū)域(edge region)含量明該蛋白可能參與珍珠層的形成。氨基酸組分分析顯示,含量最高的為 Gsn 和 Cys,除此以外,芳香族氨基酸含量也很高,酸性氨基酸主要聚集在 4 級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示,該蛋白含有大量的 β 轉(zhuǎn)角(β-turn),一定量的 β 折疊和旋(α-helix)。體外結(jié)晶模擬實(shí)驗(yàn)顯示,游離狀態(tài)下的 N16 能夠抑制結(jié)晶過(guò)旦結(jié)合在 WISM 底質(zhì)上,則能夠誘導(dǎo)珍珠層所特有的文石晶體的結(jié)晶。從另,N16 并沒(méi)有調(diào)節(jié)碳酸鈣晶體多態(tài)性的作用。盡管 N16 能夠結(jié)合 Ca2+,但其其他 Ca2+-binding 蛋白具有特征性的相關(guān)結(jié)構(gòu)域,據(jù)推測(cè)有 3 種可能性:(區(qū)域可能參與與 Ca2+結(jié)合;(2)硫酸鹽側(cè)鏈的作用;(3)Asn-Gly(NG)用。
圖 1.4 Prismalin-14 功能區(qū)示意圖[1unctional domain mode發(fā)現(xiàn)的酸性最強(qiáng)的殼基質(zhì)蛋白,有可Asp 所占比例高達(dá) 60.4%,其次為 Gl前對(duì) Aspein 的作用尚不清楚,但其所的 Ca2+結(jié)合能力。有眾多的成員,最初在馬氏珠母貝中和黑蝶貝中均發(fā)現(xiàn)大量的 Shematrin- 的氨基酸組成和序列有著顯著地 2 大 員 該 motif 有 著 一 定 的 差 異 )Y 序列。雖然很多研究人員都認(rèn)為該,該家族的很多成員也參與珍珠層的沖液抽提,HPLC 純化而獲得的一種要基質(zhì)蛋白,不像其他基質(zhì)蛋白通過(guò)抑核位點(diǎn),通過(guò)與離子的相互作用以及對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Construction of cDNA subtractive library from pearl oyster (Pinctada fucata Gould) with red color shell by SSH[J]. 管云雁,黃良民,何毛賢. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2011(03)
本文編號(hào):3493582
【文章來(lái)源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Nacrein作用機(jī)理模式圖
可能會(huì)賦予其與 Ca2+極強(qiáng)的結(jié)合能力。N 端和 C 端各一個(gè) Cys 可能也意味著子內(nèi)或者分子間的二硫鍵。N16[10]是經(jīng)過(guò) pH 呈弱堿性的 10%EDTA-4Na 脫鈣處理后獲得的水不溶性(WISM),分子量 16kDa,故因此而得名 N16。該家族首次發(fā)現(xiàn) 3 個(gè)成員 131,299 和 299 個(gè)氨基酸,信號(hào)肽均為 N 端的 23 個(gè)氨基酸。RT-PCR 結(jié)果顯示外套膜背部區(qū)域(dorsal region)含量極高,而在邊緣區(qū)域(edge region)含量明該蛋白可能參與珍珠層的形成。氨基酸組分分析顯示,含量最高的為 Gsn 和 Cys,除此以外,芳香族氨基酸含量也很高,酸性氨基酸主要聚集在 4 級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示,該蛋白含有大量的 β 轉(zhuǎn)角(β-turn),一定量的 β 折疊和旋(α-helix)。體外結(jié)晶模擬實(shí)驗(yàn)顯示,游離狀態(tài)下的 N16 能夠抑制結(jié)晶過(guò)旦結(jié)合在 WISM 底質(zhì)上,則能夠誘導(dǎo)珍珠層所特有的文石晶體的結(jié)晶。從另,N16 并沒(méi)有調(diào)節(jié)碳酸鈣晶體多態(tài)性的作用。盡管 N16 能夠結(jié)合 Ca2+,但其其他 Ca2+-binding 蛋白具有特征性的相關(guān)結(jié)構(gòu)域,據(jù)推測(cè)有 3 種可能性:(區(qū)域可能參與與 Ca2+結(jié)合;(2)硫酸鹽側(cè)鏈的作用;(3)Asn-Gly(NG)用。
圖 1.4 Prismalin-14 功能區(qū)示意圖[1unctional domain mode發(fā)現(xiàn)的酸性最強(qiáng)的殼基質(zhì)蛋白,有可Asp 所占比例高達(dá) 60.4%,其次為 Gl前對(duì) Aspein 的作用尚不清楚,但其所的 Ca2+結(jié)合能力。有眾多的成員,最初在馬氏珠母貝中和黑蝶貝中均發(fā)現(xiàn)大量的 Shematrin- 的氨基酸組成和序列有著顯著地 2 大 員 該 motif 有 著 一 定 的 差 異 )Y 序列。雖然很多研究人員都認(rèn)為該,該家族的很多成員也參與珍珠層的沖液抽提,HPLC 純化而獲得的一種要基質(zhì)蛋白,不像其他基質(zhì)蛋白通過(guò)抑核位點(diǎn),通過(guò)與離子的相互作用以及對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Construction of cDNA subtractive library from pearl oyster (Pinctada fucata Gould) with red color shell by SSH[J]. 管云雁,黃良民,何毛賢. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2011(03)
本文編號(hào):3493582
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