【摘要】：本研究以普通刺參和選育的白刺參為研究對(duì)象,一方面利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記研究了普通刺參群體和白刺參群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),分析其遺傳差異;另一方面利用甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技術(shù)對(duì)普通刺參和白刺參的不同組織DNA甲基化模式進(jìn)行了研究,探討白刺參體色與基因組DNA甲基化之間的關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:1.普通刺參和白刺參遺傳變異的SSR分析應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)對(duì)普通刺參群體(Apostichopus japonicus)和白刺參群體遺傳多樣性進(jìn)行了分析。應(yīng)用14對(duì)微衛(wèi)星引物對(duì)2群體進(jìn)行擴(kuò)增,每個(gè)座位檢測(cè)到的等位基因數(shù)為3~6個(gè)。白刺參和普通刺參群體的多態(tài)信息含量(PIC)平均值分別為0.6465和0.6212,觀測(cè)雜合度平均值(Ho)分別為0.7619和0.8286,期望雜合度平均值(He)分別為0.7218和0.6895。結(jié)果表明:白刺參群體相比于普通刺參群體存在雜合度降低,遺傳多樣性下降的現(xiàn)象。2個(gè)群體在Hardy-Weinberg平衡條件下,進(jìn)行了P測(cè)試,發(fā)現(xiàn)均存在顯著偏離現(xiàn)象。F-檢驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示2個(gè)群體發(fā)生了不同程度的雜合子缺失,對(duì)2個(gè)群體進(jìn)行了配對(duì)Fst值計(jì)算,發(fā)現(xiàn)2個(gè)群體的遺傳分化指數(shù)較小,說明遺傳分化較弱,遺傳變異大部分源于群體內(nèi)的不同個(gè)體間。遺傳距離及遺傳相似性結(jié)果顯示2個(gè)群體間的遺傳分化還未達(dá)到種群的劃分標(biāo)準(zhǔn)。2.普通刺參和白刺參不同組織基因組DNA的MSAP研究應(yīng)用MSAP技術(shù)對(duì)普通刺參和白刺參體壁、呼吸樹和消化道3個(gè)組織的DNA甲基化水平和甲基化模式進(jìn)行了研究,初步探討了DNA甲基化對(duì)刺參組織間基因特異性表達(dá)的影響。結(jié)果顯示,篩選得到的9對(duì)引物組合能夠在普通刺參和白刺參兩個(gè)群體中得到穩(wěn)定擴(kuò)增,在兩群體中分別檢測(cè)到5932和5208個(gè)位點(diǎn),均以未甲基化位點(diǎn)為主,普通刺參和白刺參未甲基化位點(diǎn)數(shù)分別為4317和3944,分別占總擴(kuò)增條帶數(shù)的72.78%和75.73%。普通刺參體壁的甲基化水平為31.07%,呼吸樹為23.36%,消化道為26.34%;白刺參中體壁的甲基化水平為29.88%,呼吸樹為23.25%,消化道為19.45%,體壁的甲基化率在兩群體中都是最高的。普通刺參和白刺參同一組織間的甲基化水平和甲基化模式不同,同一群體體壁、呼吸樹和消化道不同組織間的甲基化水平和模式也不同。在檢測(cè)的3個(gè)組織中,5甲基胞嘧啶的半甲基化水平均較全甲基化水平低。甲基化可能在普通刺參和白刺參組織分化和發(fā)育過程中發(fā)揮著很重要的作用。
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S917.4
【圖文】：

33圖 4-1 不同引物組合在刺參基因組 DNA 中的 MSAP 圖譜g.4-1 An example of DNA methylation profiles in Apostichopus japonicus using diffeimers pairs型：全甲基化位點(diǎn)；Ⅱ型：半甲基化位點(diǎn)；Ⅲ型：去甲基化位點(diǎn)，泳道 t1、h1、c1代表刺參的體壁、呼吸樹、消化道；泳道 t2、h2、c2代表白刺參的體壁、呼吸樹、消化道style: fully methylated; Ⅱstyle: hemi-methylated; Ⅲ style: unmethylated, Lane t1, h1, anpresent body wall, respiratory tree, and digestive tract of A. japonicas; Lane t2, h2, anpresent body wall, respiratory tree, and digestive tract of white A. japonicas.5.3 不同組織間基因組 DNA 甲基化水平差異

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本文編號(hào)：2768700