【摘要】：淡水蚌類是世界上受威脅最嚴(yán)重的生物類群之一。圓頂珠蚌廣泛分布于中國、朝鮮半島、日本以及俄羅斯東部,和其它淡水蚌一樣,圓頂珠蚌受人為干擾、寄主魚資源下降、涉水工程建設(shè)等因素影響,導(dǎo)致生境破碎化、生活史阻隔和資源量下降,也將影響其遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)。本研究基于微衛(wèi)星和線粒體分子標(biāo)記探討長江中下游主要湖泊圓頂珠蚌種群遺傳學(xué)及種群歷史動態(tài),旨在為我國淡水蚌類保護(hù)提供基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.基于13對微衛(wèi)星分子標(biāo)記分析了圓頂珠蚌7個地理種群(197個個體)的遺傳多樣性,結(jié)果顯示,7個地理種群共檢測到434個等位基因,平均等位基因數(shù)目范圍為3.231-5.692;平均有效等位基因數(shù)目范圍為2.223-2.538;平均期望雜合度范圍為0.442-0.531;平均觀測雜合度范圍為0.454-0.522;平均F_(is)范圍為-0.008-0.194;平均PIC范圍為0.435-0.477。HWE檢測顯示,7個地理種群共有28個位點(diǎn)偏離HWE。2.瓶頸效應(yīng)檢測結(jié)果顯示,IAM模型、TPM模型和Mode-shift檢測顯示多數(shù)種群未經(jīng)歷瓶頸效應(yīng);SMM模型僅有梁子湖種群未經(jīng)歷瓶頸效應(yīng)(P0.05)。所有個體作為單一種群時,IAM模型和Mode-shift檢測顯示未經(jīng)歷瓶頸效應(yīng),TPM模型和SMM模型檢測顯示經(jīng)歷瓶頸效應(yīng)。3.AMOVA分析結(jié)果顯示36%的變異來自圓頂珠蚌種群間,64%的變異來自群體內(nèi),同時在種群間Fst=0.36(P0.0001),說明圓頂珠蚌7個地理種群間存在明顯的遺傳分化。4.Structure聚類分析結(jié)果顯示洞庭湖種群、鄱陽湖種群和贛江種群聚為一支;洪澤湖種群、太湖種群和梁子湖種群聚為一支;仙女湖種群獨(dú)立為一支。主成分分析(PCoA)結(jié)果與Structure聚類分析結(jié)果一致。Mantel檢測結(jié)果顯示圓頂珠蚌7個地理種群間的遺傳距離和地理距離之間沒有顯著的相關(guān)性。長期基因流檢測發(fā)現(xiàn),基因流范圍為0.750-2.683,梁子湖種群與其他6個地理種群間的基因流小于該6個地理種群間的基因流,洞庭湖種群和贛江種群間的基因流最大。5.基于線粒體COI分子標(biāo)記分析圓頂珠蚌7個地理種群的遺傳多樣性,結(jié)果顯示,共發(fā)現(xiàn)37種單倍型。單倍型多態(tài)性范圍為0.857-0.975;核苷酸多態(tài)性范圍為0.00926-0.04592。微衛(wèi)星和線粒體分子標(biāo)記遺傳多樣性分析均顯示圓頂珠蚌7個地理種群具有較高的遺傳多態(tài)性水平。6.基于線粒體COI序列構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)圖,結(jié)果顯示,梁子湖種群有5個特有單倍型;洞庭湖種群有4個特有單倍型;鄱陽湖種群有1個特有單倍型;贛江種群有8個特有單倍型;仙女湖種群有1個特有單倍型;洪澤湖種群有3個特有單倍型,太湖種群有4個特有單倍型。單倍型H16的個體分布頻率最高,其次是H11和H18;23種單倍型分布頻率都特別低,為稀有單倍型。7.基于COI序列對圓頂珠蚌7個地理種群進(jìn)行AMOVA分析,結(jié)果顯示,11.99%的變異來自圓頂珠蚌群體間,88.01%的變異來自群體內(nèi),同時在種群間F_(st)=0.1874(P0.0001),說明圓頂珠蚌7個地理種群間存在明顯的遺傳分化。Mantel檢測結(jié)果顯示,r=0.024,P=0.50200.05。表明圓頂珠蚌7個地理種群間的遺傳距離和地理距離之間沒有顯著的相關(guān)性。8.依據(jù)所得到的單倍型構(gòu)建貝葉斯樹,結(jié)果顯示,鄱陽湖種群、洞庭湖種群和贛江種群多數(shù)單倍型聚為一支,太湖種群和洪澤湖種群聚為一支,仙女湖種群與贛江種群和鄱陽湖種群部分單倍型聚為一支,梁子湖種群和贛江種群部分單倍型聚為一支。9.中性檢驗(yàn)結(jié)果顯示,圓頂珠蚌7個地理種群所有個體的Tajima’s D和Fu's FS均小于0,兩者都未達(dá)到顯著水平,表明種群沒有經(jīng)歷過擴(kuò)張。失配分布分析結(jié)果顯示,7個地理種群所有個體的失配分布表現(xiàn)為多峰,表明種群沒有經(jīng)歷過擴(kuò)張,與中性檢驗(yàn)結(jié)果一致。更深入的種群動態(tài)分析顯示,在歷史上,7個地理種群歷史動態(tài)穩(wěn)定。因此,中性檢驗(yàn)、失配分布和種群歷史動態(tài)分析的結(jié)果一致。
【學(xué)位授予單位】：南昌大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S917.4
【圖文】：

14圖 2.1 引物 Udo11 的部分 STR 掃描檢測圖Fig 2.1 Figure of microsatellite primers of Udo11 based on STR test2.2 多態(tài)微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳特性分析STR 掃描檢測結(jié)果篩選 14 對具有多態(tài)性的圓頂珠蚌微衛(wèi)星引物。見表 2.3和表 2.4，利用 Popgene1.32 軟件對 14 對微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行遺傳參數(shù)分析，結(jié)果顯示，等位基因數(shù)目范圍為 2-16，其中位點(diǎn) Udo14 等位基因數(shù)目最多，16 個；觀測雜合度（HO）范圍為 0.350-0.775，其中 Udo5 的觀測雜合度最高，0.775，

圖 3.1 圓頂珠蚌采樣圖Fig 3.1 Locations of sampling sites for U. douglasiae1.2 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑參照第二章 1.21.3 實(shí)驗(yàn)方法參照第二章 1.3。并從中篩選出 13 對多態(tài)性高，擴(kuò)增穩(wěn)定的微衛(wèi)星引物(Udo1-Udo12, Scastt17)。

表明洪澤湖、太湖和梁子湖種群遺傳結(jié)構(gòu)相似；仙女湖種群獨(dú)立分為一支（圖3.2）。圖 3.2 圓頂珠蚌 7 個地理種群 Structure 聚類分析Fig3.2 STRUCTURE bar plots for seven U. douglasiae collection sites in the middle and lowerreaches of Yangtze River.

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本文編號：2797626