牙鲆kiss2及其受體gpr54-2基因的分子鑒定及表達(dá)分析
【學(xué)位單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2015
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:
子量為 13.7 KD。通過(guò) BioEdit 軟件分析,在其第五和第十五個(gè)氨基酸之間有一個(gè)典型的疏水性區(qū)域。圖2-1 牙鲆kiss2基因序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列_表示信號(hào)肽;*表示終止密碼子;□表示加尾信號(hào)和Kisspeptin-10序列;◇表示蛋白水解切割位點(diǎn)Fig.2-1 Nucleotide and deduced amino acids sequences of P. olivaceus kiss2The putative signal peptide is underlined. The stop codon (TGA) is shown by asterisks (*). Thepolyadenylation signal (AATAAA) and putative Kisspeptin-10 region (FNYNPLTLRF) are boxed. Theproteolytic cleavage site (GKR) is marked as diamond.通過(guò)氨基酸比對(duì)發(fā)現(xiàn),牙鲆 kiss2 與條紋鱸(Morone saxatilis)的同源性最高,為 76%,接著是歐洲海鱸(Dicentrarchus labrax),為 74%;與帶點(diǎn)石斑魚(Epinephelus coioides)、(羅非魚(Oreochromis niloticus)和塞內(nèi)加爾鰨(Soleasenegalensis)的同源性依次為 72%、70%和 69%。而其與虹鱒(Oncorhynchus mykiss)、斑馬魚(Danio rerio)、鯽魚(Casrassius auratus)的同源性較低,依次為為 34%、28%和 25%,與巴西烏龜(Trachemys scripta elegans)和非洲爪蟾(Xenopus siluranatropicalis)的同源性也僅為 24%。然而,Kisspeptin-10 片段區(qū)域在脊椎動(dòng)物中高度
圖 2-2 牙鲆 kiss2 氨基酸序列比對(duì)分析顏色不同表示保守性不同;Kisspeptin-10區(qū)域用紅色的方框標(biāo)示。Fig.2-2 Alignment of amino acid sequences of P. olivaceus kiss2 and other species kiss2The identical, highly and less conserved amino acid residues are indicated by different colors,respectively. The Kisspeptin-10 regions are shown in boxes (color red).系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,脊椎動(dòng)物 Kisspeptins 分為兩支,即 Kisspeptin-1 和Kisspeptin-2。牙鲆 Kisspeptin 與脊椎動(dòng)物 Kisspeptin-2 聚為一支(圖 2-3)。
23圖 2-3 kiss1和kiss2氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2-3 Phylogenetic analysis of the deduced amino acid sequences of vertebrate kiskiss2 genes..3 牙鲆 gpr54-2 基因的克隆以牙鲆腦組織 RNA 為模板,首先進(jìn)行 gpr54-2 部分 cDNA 片段的 PCR 到長(zhǎng)度分別為 638bp、234bp 和 138bp 的 EST 序列;通過(guò) 3'-RACE PCR 得 793 bp 的序列,通過(guò) 5'-RACE PCR 得到長(zhǎng)度為 1114bp 的序列。經(jīng)過(guò)拼接長(zhǎng)度為 2556bp 的牙鲆 gpr54-2 cDNA 全長(zhǎng)序列(圖 2-4)。該序列包括 1143放閱讀框,899bp 的 5'非翻譯區(qū)(UTR)及 504bp 的 3'非翻譯區(qū),編碼 380酸。其蛋白具有 7 個(gè)跨膜區(qū)域。經(jīng)預(yù)測(cè)其氨基酸理論等電點(diǎn)為 9.01,分子0KD。
【共引文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2817820
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