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我國沿海棘頭梅童魚遺傳多樣性研究

發(fā)布時間:2020-08-20 19:59
【摘要】:棘頭梅童魚(Collichthys lucidus),隸屬硬骨魚綱(Osteichthyes),鱸形目(Perciformes),石首魚科(Sciaenidae),梅童魚屬(Collichthys),廣泛分布于我國沿海,為暖水性短距離洄游種,其肉質(zhì)細嫩而鮮美,具有極高的經(jīng)濟價值,是我國重要的小型底棲經(jīng)濟魚類。本研究利用傳統(tǒng)染色體核型分析、聚類分析、主成分分析和判別分析等多元分析方法和線粒體分子標記技術,從細胞、形態(tài)和分子水平分析棘頭梅童魚不同地理群體的遺傳結(jié)構(gòu),不僅對深入了解我國近海魚類資源現(xiàn)狀,特別是石首魚科的群體遺傳結(jié)構(gòu)具有極其重要的參考價值,而且為棘頭梅童魚種質(zhì)鑒定、資源有效管理和可持續(xù)利用提供科學數(shù)據(jù)。1.棘頭梅童魚染色體核型分析魚類染色體及其核型研究是魚類細胞遺傳學的主要內(nèi)容之一。以棘頭梅童魚(C.lucidus)為實驗材料,經(jīng)胸腔注射植物血球凝集素(PHA)和秋水仙素,取其頭腎組織,進行低滲、固定,采用空氣干燥法制片,吉姆薩染液染色,觀察棘頭梅童魚染色體核型和特征。結(jié)果顯示,棘頭梅童魚染色體數(shù)目為2n=48,占所觀察分裂相的83.3%;核型公式為2n=48t,染色體臂數(shù)NF為48,染色體相對長度范圍是(5.694±0.514)~(3.039±0.161),屬于鱸形目原始核型,且符合典型的高位類魚類核型特征。實驗中未發(fā)現(xiàn)與性別相關的異型染色體、次縊痕以及隨體等。本研究將為棘頭梅童魚種質(zhì)鑒定提供基礎數(shù)據(jù)。2.黃海、東海近海七個棘頭梅童魚地理群體的形態(tài)差異分析對2013年采自連云港、大豐、崇明、舟山、寧德、廈門和溫州等7個棘頭梅童魚群體共238個個體進行形態(tài)學比較研究,運用單因素方差分析、主成分分析、聚類分析和判別分析等多元統(tǒng)計分析方法對13項可量性狀以及20項框架參數(shù)進行形態(tài)差異分析。單因素方差分析結(jié)果顯示,7個地理群體之間確實存在顯著性差異;主成分分析得到的4個主成分對不同群體間總差異的貢獻率分別為53.131%、9.328%、4.249%和3.406%,累積貢獻率為70.113%,軀干部最能用以區(qū)分不同的地理種群;主成分分析和聚類分析結(jié)果基本一致,認為7個棘頭梅童魚地理群體在形態(tài)上不存在明顯的南北分化現(xiàn)象;以判別分析建立的判別函數(shù),對7個群體的綜合判別率為85.3%,判別準確率分別為62.5%~96.7%(P1),78.1%~90.6%(P2),舟山群體由于其特殊的地理因素,判別準確率較低。本研究為棘頭梅童魚地理種群判別、種質(zhì)資源保護以及良種選育等提供了基礎的形態(tài)學數(shù)據(jù)。3.基于線粒體控制區(qū)研究我國近海棘頭梅童魚群體遺傳結(jié)構(gòu)為了研究我國沿海棘頭梅童魚的種群遺傳結(jié)構(gòu),運用線粒體D-loop區(qū)全序列比較分析了我國連云港(LYG)、大豐(DF)、崇明(CM)、舟山(ZS)、溫州(WZ)、寧德(ND)、廈門(XM)棘頭梅童魚7個野生群體的遺傳結(jié)構(gòu)特征。7個群體共208個樣本的D-loop序列中,共檢測到83種單倍型,66個變異位點,堿基組成符合AT堿基偏好性特點。7個群體的單倍型多樣性為(0.554±0.00998)~(0.954±0.00067),核苷酸多樣性為0.00183~0.00708,說明我國沿海棘頭梅童魚遺傳多樣性較高,根據(jù)海洋魚類遺傳多樣性劃分的分布模式,符合高h低π特點,說明其經(jīng)歷了快速擴張期。群體總的遺傳分化系數(shù)Fst=0.86647(P=0),兩兩群體間的遺傳距離在0.004~0.039范圍內(nèi),且明顯的分為北方群體(LYG、DF、CM和ZS)和南方群體(WZ、ND和XM)。AMOVA分析顯示組間變異百分比為85.97%,符合南北分化特點;趩伪缎蜆(gòu)建的單倍型鄰接關系樹和單倍型簡約網(wǎng)絡圖等結(jié)果均表明,棘頭梅童魚以舟山為界,具有明顯的南北地理遺傳結(jié)構(gòu)。中性檢驗(Tajima’s D、Fu’s Fs)和錯配分析結(jié)果顯示,棘頭梅童魚可能經(jīng)歷了種群的規(guī)模性擴張或定向選擇。本研究結(jié)果為棘頭梅童魚資源的保護與利用提供了基礎數(shù)據(jù)。
【學位授予單位】:上海海洋大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S917.4
【圖文】:

梅童魚


圖 1-1 棘頭梅童魚Fig.1-1 The Collichthys clucidus 生活習性頭梅童魚主要分布在朝鮮和日本的西部及我國沿海的近海區(qū),短距離洄,對鹽度和溫度的適應范圍廣,屬溫水性魚類,主要以底棲生物和小魚4]。據(jù)研究,不同海域的棘頭梅童魚的產(chǎn)卵季節(jié)不一致,浙江海域每年的

梅童魚,中期分裂,核型,染色體


圖 2-1 棘頭梅童魚染色體中期分裂相(A)及核型(B)ig. 2-1 Metaphase chromosomes (A) and Karyotype (B) of Collichtys luci參考眾多鱸形目的染色體研究方法,確定低滲時間為 35 m重的應激反應,將 PHA 作用時間減短為 6 h。秋水仙素濃使染色體有不同程度的皺縮現(xiàn)象,反之,又很難富集中期度的秋水仙素處理,查閱石首魚科的染色體研究資料[68-69] 1 μg/g(魚的體重),將秋水仙素的作用時間分為兩種:2 h 和仙素處理 2 h 獲得的染色體分裂相理想。,隨著海水魚類養(yǎng)殖業(yè)迅速發(fā)展和研究深入,海水魚類染增加,據(jù)報道,已有 100 多種海水魚類染色體核型被研究水域的經(jīng)濟魚類[70、71],其中,鱸形目種類最多,如大黃魚帶石斑魚[74]等。小島吉雄通過對魚類染色體核型統(tǒng)計研究

樣本采集,地點


征[19、20]。采用框架法測量框架數(shù)據(jù),再加上傳統(tǒng)計分析方法,更能準確地不同地理群體間的形態(tài) 13 個可量性狀和 20 個框架數(shù)據(jù),以 4 種多元分分析、聚類分析和判別分析)對我國黃海、東海 異進行比較分析,旨在為其種質(zhì)資源評價、保護為今后棘頭梅童魚的產(chǎn)業(yè)化開發(fā)和資源增殖奠定為 2013 年 5 月至 2013 年 12 月采自我國黃海的連溫州、寧德和廈門(圖 3-1)。樣本采集地點、時間選取樣本均為同一區(qū)域捕撈所得,作為一個群體形判斷性別,故樣本均為雌雄混合樣本。

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本文編號:2798375

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