【摘要】：大刺鰍(Mastacembelus armatus)隸屬于合鰓目(Symbranchiformes)刺鰍科(Mastacembelidae)刺鰍屬(Mastacembelus),是一種很重要的經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)。本研究利用大刺鰍近緣種的ESTs序列,開(kāi)發(fā)核基因序列標(biāo)記,利用核基因序列標(biāo)記聯(lián)合線粒體序列標(biāo)記,對(duì)華南及鄰近地區(qū)的大刺鰍的遺傳多樣性,遺傳結(jié)構(gòu),親緣關(guān)系進(jìn)行探討,為大刺鰍的種質(zhì)資源保護(hù)提供基礎(chǔ)資料,同時(shí)探討了亞洲刺鰍屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。研究結(jié)果如下:1.利用黃鱔的EST序列與參考基因組進(jìn)行比對(duì),篩選出可以用于大刺鰍群體分析的EPICs引物,總共篩選了52對(duì)EPICs的引物,其中,穩(wěn)定擴(kuò)增的有26對(duì),可用于大刺鰍群體分析的有7對(duì)。這7對(duì)引物的平均遺傳距離在0.250~1.222之間,平均核苷酸差異數(shù)在0.222~1.222之間。本研究的引物開(kāi)發(fā)方法可以快速找到適合種群研究的核基因序列標(biāo)記,是一種簡(jiǎn)單快捷的開(kāi)發(fā)方法。2.基于線粒體COI對(duì)不同野生群體進(jìn)行分析,探討不同群體的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)地理學(xué)。華南及鄰近地區(qū)9個(gè)群體的大刺鰍總體的Hd=0.768,Pi=0.00578,顯示出較高的遺傳多樣性。仁化和恩平群體的單倍型多樣性較高,核苷酸多樣性也高。龍巖、增城和紅河群體單倍型多樣性高,核苷酸多樣性較低。五華、潮州和百色的單倍型多樣性和核苷酸多樣性都低。龍巖、五華、潮州和增城群體與其它群體出現(xiàn)高度分化,可能原因是由韓江水系的特殊地理位置造成的。3.本研究用自主研發(fā)的兩對(duì)EPICs和一對(duì)內(nèi)含子標(biāo)記LWS核基因序列標(biāo)記,對(duì)大刺鰍群體進(jìn)行群體遺傳學(xué)、系統(tǒng)發(fā)生學(xué)和親緣地理學(xué)分析。由聯(lián)合序列(mtDNA和nDNA)構(gòu)建的最大似然樹(shù)可知,可以分為三支。其中,龍巖、五華、潮州和增城可以為一支,仁化、恩平和紅河為一支,屯昌單獨(dú)為一支�；谶z傳距離的AIS分析發(fā)現(xiàn),東西部之間產(chǎn)生了明顯的遺傳分化。南渡江與其它群體在群體遺傳結(jié)構(gòu)中,屬于陸島模式,基因流主要是陸地流向島嶼。推測(cè)紅河群體可能為大刺鰍的擴(kuò)散中心,一方面經(jīng)珠江水系向東擴(kuò)散,另一方面由北部灣沿海區(qū)域擴(kuò)散至南渡江。環(huán)境因子的相關(guān)分析表明,觀測(cè)雜合度與累年年最多降水量和累年年降水量平均差顯著相關(guān)。4.探究了EPICs引物在近緣種中的擴(kuò)增效率,發(fā)現(xiàn)在4種刺鰍科魚(yú)類(lèi)中的擴(kuò)增效率整體大于50%。利用核基因(S7)來(lái)探究刺鰍屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,發(fā)現(xiàn)明顯分為4個(gè)支系,且大刺鰍與網(wǎng)紋刺鰍(M.favus)的親緣關(guān)系較近。
【學(xué)位授予單位】：廣州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4
【圖文】：

圖 1-1 大刺鰍的世界分布gure1-1: The entire distribution of Mastacembelus armatus in global scale.The map derived from http://www.discoverlife.org.

大刺鰍側(cè)面圖

圖 2-1 大刺鰍采樣地點(diǎn)示意圖Figure 2-1 Sampling sites of M. armatus注：本圖為五個(gè)省份（云南省、廣東省、廣西壯族自治區(qū)、海南省和福建�。┑慕厝〔糠趾筒糠趾恿�。Note: this picture is the interception part of five provinces (Yunnan, Guangdong, the

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2782554