igf1和trim63a基因在泥鰍二倍體與四倍體中的克隆及表達(dá)差異研究
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:
3.1 泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因序列比對(duì)本實(shí)驗(yàn)采用克隆的方法獲得了泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因的 cDNA 序列,通過(guò)Blast比對(duì)發(fā)現(xiàn)泥鰍二倍體與四倍體igf1基因cDNA序列相似度為99.86%(圖2-1),氨基酸序列相似度為 100%(圖 2-2)。
圖 2-1 泥鰍二倍體與四倍體 igf1 基因 cDNA 序列比對(duì)Fig. 2-1 The alignments of igf1 cDNA sequences in diploid and tetraploid M. Anguillicaudatus2N:二倍體;4N:四倍體;“*”表示相同的核苷酸序列。2N: Diploid; 4N: Tetraploid; Consensusnucleotides are indicated with asterisks “*” .
華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位論文倍體 igf1 基因序列信息倍體 igf1 基因 cDNA 序列長(zhǎng) 692 bp,ORF 為 483 bp,編碼 160 區(qū)(5 UTR)102 bp(圖 2-3),Expasy Protparam 結(jié)果顯示 Ig推測(cè)蛋白分子式為C768H1217N239O228S15,分子量為17.93 kd,等電er)含量最高為 10.0%,異亮氨酸(Ile)和色氨酸(Trp)含量最低殘基(Asp + Glu)總數(shù)為 13,帶正電荷的殘基(Arg + Lys)總結(jié)果顯示該蛋白無(wú)跨膜區(qū);Signal P 4.1 server 結(jié)果顯示該蛋);NetPhos 3.1 結(jié)果顯示該蛋白包含 14 個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)、和 1 個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn);NetOGlyc 4.0 Server 結(jié)果顯示該蛋化位點(diǎn);SMART 結(jié)果顯示該蛋白含有 1 個(gè)功能域即 ILGF(47-ISS-MODEL 預(yù)測(cè)該蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)如圖 2-5 所示。
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2863771
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