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長江口中華鱘幼魚的生長食性和遺傳多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-22 21:27
   中華鱘(Acipenser sinensis Gray)屬鱘形目Acipenseriformes,鱘科Acipenseridae,鱘屬Acipenser,是典型的江海洄游型魚類,為我國一級(jí)水生野生保護(hù)動(dòng)物。20世紀(jì)中后期以來,由于長江中大型水壩修建、水質(zhì)污染和航運(yùn)等人類活動(dòng)的影響,中華鱘天然種群逐漸衰退,洄游至產(chǎn)卵場(chǎng)的繁殖群體呈現(xiàn)出數(shù)量下降,雌雄性比失衡,繁殖規(guī)模減小,產(chǎn)卵活動(dòng)延遲等現(xiàn)象。2010年,經(jīng)世界自然保護(hù)聯(lián)盟(IUCN)重新評(píng)估,將中華鱘列入極危(CR)物種行列。近年來,中華鱘種群衰退的趨勢(shì)進(jìn)一步加劇,每年到達(dá)葛洲壩下產(chǎn)卵場(chǎng)的繁殖群體已不足50尾。更為嚴(yán)重的是,2013年、2015年和2017年的繁殖季節(jié),均未在長江中監(jiān)測(cè)到中華鱘的自然繁殖活動(dòng),中華鱘自然群體出現(xiàn)了偶發(fā)產(chǎn)卵現(xiàn)象,物種的生存與延續(xù)令人擔(dān)憂。本文對(duì)長江口中華鱘幼魚的生長食性和遺傳多樣性進(jìn)行了研究,以期為中華鱘的種群資源恢復(fù)和物種保護(hù)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.長江口中華鱘幼魚的生長和食性為了了解中華鱘幼魚群體在長江口的生長狀況,對(duì)2015年5~8月在長江口水域收集的中華鱘幼魚進(jìn)行了生長和食性的分析。結(jié)果表明,2015年長江口中華鱘幼魚的平均體長體重增長較快,從5月份的11.65±2.10 cm,10.82±6.32 g生長到8月份的27.78±3.36 cm,158.08±60.50 g,各月份的體重和體長均有顯著性差異(P0.05)。與2004年樣本數(shù)據(jù)相比,2015年中華鱘幼魚生長離散度大,群體顯示出較大的生長差異。對(duì)127個(gè)消化道樣本分析中華鱘幼魚的食物組成,共檢出餌料生物9類16種,中華鱘在河口期間主要的餌料生物為魚類、端足類和蟹類,多毛類和瓣鰓類等小型底棲生物也占有一定的比例。中華鱘幼魚的餌料生物隨著體長和年齡的增長而有所變化,體長20.0—24.9cm的個(gè)體主要以端足類、蟹類和瓣鰓類為食,體長25.0—34.9cm的個(gè)體攝食魚類、蝦蟹類的比重上升,體長35cm的個(gè)體中魚類成為主要的餌料生物;7月份胃含物中魚類的出現(xiàn)頻率百分比明顯高于6月份,中華鱘在生長過程中表現(xiàn)出對(duì)動(dòng)物性食物的攝食偏好,在長江口階段完成其食性轉(zhuǎn)變過程。單個(gè)樣本胃含物分析顯示,超過50%的胃含物樣本中僅含有1種餌料生物,暗示中華鱘幼魚在長江口餌料生物豐度不足,中華鱘表現(xiàn)出的生長差異很可能是餌料豐度不足的結(jié)果。2.基于線粒體D-loop區(qū)的長江口中華鱘幼魚遺傳多樣性研究為了及時(shí)掌握偶發(fā)產(chǎn)卵后中華鱘幼魚群體的遺傳多樣性水平及其變化,對(duì)2015年和2017年在長江口及附近水域收集到的中華鱘樣本進(jìn)行了線粒體D-loop區(qū)序列的比較分析。通過PCR擴(kuò)增及測(cè)序,2015年中華鱘幼魚樣本共獲得672條D-loop序列,共11個(gè)單倍型,2017年158條序列,共8個(gè)單倍型。2個(gè)年度樣本的單倍型多樣性(h)0.857±0.006,核苷酸多樣性(π)0.0102±0.0055,低于截流前數(shù)據(jù)。AMOVA分析將2個(gè)年度樣本歸為一組分析,群體間變異為8.30%,群體內(nèi)變異為91.70%,變異主要來源于群體內(nèi),Fst顯示中華鱘幼魚群體年度樣本間具有中等程度的分化現(xiàn)象。3.基于線粒體COⅠ序列的長江口中華鱘幼魚遺傳多樣性研究通過對(duì)2015年和2017年在長江口及附近水域收集的中華鱘樣本線粒體COⅠ序列的比對(duì)分析,2015年樣本獲得670條COⅠ序列,共7個(gè)單倍型,2017年樣本獲得151條序列,共5個(gè)單倍型。2個(gè)年度樣本的單倍型多樣性(h)0.358±0.021,核苷酸多樣性(π)0.00037±0.00038,遺傳多樣性水平較低。AMOVA分析將2個(gè)年度樣本歸為一組分析,年度樣本間變異為5.30%,群體內(nèi)變異為94.70%,群體內(nèi)變異大于群體間變異,基因流N_m1,年度樣本間具有一定的基因交流,Fst分析顯示中華鱘幼魚群體年度樣本間具有中等程度的分化現(xiàn)象。中性檢測(cè)結(jié)果Tajima’D和Fu’s F_s均為負(fù)值但不顯著(P0.05),COⅠ序列的進(jìn)化偏離了中性模式但未達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著水平,表現(xiàn)為負(fù)選擇。
【學(xué)位單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:

中華鱘,幼魚,月樣,江口


圖 2-1 野生中華鱘幼魚Fig.2-1 Wild juvenile A.sinensis from Yangtze Estuary表 2-1 2015 年長江口中華鱘中華鱘幼魚樣本Tab.2-1 Samples of juvenile A.sinensis from Yangtze Estuary in 20155 月 6 月 7 月 8 月樣本量 Sample 33 74 400 113

電泳圖,中華鱘,電泳,位點(diǎn)


上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文Arlequin3.1 軟件[83]進(jìn)行分子變異方差分析(AMOVA)評(píng)估群體間的遺傳變異。3.2 結(jié)果與分析3.2.1 序列變異特征分析中華鱘D-loop序列PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,顯示條帶大小為500bp左右(如圖 3-1)。本研究中華鱘樣本線粒體 D-loop 區(qū)可比序列長度為 462bp,其變異位點(diǎn) 26 個(gè)(包括插入和缺失位點(diǎn)),變異比率為 5.63%,其中簡約信息位點(diǎn) 8 個(gè),單變異位點(diǎn) 18 個(gè),變異多為轉(zhuǎn)換和顛換,有 1 個(gè)插入缺失位點(diǎn)(圖 3-2)。四種堿基 C、T、A 和 G 的平均含量分別為 17.54%、32.22%、26.83%和 23.41%。中華鱘幼魚線粒體 D-loop 的堿基組成具有較大的偏向性,C 的含量明顯低于其他 3 種堿基的含量,A+ T(59.05%)含量明顯高于 G + C(40.95%)。

序列,中華鱘,線粒體控制區(qū),位點(diǎn)


op序列PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,顯示)。本研究中華鱘樣本線粒體 D-loop 區(qū)可比序列(包括插入和缺失位點(diǎn)),變異比率為 5.63%,點(diǎn) 18 個(gè),變異多為轉(zhuǎn)換和顛換,有 1 個(gè)插入缺A 和 G 的平均含量分別為 17.54%、32.22%、26體 D-loop 的堿基組成具有較大的偏向性,C 的量,A+ T(59.05%)含量明顯高于 G + C(40圖 3-1 中華鱘部分個(gè)體的 D-loop 擴(kuò)增電泳結(jié)果3-1 mtDNA D-loop amplification of some A.sinensis indiv

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