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羅非魚集約化養(yǎng)殖池塘中nifh-基因編碼固氮細菌的群落結(jié)構(gòu)多樣性的鑒定和分類

發(fā)布時間:2020-06-10 18:36
【摘要】:本文調(diào)查研究水體、沉積物和土壤(來自中國江蘇宜興三個不同強度單養(yǎng)、混養(yǎng)的奧利亞羅非魚池塘)固氮相關(guān)的微生物群落和特性。這些微生物被認為可以顯著減少、消除硝態(tài)氮淋失或在水產(chǎn)養(yǎng)殖設施中產(chǎn)生污染進而促進植物生長。專注提高魚的產(chǎn)量,我們選擇生物學方法提高水質(zhì)量和獲取環(huán)境效應的信息,研究促進植物(蔬菜)生長和魚類生產(chǎn)相關(guān)的微生物功能機制的特征和定義。illumina公司采用功能基因分析方法進行菌種鑒定,通過探究DNA序列基因確定細菌總數(shù),進而進行環(huán)境細菌分布評估。在池塘1,2(單一系統(tǒng))和池塘3(混養(yǎng)系統(tǒng))中微生物群落的nifH-基因編碼被認為能促進植物生長,減少池塘硝態(tài)氮和含氮廢物污染,根據(jù)分類學確定他們最可能的屬為固氮螺菌屬,固氮弓菌屬,厭氧粘細菌,固氮菌屬,地桿菌屬,紅微菌屬,脫硫桿菌屬,脫硫球莖菌屬,脫硫弧菌屬,甲基單胞菌屬,莢硫菌屬和無類別的豐佑菌科。夏天生化指標定義池塘退化被認為與不同池塘微生物群落有關(guān),確定環(huán)境因素對固氮細菌存活的影響。記錄月平均溫度范圍(27.3-34.2℃),溶解氧(6.31-8.99mg/L),pH值(7.18-7.98)觀察池塘最優(yōu)養(yǎng)殖。營養(yǎng)水平顯著差異P0.05)的池塘間,研究的環(huán)境因素中,氨氮是記錄的對群落影響最大的指標,在1,2,3不同池塘水體微生物中有顯著的差別,分別為3.18,1.98 and 3.41 mg/L.不同水體中化學需氧量(P0.05)分別為14.06,14.28 and 12.16 mg/L;沉積物和泥土中總有機碳(P0.05)含量在1,2,3,池塘中分別為4.33,4.93 and 4.16 mg/kg,表明池塘系統(tǒng)中能量呈上升趨勢。在 1,2,3 濕重分別為 3.02 x 107,4.06 x 107 and 4.85 x 107 copies/g 池塘中,建立沉積物土壤豐度的微生物編碼nifH基因的結(jié)果定量分析;在同樣的池塘中建立水體微生物豐度濕度分別為3.65 x 10~6,2.66 x 10~6 and 3.11 x 10~6 copies/g。更進一步研究線性判別分析影響大小,沉積物和泥土微生物高維類比較宏基因組分析結(jié)果在1,2,3池塘中分別為19,17,11演化支,同時表明在三個池塘水體中著色菌科屬和莢硫菌屬是最接近的屬。沙土壤微生物群落中的冗余分析(RDA)測試表明,總磷和有機物質(zhì)是塑造細菌群落最重要的因子;與此相反,水體測試表明氨氮,總磷,溶解氧是塑造細菌群落的重要因子。研究結(jié)果表明養(yǎng)殖密度為1800或者每畝更少,M不是規(guī)范nifH基因編碼豐度的限定因素。這些研究為進一步調(diào)研鑒定微生物催化氧化酶到種的階段提供依據(jù),為更廣泛適應養(yǎng)殖提供平臺。
【學位授予單位】:南京農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S917.1

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本文編號:2706692

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