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淇河鯽組蛋白H2B和HLP1的克

發(fā)布時間:2020-07-05 16:43
【摘要】:水產動物疾病防控一直是漁業(yè)生產關注的焦點?股厥羌毦约膊》揽氐挠行幬,但長時間使用,會使病原體產生耐藥性。因此,篩選抗生素替代品,有效控制細菌性疾病是疾病防控的重要內容?咕氖且活惥哂锌咕钚缘年栯x子多肽,可有效殺滅細菌,避免產生耐藥性,具有替代抗生素的潛在價值。本研究通過克隆淇河鯽(Carassius auratus)組蛋白H2B基因的全長序列,并提取HLP 1對應的編碼區(qū)N端部分序列,對其分子特征進行分析;采用熒光定量PCR方法,對H2B組織表達及對嗜水氣單胞菌的響應進行研究;對HLP 1原核重組表達和人工合成HLP 1的抑菌活性進行研究。基于叉尾洶(Letalurus punetaus)編碼區(qū)保守序列設計引物。從淇河鯽鰓、腎、脾和肝中提取總RNA,通過RT-PCR技術獲得c DNA第一鏈作為模板,擴增出淇河鯽H2B基因中間片段,將片段連接到p MD 19-T載體,轉化至大腸桿菌感受態(tài)DH5α中,克隆測序獲得H2B中間片段長375 bp。根據已獲得H2B中間片段,分別設計一組用于3?UTR和5?UTR擴增的特異性引物,通過巢式PCR方法分別擴增出3?UTR 410 bp和5?UTR 32bp的片段,拼接得到淇河鯽組蛋白H2B基因全長817 bp。ORF Finder預測組蛋白H2B ORF長375 bp,編碼134個氨基酸。在線軟件預測組蛋白H2B分子量為13.61 k Da,等電點PI值為10.37,帶有18個正電荷,為不穩(wěn)定蛋白質。組蛋白H2B二級結構中含較多α螺旋和無規(guī)則卷曲,少量β折疊和延伸鏈。使用Bio Edit分析包括親緣關系較遠的斑馬紋草雀(Taeniopygia guttata)在內的14個物種的H2B編碼區(qū)序列發(fā)現,它們和淇河鯽的同源性都在75%以上,其中與斑馬魚((Danio rerio)同源性更是高達90.7%。HLP 1是組蛋白H2B N末端21個氨基酸組成的多肽,含有豐富的堿性氨基酸。根據組蛋白H2B序列設計特異性引物擴增出HLP 1,并成功構建重組表達質粒PET-32a-HLP 1,轉化大腸桿菌感受態(tài)細胞BL21(DE3),篩選出陽性菌落加入到含AMP的LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)至菌液OD600nm在0.6-0.8之間,經IPTG誘導培養(yǎng)后沉淀、洗滌、裂解菌體,收集裂解液,然后通過SDS-PAGE凝膠電泳,成功檢測出融合蛋白。采用RT-q PCR方法檢測了淇河鯽組蛋白H2B及HLP 1基因在鰓、腎臟、脾臟、肝臟和頭腎中的表達,正常情況下組蛋白H2B m RNA在肝臟中表達量最高,腎臟和頭腎次之,在鰓和脾臟中表達量較少,HLP1在頭腎中表達量最高,肝臟次之,其余組織中的表達水平和H2B相似。魚體注射嗜水氣單胞菌后48 h內,H2B和HLP 1 m RNA表達量在各組織中明顯上調。人工合成淇河鯽多肽HLP 1,將HLP 1以2倍濃度梯度稀釋為200μg/m L、100μg/m L、50μg/m L和25μg/m L,隨著HLP 1濃度的升高,抑菌圈直徑逐漸擴大,且25 ug/ml HLP 1即能達到100mg/m L氨芐的抗菌水平,說明HLP 1抗菌活性很高,其在水生動物特別是魚類抗病和免疫中能起到重要作用。
【學位授予單位】:河南師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
【圖文】:

淇河,瓊脂糖凝膠,質量濃度,瓊脂糖凝膠電泳


、腎、脾中提取總 RNA,使用 1.5%瓊脂糖凝膠s 比較亮,5 s 比較弱(圖 2-1),說明 RNA 提取果顯示鰓、腎、脾的質量濃度分別為 1021 ng/μL/280nm都在 1.8-2.0 之間。

組蛋白


組蛋白H2B的5RACE克隆和3RACE克隆

【參考文獻】

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