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南海短尾大眼鯛(Priacanthus macracanthus)種群判別分析

發(fā)布時間:2021-10-16 04:37
  魚類種群是魚類分類學的基本單位,魚類資源變動研究也是以種群為單位,是魚類生物學研究的基礎。近年來,由于全球漁業(yè)捕撈能力過剩,海洋生態(tài)破壞和環(huán)境污染,很多魚類都面臨資源威脅,作為南海重要經(jīng)濟魚種之一的短尾大眼鯛的資源量也正在下降,迫切需要加強資源的合理開發(fā)和與國內(nèi)外的共同管理。本文以南海短尾大眼鯛(Priacanthus macracanthus)為研究對象,利用線粒體DNA序列分析方法判別南海北部和南部不同地理位點的短尾大眼鯛群體歸屬,為保護南海短尾大眼鯛資源及今后周邊各國的共同開發(fā)和捕撈配額管理提供基本依據(jù)。主要研究內(nèi)容如下:1.利用在南海北部陸架和南沙西南陸架采集的224尾短尾大眼鯛樣品,采用線粒體控制區(qū)(mt DNA D-loop區(qū))序列對其進行種群遺傳結(jié)構(gòu)分析,并探討6個采樣位點之間短尾大眼鯛種群歸屬關系。所得224條同源序列D-loop片段(729 bp)中堿基A、C、T、G的含量分別是31.8%、19.1%、34.1%和15.0%,A+T含量為65.9%,C+G含量為34.1%,顯示明顯的AT偏好和反G偏倚。檢測到了101個突變位點和94個核苷酸多態(tài)位點,定義了172種單倍... 

【文章來源】:上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】:54 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

南海短尾大眼鯛(Priacanthus macracanthus)種群判別分析


短尾大眼鯛PriacanthusmacracanthusFig.1-1Priacanthusmacracanthus

短尾,地點,離心管,肌肉


14圖 2-1 短尾大眼鯛標本采集地點圖Fig.2-1 Map showing sample localities for Priacanthus macracanth2.1.2 DNA 提取與檢測每個樣品取背部肌肉 25 mg 左右,置于 1.5 mL 離心管內(nèi),使用工程股份有限公司的海洋動物組織 DNA 提取試劑盒提取總基因組 D驟如下:1.稱取肌肉樣品約 25mg 加入離心管中,加 200 μL GA 緩沖液,液呈渾濁,目測無成塊肌肉組織;2.加入 20 μL 蛋白酶 K,渦旋混勻,簡短離心后置于 55℃恒溫水

網(wǎng)絡圖,單倍型,短尾,網(wǎng)絡圖


Network 軟件分析構(gòu)建的南海海域短尾大眼鯛群體的單倍型網(wǎng)絡(MJ)圖(圖 3)與其 NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹揭示了相似的結(jié)果,譜系發(fā)現(xiàn)大量的單倍型顯示為明顯的星狀分布, Hap 10、Hap 29、Hap 39 是高頻分布的優(yōu)勢單倍型。特有單倍型分散地分布在網(wǎng)絡圖中,未形成特有的進化枝。6 個短尾大眼鯛群體沒有表現(xiàn)出明顯的地理分布特征。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列對南中國海不同海域波紋唇魚群體遺傳多樣性的研究[J]. 胡靜,侯新遠,尹紹武,祝斐,賈一何,王小軍.  水生生物學報. 2014(06)
[2]內(nèi)蒙古達里湖及崗更湖東北雅羅魚D-loop基因序列及多樣性研究[J]. 羅旭光,齊景偉,安曉萍,烏蘭,姚珺,李蓓.  南方水產(chǎn)科學. 2014(02)
[3]基于線粒體Cyt b基因的黃鰭馬面鲀種群分析[J]. 李玉芳,李永振,陳國寶,孫典榮,于杰,崔科.  水產(chǎn)學報. 2014(01)
[4]基于線粒體控制區(qū)全序列的鄱陽湖水系鰱增殖放流群體與野生群體的遺傳多樣性分析[J]. 陳文靜,張燕萍,段辛斌,徐先棟,汪澄強.  中國農(nóng)學通報. 2013(35)
[5]長吻養(yǎng)殖群體與野生群體遺傳多樣性分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,馬玉涵.  水生生物學報. 2013(01)
[6]二長棘犁齒鯛線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)和進化[J]. 蘇天鳳,江世貴,馬之明,李夏.  南方水產(chǎn)科學. 2012(06)
[7]福建近海藍圓鲹群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 牛素芳,蘇永全,王軍,張麗艷.  廈門大學學報(自然科學版). 2012(04)
[8]基于COI部分序列探討南海鯧屬魚類系統(tǒng)進化與種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,尹飛,施兆鴻,彭士明.  海洋科學. 2012(06)
[9]南海金線魚屬Nemipterus魚類COⅠ和Cytb基因片段的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,李永振,陳國寶.  中國水產(chǎn)科學. 2012(02)
[10]北部灣3種金線魚屬魚類COI基因序列的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,艾紅,盧偉華,李希國,李娜娜,李夏,李永振.  中國水產(chǎn)科學. 2011(03)

碩士論文
[1]南海黃鰭馬面鲀(Thamnaconus hypargyreus)種群分析[D]. 李玉芳.上海海洋大學 2014
[2]太平洋中部黃鰭金槍魚種群遺傳多樣性研究[D]. 李偉文.上海海洋大學 2014
[3]棘頭梅童魚的遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 殷麗娜.中國海洋大學 2013
[4]中國野生烏鱧(Channa argus)遺傳多樣性分析[D]. 高志遠.暨南大學 2013
[5]南海北部陸架區(qū)金線魚(Nemipterus virgatus)種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學 2011



本文編號:3439161

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