日本囊對(duì)蝦（Marsupenaeus japonicus）是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖品種,依據(jù)其頭胸甲側(cè)部斜紋的形態(tài)特征可分為兩種不同的形態(tài)變異類型,即形態(tài)變異類型Ⅰ（variety Ⅰ）和形態(tài)變異類型Ⅱ（variety Ⅱ）,二者形態(tài)相似但遺傳分化程度很高,具有不同的地理分布。α-淀粉酶是一種重要的碳水化合物水解酶,在蝦類的食物消化和營(yíng)養(yǎng)代謝方面具有重要作用。本文克隆了兩種形態(tài)變異類型日本囊對(duì)蝦的α-淀粉酶基因,分析了該基因的分子結(jié)構(gòu)特征,通過基因的時(shí)空表達(dá)探討其功能,并比較了兩種形態(tài)變異類型α-淀粉酶基因的差異。主要結(jié)果如下：（1）形態(tài)變異類型1日本囊對(duì)蝦α-淀粉酶基因MjAmy-1的cDNA序列長(zhǎng)1651bp,其中開放閱讀框1539 bp,編碼一個(gè)由512個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì)。預(yù)測(cè)分子質(zhì)量為57.10KDa,等電點(diǎn)為4.99,該多肽具有一個(gè)由17個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽。該基因DNA序列長(zhǎng)3387bp,包含11個(gè)外顯子和10個(gè)內(nèi)含子。多序列比對(duì)和同源性分析顯示,MjAmy-1是α-淀粉酶基因家族的成員,具有a-淀粉酶家族典型的功能位點(diǎn)和功能域,與凡納濱對(duì)蝦a-淀粉酶的氨基酸序列相似性最高（... 

【文章來源】：廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 日本囊對(duì)蝦簡(jiǎn)介
        1.1.1 分類地位與形態(tài)特征
        1.1.2 地理分布和生活習(xí)性
        1.1.3 生活史
        1.1.4 日本囊對(duì)蝦兩種形態(tài)變異類型的相關(guān)研究
    1.2 α-淀粉酶研究概述
        1.2.1 α -淀粉酶概述
        1.2.2 α -淀粉酶的結(jié)構(gòu)和分類
        1.2.3 α -淀粉酶的功能與應(yīng)用
    1.3 動(dòng)物、植物和微生物α-淀粉酶研究概況
        1.3.1 微生物α-淀粉酶
        1.3.2 植物α-淀粉酶
        1.3.3 動(dòng)物α-淀粉酶
    1.4 水產(chǎn)動(dòng)物α-淀粉酶的研究進(jìn)展
        1.4.1 水產(chǎn)動(dòng)物淀粉酶酶活的相關(guān)研究
            1.4.1.1 不同環(huán)境因子對(duì)淀粉酶活性的影響
            1.4.1.2 水產(chǎn)動(dòng)物不同種類、食性與淀粉酶活性的關(guān)系
            1.4.1.3 水產(chǎn)動(dòng)物不同生長(zhǎng)發(fā)育階段淀粉酶活性的研究
        1.4.2 水產(chǎn)動(dòng)物α-淀粉酶基因的相關(guān)研究
    1.5 遺傳多樣性
        1.5.1 DNA分子標(biāo)記
        1.5.2 單核苷酸多態(tài)性（SNP）
    1.6 本研究的內(nèi)容與意義
    1.7 實(shí)驗(yàn)技術(shù)路線
第二章 日本囊對(duì)蝦形態(tài)變異類型Ⅰα-淀粉酶基因MjAmy-1的基因克隆與序列分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 常用溶液配制
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 總RNA提取
        2.2.2 cDNA第一鏈的合成
        2.2.3 MjAmy-1基因中間片段的克隆
        2.2.4 MjAmy-1基因3'RACE擴(kuò)增
        2.2.5 MjAmy-1基因編碼區(qū)克隆
        2.2.6 序列及結(jié)構(gòu)特征分析
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 MjAmy-1基因的cDNA與氨基酸序列分析
        2.3.2 MjAmy-1基因的同源性分析
        2.3.3 MjAmy-1基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.3.4 MjAmy-1的基因組序列分析
        2.3.5 MjAmy-1基因的二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    2.4 討論
第三章 日本囊對(duì)蝦形態(tài)變異類型Ⅰα-淀粉酶基因MjAmy-1的組織分布與表達(dá)
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        3.1.3 主要試劑與材料
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 總RNA提取
        3.2.2 RT-PCR模板的制備
        3.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)
        3.2.4 α-淀粉酶蛋白在不同組織的分布
    3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.3.1 引物特異性擴(kuò)增檢驗(yàn)和標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
        3.3.2 MjAmy-1基因的組織分布
        3.3.3 MjAmy-1基因在幼體發(fā)育階段的表達(dá)變化
        3.3.4 α-淀粉酶蛋白在不同組織的分布
    3.4 討論
        3.4.1 MjAmy-1基因的組織分布
        3.4.2 MjAmy-1基因在不同幼體發(fā)育階段的表達(dá)
第四章 日本囊對(duì)蝦形態(tài)變異類型Ⅱα-淀粉酶基因MjAmy-2的基因克隆與序列分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        4.1.3 主要試劑
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
        4.2.1 引物設(shè)計(jì)
        4.2.2 MjAmy-2基因編碼區(qū)的克隆
        4.2.3 序列及結(jié)構(gòu)特征分析
    4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.3.1 MjAmy-2基因的開放閱讀框與氨基酸序列分析
        4.3.2 MjAmy-2基因的同源性分析
        4.3.3 MjAmy-2基因的基因組序列分析
        4.3.4 MjAmy-2基因的二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    4.4 討論
第五章 日本囊對(duì)蝦兩種形態(tài)變異類型α-淀粉酶基因MjAmy-1和MjAmy-2的比較
    5.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        5.1.3 主要試劑
    5.2 實(shí)驗(yàn)方法
        5.2.1 基因組總DNA的提取
        5.2.2 群體DNA片段的PCR擴(kuò)增與測(cè)序
        5.2.3 群體SNP位點(diǎn)的篩選與統(tǒng)計(jì)
        5.2.4 SNP位點(diǎn)的遺傳學(xué)參數(shù)分析
    5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        5.3.1 MjAmy-1和MjAmy-2基因核苷酸序列的比較
        5.3.2 MjAmy-1和MjAmy-2基因氨基酸序列的比較
        5.3.3 MjAmy-1和MjAmy-2二級(jí)結(jié)構(gòu)的比較
        5.3.4 兩種形態(tài)變異類型群體α-淀粉酶基因SNP的比較
    5.4 討論
第六章 結(jié)語(yǔ)
    6.1 結(jié)論
    6.2 主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
    6.3 研究展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間參與的項(xiàng)目與成果
致謝



本文編號(hào)：3144353