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草魚p53介導(dǎo)的NF-κB與PKR的轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-13 16:55
【摘要】:p53,是一種重要的腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene),同時(shí)也是一種重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,其通過調(diào)控一系列不同的靶基因來發(fā)揮其不同的生理功能,如誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡、參與細(xì)胞周期調(diào)控以及抗病毒反應(yīng)等。NF-κB是一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,能夠調(diào)節(jié)一系列基因表達(dá)參與細(xì)胞增殖分化、炎癥反應(yīng)、先天免疫以及凋亡等生理過程。PKR是先天免疫抗病毒信號(hào)通路中一種重要的效應(yīng)蛋白,且作用機(jī)制研究的比較透徹。魚類p53在先天免疫中的作用也逐漸被報(bào)道。但對(duì)于p53與NF-κB、PKR之間的相關(guān)研究報(bào)道甚少。因此,本文主要為了研究p53所介導(dǎo)的NF-κB/PKR兩者之間的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,從而進(jìn)一步表明p53在魚類先天免疫反應(yīng)的重要地位。為了研究草魚(Ctenopharyngodon idella)p53(Cip53)在先天免疫信號(hào)通路中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,我們首先克隆與鑒定了草魚p53基因的全長cDNA序列(KX871190)及其啟動(dòng)子序列。Cip53全長cDNA為1879bp,包括1個(gè)146bp的5'非翻譯區(qū)、1個(gè)617bp的3'非翻譯區(qū)和1個(gè)編碼371個(gè)氨基酸的1116bp的開放閱讀框;Cip53蛋白結(jié)構(gòu)包含一個(gè)DNA結(jié)合區(qū)域與位于C端的寡聚化區(qū)域。Cip53啟動(dòng)子為距離轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游991bp的序列,其中包括Rel-A、IRF3、XBP-1及p53潛在調(diào)控位點(diǎn)。通過熒光定量PCR實(shí)驗(yàn),我們分析了在poly I:C刺激之后p53在草魚不同組織以及草魚腎細(xì)胞(CIK)中的表達(dá)特征。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明Cip53在草魚所測各個(gè)組織(腦、眼、皮、鰓、脾、腎)中,在6h與24h、48h均出現(xiàn)表達(dá)上調(diào);且在CIK細(xì)胞中刺激6h后出現(xiàn)大幅度上調(diào)。另外,通過體外非放射性凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)分析了Cip65蛋白與Cip53啟動(dòng)子的親和性以及Cip53蛋白與Ci PKR啟動(dòng)子的親和性,結(jié)果分別表明Cip65能夠明顯阻滯Cip53啟動(dòng)子片段遷移,且Cip53能夠明顯阻滯Ci PKR啟動(dòng)子片段遷移。說明Cip53能夠被Cip65所調(diào)控,且Cip53是CiPKR潛在的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。本研究還通過構(gòu)建了真核表達(dá)載體pCDNA3.1-Cip65與pGL-Cip53啟動(dòng)子報(bào)告載體以及pCDNA3.1-Cip53與pGL-CiPKR,然后分別瞬時(shí)轉(zhuǎn)染于CIK細(xì)胞中,雙熒光素酶活性實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明Cip65能夠激活Cip53的轉(zhuǎn)錄且Cip53能夠顯著激活CiPKR的轉(zhuǎn)錄。為了進(jìn)一步分析Cip53在Cip65與CiPKR之間的轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)系,本研究還通過設(shè)計(jì)了敲降Cip53的si RNA,通過干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在Cip53在轉(zhuǎn)錄水平被顯著敲低后,Cip65與CiPKR的轉(zhuǎn)錄水平也顯著降低。表明p53參與了NF-κB和PKR所介導(dǎo)抗病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。綜上所述,通過對(duì)Cip53在先天免疫信號(hào)通路的轉(zhuǎn)錄機(jī)制分析,體現(xiàn)了Cip53在魚類抗病毒作用過程的重要地位。
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S917.4
【圖文】:

示意圖,蛋白結(jié)構(gòu),文獻(xiàn),結(jié)構(gòu)示意圖


圖 1.1 人 p53 蛋白結(jié)構(gòu)示意圖(引自文獻(xiàn)[51])Figure 1.1 The structure of human p53 protein p53 的生物學(xué)功能

草魚,片段,基因序列分析


.圖 3.1 草魚 p53 基因 RACEFig. 3.1 Race of Cip53 gene) M:DL5000 分子量標(biāo)準(zhǔn);1:Cip53 ORF 片段。(B) M:DL5000 分子量標(biāo)準(zhǔn);1:Cip5'RACE 片段。(C) M:DL5000 分子量標(biāo)準(zhǔn);1:Cip53 3'RACE 片段。.1.2 草魚 p53 基因序列分析

草魚,定量表達(dá)


30圖 3.5 草魚 p53 基因的定量表達(dá)分析Figure 3.5 Quantitative Expression Analysis of Cip53(A) poly I:C 刺激后草魚 p53 基因的組織表達(dá)。經(jīng) poly I:C 刺激后的草魚各組織(腦、眼、皮、鰓、脾、腎),qRT-PCR檢測草魚 p53在各組織中的表達(dá)量。以 0h眼的 Cip53相對(duì)于內(nèi)參β-acti的表達(dá)量值設(shè)為 1 作為對(duì)照;實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)為三次獨(dú)立重復(fù)實(shí)驗(yàn)的平均值。(B) poly I:C 刺激后草魚 p53 基因在 CIK 細(xì)胞中的表達(dá)。CIK 經(jīng) 10μL poly I:C(1mg/mL)刺激后,qRT-PCR 檢測在不同時(shí)間點(diǎn)(0h,6h,12h,24h,48h,72h)的 Cip53mRNA 的表達(dá)量。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)為三次獨(dú)立重復(fù)實(shí)驗(yàn)的平均值。*表示差異顯著(p <0.05),**表示極顯著性差異(p <0.01)。poly I:C 刺激 CIK 細(xì)胞后,qRT-PCR 結(jié)果顯示 Cip53 的表達(dá)水平提高,刺激6h 后表達(dá)量增高,持續(xù)在 12h 達(dá)到峰值后到 72h 逐漸回落 (圖 3.5 B)。3.4 草魚 p65 與 p53 的啟動(dòng)子及草魚 p53 與 PKR 的啟動(dòng)子親和性分析3.4.1 草魚 p65 與 p53 啟動(dòng)子的非放射性凝膠阻滯分析由實(shí)驗(yàn)室保存的 Cip65 以及 Cip65- N 與 Cip65- C 的蛋白(圖 3.6 A),通過

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本文編號(hào):2753726

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