卵形鯧鲹（Trachinotus Ovatus）是一種中上層暖水性魚類,生長速度快,肉質(zhì)鮮美,營養(yǎng)價值高,已成為中國南方地區(qū)主要的海水養(yǎng)殖品種之一。由于暴雨和臺風(fēng)等極端天氣經(jīng)常導(dǎo)致池塘和海灣中的鹽度急劇下降,嚴(yán)重影響卵形鯧鲹的生長和生存。因此,研究卵形鯧鲹在鹽度脅迫下的滲透壓調(diào)節(jié)機制是必要的。本研究通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對慢性鹽度脅迫下卵形鯧鲹的鰓進行分析,得到顯著差異表達基因和代謝通路。在急性鹽度脅迫下,本研究首先對血清中的滲透壓、Na+/Cl-離子濃度、皮質(zhì)醇（COR）和催乳素（PRL）進行測定。其次還對鰓中的Na+/K+-ATPase（NKA）進行測定。最后,從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中與鹽度相關(guān)顯著差異表達基因篩選出NKAα1、NKCC1a和AQP1a的基因序列,研究它們在急性鹽度脅迫下對卵形鯧鲹滲透調(diào)節(jié)的影響。本文的主要結(jié)果如下:1.利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)構(gòu)建了與卵形鯧鲹鹽度適應(yīng)相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,共獲得410,071,902 raw reads。過濾和去除低質(zhì)量的reads得到高質(zhì)量的405,814,464reads,將所得的Unigene對比到數(shù)據(jù)庫中,注釋到38,437個Unigene,37... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

轉(zhuǎn)錄組測序流程圖

圖 2-2 信息分析流程Figure 2-2 Information analysis process表達注釋得到的 Unigene 序列通過 blastx 與 Nr、Swissprot、KEGG庫進行比對（evalue<1e﹣5視為顯著性），獲得相似性最高白的功能對 Unigene 進行蛋白功能注釋、pathway 注釋、Cology（GO）功能注釋等[56]。表達基因鑒定wtie 2 程序[57]將每個文庫中的高質(zhì)量 reads 映射到從頭裝對來自比對的映射讀數(shù)進行計數(shù)，然后使用 RSEMV1.2.1M（每千萬堿基對測序的轉(zhuǎn)錄物序列的片段每千堿基的預(yù)

圖 2-3 卵形鯧鲹鰓組織總 RNA 電泳圖r 5000; 1，2，3：對應(yīng) SL-1，SL-2 和 SL-3；4，5，6：對應(yīng) MS-1，MS-2 和 MS-3；7，89：對應(yīng) SN-1，SN-2 和 SN-3Figure 2-3 Electrophoretic pattern of total RNA in Trachinotus ovatus gillser 5000; 1，2，3：Correspondence SL-1，SL-2 and SL-3；4，5，6：Correspondence MS-1MS-2 and MS-3；7，8，9：Correspondence SN-1，SN-2 and SN-3

【參考文獻】：
期刊論文
[1]卵形鯧鲹MHCⅡβ基因的克隆與表達分析[J]. 于文博,朱克誠,郭華陽,張楠,孫瀟瀟,吳娜,張殿昌.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2017(04)
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[3]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動物研究中的運用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇.  水產(chǎn)學(xué)報. 2015(04)
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[5]鹽度脅迫及晝夜變化對鯔魚幼魚消化酶活力的影響[J]. 于娜,李加兒,區(qū)又君,范春燕,張建生.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2011(06)
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[7]魚類的非特異性免疫概述[J]. 李新文,呂延玲.  黑龍江水產(chǎn). 2010(02)
[8]半滑舌鰨幼魚消化酶同功酶譜初步研究[J]. 田相利,任曉偉,董雙林,房景輝.  生物技術(shù)通報. 2008(S1)
[9]鹽度對施氏鱘幼魚消化酶活力的影響[J]. 莊平,章龍珍,田宏杰,趙峰,宋超.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(02)
[10]NPA motif在水通道蛋白AQP1表達和轉(zhuǎn)水功能中的重要性[J]. 姜勇,麻彤輝.  科學(xué)通報. 2007(04)

博士論文
[1]黃鱔性別分化相關(guān)候選基因的篩選及相關(guān)功能研究[D]. 丁煒東.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016

碩士論文
[1]應(yīng)用TALEN技術(shù)敲除斑馬魚IDH基因及突變體篩選[D]. 熊小杰.南方醫(yī)科大學(xué) 2016



本文編號：2994478