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igf1和trim63a基因在泥鰍二倍體與四倍體中的克隆及表達(dá)差異研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-31 09:33
   泥鰍(Misgurnus anguillicaudatus)是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類,因其營(yíng)養(yǎng)豐富、肉質(zhì)鮮嫩深受歡迎,僅靠捕撈野生資源無(wú)法滿足市場(chǎng)需求量,但是泥鰍的體型較小,生產(chǎn)量較低,隨著國(guó)內(nèi)泥鰍養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大,如何提高其養(yǎng)殖生產(chǎn)量成為越來(lái)越多學(xué)者的研究重點(diǎn)。本研究通過(guò)對(duì)泥鰍二倍體和四倍體不同組織和不同胚胎發(fā)育時(shí)期胰島素樣生長(zhǎng)因子1(insulin-like growth factor,igf1)及肌肉環(huán)狀指基因1a(tripartite motif containing,trim63a)的基因表達(dá)量及雌二醇處理后兩種倍性泥鰍不同組織中igf1與trim63a的表達(dá)模式變化的研究,探討igf1、trim63a參與泥鰍二倍體與四倍體肌肉蛋白代謝與生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)理,為泥鰍新品種的培育提供理論基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下:1.克隆得到泥鰍二倍體與四倍體igf1基因的cDNA序列,經(jīng)比對(duì)發(fā)現(xiàn)二倍體與四倍體igf1基因的cDNA序列基本一致,氨基酸序列完全一致。生物信息學(xué)分析顯示,泥鰍二倍體igf1 cDNA序列大小為692 bp,包含483 bp ORF,編碼160個(gè)氨基酸,氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示Igf1的氨基酸結(jié)構(gòu)具有高度保守性,與斑馬魚(yú)氨基酸序列最為相近;系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),該基因與傳統(tǒng)進(jìn)化的分類地位一致。采用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)人工繁殖獲得的泥鰍二倍體和四倍體胚胎不同發(fā)育時(shí)期以及二倍體與四倍體成魚(yú)不同組織中igf1 mRNA的表達(dá)量;虮磉_(dá)分析結(jié)果顯示,igf1在泥鰍二倍體與四倍體胚胎的13個(gè)發(fā)育時(shí)期均有表達(dá),不同倍性的胚胎表達(dá)差異較大,igf1在二倍體胚胎的受精卵期表達(dá)量顯著高于其他胚胎發(fā)育時(shí)期,在四倍體胚胎的出膜期表達(dá)量顯著高于其他胚胎時(shí)期。igf1在四倍體胚胎4-8細(xì)胞期的表達(dá)量顯著高于二倍體,在肌肉效應(yīng)期的表達(dá)量顯著低于二倍體。igf1在泥鰍二倍體與四倍體成魚(yú)的7個(gè)組織中均有表達(dá),igf1在肝臟中的表達(dá)量顯著高于其他6個(gè)組織,其次是肌肉。研究表明,igf1在泥鰍二倍體與四倍體的胚胎發(fā)育過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用,但其調(diào)控機(jī)制不同,在二倍體與四倍體成魚(yú)組織中的表達(dá)模式相似,可能具有參與調(diào)節(jié)機(jī)體生長(zhǎng)的相似功能。2.克隆獲得泥鰍二倍體與四倍體trim63a基因的cDNA序列,經(jīng)比對(duì)發(fā)現(xiàn)二倍體與四倍體trim63a基因的cDNA序列基本一致,氨基酸序列完全一致。進(jìn)行生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,泥鰍二倍體trim63a cDNA序列大小為1035 bp,編碼344個(gè)氨基酸,氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示Trim63a的氨基酸結(jié)構(gòu)具有高度保守性,與斑馬魚(yú)氨基酸序列最為相近;系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),該基因與傳統(tǒng)進(jìn)化的分類地位一致。采用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)人工繁殖獲得的泥鰍二倍體和四倍體胚胎不同發(fā)育時(shí)期以及二倍體與四倍體成魚(yú)不同組織中trim63a mRNA的表達(dá)量;虮磉_(dá)分析結(jié)果顯示,trim63a在泥鰍二倍體與四倍體胚胎的13個(gè)發(fā)育時(shí)期均有表達(dá),不同倍性的胚胎表達(dá)差異較大,trim63a在神經(jīng)胚期的表達(dá)量顯著高于其他胚胎發(fā)育時(shí)期。trim63a在四倍體胚胎4-8細(xì)胞期的表達(dá)量顯著低于二倍體,在肌節(jié)出現(xiàn)期期的表達(dá)量顯著高于二倍體。trim63a在泥鰍二倍體與四倍體成魚(yú)的7個(gè)組織中均有表達(dá),trim63a在肌肉和心臟中的表達(dá)量顯著高于其他5個(gè)組織。研究表明,trim63a可能參與調(diào)節(jié)泥鰍二倍體與四倍體胚胎發(fā)育時(shí)期肌肉代謝,在二倍體與四倍體成魚(yú)組織中的表達(dá)模式相似,且具有組織特異性,可能具有參與肌肉分解途徑的相似功能。3.采用腹腔注射處理泥鰍二倍體與四倍體成魚(yú),并采用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)在注射17β-雌二醇(17β-estradiol,17β-E_2)后不同時(shí)段(6 h、12 h、24 h、14 d)心臟、肝臟、肌肉和血液igf1和trim63a mRNA的表達(dá)變化。結(jié)果表明,17β-E_2在泥鰍二倍體與四倍體成魚(yú)中的效應(yīng)時(shí)間不一致,但注射后肌肉和血液中的igf1 mRNA表達(dá)量顯著上調(diào),肝臟和肌肉中的trim63a mRNA表達(dá)量顯著上調(diào)。注射兩周后各組織中igf1和trim63a mRNA的表達(dá)量基本恢復(fù)正常水平,表明17β-E_2可能已經(jīng)被魚(yú)體代謝。綜上所述,泥鰍二倍體與四倍體中igf1和trim63a均參與調(diào)控肌肉蛋白代謝過(guò)程,肌肉代謝與機(jī)體生長(zhǎng)具有較高的相關(guān)性,因此,探究泥鰍二倍體與四倍體中igf1和trim63a的表達(dá)模式有利于掌握泥鰍肌肉生長(zhǎng)的規(guī)律,為今后培育生長(zhǎng)較快的泥鰍提供理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:

核苷酸序列,四倍體,二倍體,泥鰍


3.1 泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因序列比對(duì)本實(shí)驗(yàn)采用克隆的方法獲得了泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因的 cDNA 序列,通過(guò)Blast比對(duì)發(fā)現(xiàn)泥鰍二倍體與四倍體igf1基因cDNA序列相似度為99.86%(圖2-1),氨基酸序列相似度為 100%(圖 2-2)。

氨基酸序列,四倍體,二倍體,泥鰍


圖 2-1 泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因 cDNA 序列比對(duì)Fig. 2-1 The alignments of igf1 cDNA sequences in diploid and tetraploid M. Anguillicaudatus2N:二倍體;4N:四倍體;“*”表示相同的核苷酸序列。2N: Diploid; 4N: Tetraploid; Consensusnucleotides are indicated with asterisks “*” .

氨基酸序列,泥鰍,二倍體,cDNA序列


華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位論文倍體 igf1 基因序列信息倍體 igf1 基因 cDNA 序列長(zhǎng) 692 bp,ORF 為 483 bp,編碼 160 區(qū)(5 UTR)102 bp(圖 2-3),Expasy Protparam 結(jié)果顯示 Ig推測(cè)蛋白分子式為C768H1217N239O228S15,分子量為17.93 kd,等電er)含量最高為 10.0%,異亮氨酸(Ile)和色氨酸(Trp)含量最低殘基(Asp + Glu)總數(shù)為 13,帶正電荷的殘基(Arg + Lys)總結(jié)果顯示該蛋白無(wú)跨膜區(qū);Signal P 4.1 server 結(jié)果顯示該蛋);NetPhos 3.1 結(jié)果顯示該蛋白包含 14 個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)、和 1 個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn);NetOGlyc 4.0 Server 結(jié)果顯示該蛋化位點(diǎn);SMART 結(jié)果顯示該蛋白含有 1 個(gè)功能域即 ILGF(47-ISS-MODEL 預(yù)測(cè)該蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)如圖 2-5 所示。
【相似文獻(xiàn)】

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5 邢書(shū)青;;泥鰍的養(yǎng)殖技術(shù)——黃河鄭州段黃河鯉國(guó)家級(jí)水產(chǎn)種質(zhì)資源保護(hù)區(qū)巡護(hù)調(diào)查報(bào)告[J];農(nóng)家參謀;2018年08期

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本文編號(hào):2863771

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