自然界中一般認(rèn)為高等脊椎動物是既具有先天性免疫,也具有獲得性免疫的,而在無脊椎動物中由于缺乏真正的抗體和特異性的免疫性細(xì)胞,因此機(jī)體的防御反應(yīng)只有先天性免疫。本文對羅氏沼蝦的先天性免疫做出了相關(guān)研究。1.WSSV刺激后羅氏沼蝦淋巴器官的轉(zhuǎn)錄組分析。羅氏沼蝦（Macrobrachiumrosenbergii）是一種具有經(jīng)濟(jì)重要性的甲殼類動物,一般認(rèn)為成蝦對白斑綜合征病毒（WSSV）感染耐受。本研究采用新一代測序來確定WSSV感染淋巴器官和對照組淋巴器官之間的轉(zhuǎn)錄組差異。從對照樣品和WSSV感染樣品中分別產(chǎn)生總共44,606,694和40,384,856個純凈讀段并組裝成73,658和72,374個基因�；谕此阉�,KEGG,GO和COG分析,21,323個基因被注釋。其中,鑒定出4951個差異表達(dá)基因,并將其分類到244個代謝途徑。以凝血級聯(lián)和模式識別受體信號通路為例,討論宿主對WSSV感染的反應(yīng)。我們還鑒定了 12,308個簡單序列重復(fù)序列,可以進(jìn)一步用作功能標(biāo)記。該結(jié)果有助于更好地理解蝦淋巴器官對WSSV的免疫應(yīng)答,在缺少蝦基因組背景下,可以提供蝦的新基因信息。2.纖維蛋白原樣凝集... 

【文章來源】：南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．３．２．１羅氏沼蟲下的同源性檢索

Ｚ?Ｃｙｔｏｓｋｅｌｅｔｃｘｉ??Ｆｕｎｃｔｉｏｎ?Ｃｌａｓｓ??圖２．２．３．３羅氏沼蝦轉(zhuǎn)錄組的ＣＯＧ功能分類??Ｆｉｇ．?２．２．３．３?ＣＯＧ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｍ．?ｒｏｓｅｎｂｅｒｇｉｉ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ??１７??

２．３．４差異表達(dá)基因（ＤＥＧｓ）的ＧＯ網(wǎng)絡(luò)分析??為了更好地了解ＷＳＳＶ感染的分子機(jī)制并在轉(zhuǎn)錄組水平闡明羅氏沼蝦的抗??病毒過程，本次實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了對照樣品和感染樣品之間的ＤＥＧ比較。ＷＳＳＶ感染??后，ＤＥＧ的上調(diào)數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于下調(diào)的數(shù)量，從而表明ＷＳＳＶ感染過程與轉(zhuǎn)錄物??積累有關(guān)（圖２．３．３）。接下來，進(jìn)行ＧＯ功能富集分析，并進(jìn)行ＧＯ轉(zhuǎn)錄物組??裝重疊群的網(wǎng)絡(luò)，示于圖２．３．４中。對于轉(zhuǎn)錄物組裝重疊群，大部分基因本體過??表達(dá)與代謝過程有關(guān)，如“單一生物體過程”和“有機(jī)氮化合物過程”（Ｅ值分別為??３．７５Ｅ－０５和４．５Ｅ－０４）。在富集分析中，ＧＯ術(shù)語“催化活性”和“水解酶活性”分別??顯示為分子功能類別中最顯著的代表性術(shù)語，Ｅ值分別為５．８７Ｅ－０６和２．４５Ｅ－０５。??這些催化和水解酶相關(guān)過程可能在羅氏沼蝦的淋巴器官ＷＳＳＶ反應(yīng)中發(fā)揮重要??作用。此外，大部分反應(yīng)發(fā)生在“胞外區(qū)”（Ｅ值為９．５９Ｅ－０７）。與對照樣本相比，??我們還發(fā)現(xiàn)，在感染樣本中許多異常表達(dá)的ＤＥＧｓ參與各種免疫過程，后文中的??纖維蛋白原相關(guān)蛋白基因與Ｋｒｕｐｐｅｌ樣因子基因均來源于此。這里列出了一些涉??及凝血級聯(lián)和模式識別受體的免疫基因（表４）。討論部分提供了詳細(xì)的解釋。??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]抑癌基因KLF6在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 王小萼,汪宏波.  醫(yī)學(xué)綜述. 2008(14)
[2]無脊椎動物先天免疫模式識別受體研究進(jìn)展[J]. 王金星,趙小凡.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2004(02)

博士論文
[1]十足目甲殼動物C型凝集素功能研究[D]. 王顯偉.山東大學(xué) 2012



本文編號：3327132