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河蟹血細(xì)胞中螺原體侵染相關(guān)蛋白篩選及Rab7、14-3-3蛋白功能研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-25 05:20
【摘要】:中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)俗稱河蟹,是一種重要的淡水養(yǎng)殖種類,在我國的淡水養(yǎng)殖業(yè)中占有很大的比重。目前,在中國江蘇省河蟹養(yǎng)殖是一個(gè)快速發(fā)展的行業(yè),每年的產(chǎn)值在40億美元左右。然而,隨著其養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大及集約化程度的提高,一些由細(xì)菌、病毒和寄生蟲引起的疾病嚴(yán)重阻礙了河蟹養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展,并造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。中華絨螯蟹顫抖病就是其中最嚴(yán)重的病害之一,而中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma eriocheiris)是引發(fā)該病的一種新型病原微生物。前期的研究證實(shí),該病原主要通過河蟹的鰓或者體表進(jìn)入到宿主的體內(nèi),并首先侵染其靶細(xì)胞—血細(xì)胞,在血細(xì)胞中大量繁殖并伴隨著血液循環(huán)進(jìn)而侵染河蟹的神經(jīng)、肌肉等組織,最終引起河蟹附肢的顫抖并最終導(dǎo)致宿主死亡。河蟹血細(xì)胞作為該病原重要的靶細(xì)胞,其必定在宿主對該病原的免疫中發(fā)揮重要的作用,因此,探究螺原體侵染河蟹血細(xì)胞的機(jī)制以及河蟹的免疫防御機(jī)制,對減少該病原對河蟹養(yǎng)殖業(yè)的危害具有重要的意義。本碩士學(xué)位論文在目前已有的研究基礎(chǔ)上,首先,通過相對定量和絕對定量同位素標(biāo)記(isobaric tags for relative and absolute quantization iTRAQ)和液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(liquid chromatographytandem mass spectrometry LC-MS/MS)技術(shù),篩選中華絨螯蟹螺原體感染10天后河蟹血細(xì)胞中差異表達(dá)的蛋白,并通過蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析該病原可能存在的侵染機(jī)制以及宿主對該病原免疫防御機(jī)制。其次,通過分析差異表達(dá)蛋白,挑選兩種蛋白(Rab7和14-3-3)通過基因克隆、蛋白表達(dá)、抗體制備等,進(jìn)一步研究這兩種蛋白在病原的侵染和宿主的免疫機(jī)制當(dāng)中發(fā)揮的作用。本論文為進(jìn)一步探究中華絨螯蟹螺原體侵染河蟹的分子機(jī)制以及河蟹的免疫機(jī)制提供堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),并為進(jìn)一步減少螺原體對河蟹養(yǎng)殖業(yè)的危害提供理論依據(jù),該論文主要從以下三個(gè)方面來開展研究:1. iTRAQ篩選螺原體感染前后中華絨螯蟹血細(xì)胞的差異蛋白本實(shí)驗(yàn)通過iTRAQ技術(shù)篩選螺原體感染前后河蟹血細(xì)胞差異表達(dá)的蛋白,初步鑒定這些蛋白,根據(jù)功能分為免疫相關(guān)蛋白、生理相關(guān)蛋白以及細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白等等。本實(shí)驗(yàn)選擇差異倍數(shù)≥1.2的蛋白進(jìn)行功能分析,實(shí)驗(yàn)中篩選出來的具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異蛋白(上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白)一共有76種。其中上調(diào)蛋白有35種,下調(diào)蛋白有41種,在這些差異表達(dá)的蛋白中大約有20種是與免疫相關(guān)的蛋白。上調(diào)蛋白包括谷胱甘肽轉(zhuǎn)氨酶(prostaglandin D synthase, GST),鐵蛋白(ferritin)和熱休克60(heat shock protein 60, HSP60)等。下調(diào)蛋白包括兩種凝集素蛋白(mannosebinding protein and hemocytin)、三種絲氨酸蛋白酶抑制劑蛋白(two serpins and pacifastin)、三種不同的絲氨酸蛋白酶等等。選擇其中的8種蛋白(a2M, GST, ferritin, tubulin, crustin, thioredoxin, clip domain serine protease and serpin),通過實(shí)時(shí)定量PCR (qRT-PCR)的方法檢測其對應(yīng)蛋白在基因水平的變化,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明除了tubulin其余的結(jié)果都與iTRAQ篩選結(jié)果基本保持一致。2.Rab7基因克隆、蛋白原核表達(dá)及相關(guān)功能研究Rab7屬于小G蛋白家族中的一種,近期的研究表明Rab蛋白在甲殼類的先天性免疫當(dāng)中發(fā)揮著重要作用。本研究為了進(jìn)一步驗(yàn)證iTRAQ篩選的Rab7蛋白表達(dá)變化以及進(jìn)一步揭示該蛋白在河蟹的免疫反應(yīng)當(dāng)中發(fā)揮的作用。本實(shí)驗(yàn)首先通過RACE技術(shù)擴(kuò)增了Rab7的基因全長,并成功在體外完成原核表達(dá)、純化以及多克隆抗體的制備。qRT-PCR檢測在螺原體的感染下Rab7 mRNA表達(dá)變化,通過Western blot技術(shù)檢測在螺原體的感染下河蟹血細(xì)胞當(dāng)中Rab7蛋白的表達(dá),其結(jié)果與iTRQA基本一致。這一結(jié)果進(jìn)一步說明了Rab7在河蟹應(yīng)對螺原體的感染中發(fā)揮重要作用。3.14-3-3基因克隆、蛋白原核表達(dá)及相關(guān)功能研究14-3-3蛋白是一類酸性可溶性蛋白并且在真核生物中有著廣泛的分布,最近的研究表明14-3-3蛋白在甲殼類的先天性免疫過程當(dāng)中發(fā)揮重要作用。本研究為了進(jìn)一步驗(yàn)證iTRAQ中得到的14-3-3蛋白的表達(dá)變化并進(jìn)一步揭示該蛋白在河蟹的免疫反應(yīng)當(dāng)中的作用。首先,通過PCR技術(shù)克隆14-3-3的基因,并對序列進(jìn)行分析。其次,成功在體外完成該蛋白的原核表達(dá),純化以及多克隆抗體的制備純化。qRT-PCR技術(shù)檢測在螺原體的感染下14-3-3mRNA的表達(dá)變化,通過Western blot檢測該蛋白在螺原體感染后在河蟹血細(xì)胞當(dāng)中表達(dá)變化。這一結(jié)果進(jìn)一步說明14-3-3在河蟹應(yīng)對螺原體的感染中發(fā)揮重要作用。
【圖文】:

譜圖,種類,縱坐標(biāo),橫坐標(biāo)


圖2.1橫坐標(biāo)為鑒定種類,縱坐標(biāo)為鑒定數(shù)量。Total邋spectra代表的是二級譜圖總數(shù),Spe代表的是譜圖數(shù)量,Unique邋Spectra代表的是匹配到特有肋段,Peptide代表的是鑒定到段,Unique邋Peptide代表的是鑒定到特有肋段,Protein代表的是鑒定到的蛋白質(zhì)。逡逑Fig.2.1邋Basic邋information邋statistics邋of邋proteome邋profile邋by邋iTRAQ.邋Total邋spectra邋are邋化e邋secondmass邋spectrums,邋and邋spectra邋are邋化e邋secondary邋mass邋spectmms邋after邋quality邋control.邋UniquePeptide邋is邋the邋identified邋peptides邋which邋belong邋only邋to邋a邋group邋of邋proteins,邋and邋Protein邋is邋thidentified邋protein.逡逑A邋巧0邋廣邐邐邐邐邐邐邐邐邐逡逑巧.邐I邋t邋?邐...邋i*邋?邋i.:.邋"t邋邋邋KK邋1邐i.j邋■邋*邋w:.邋*邋4>.k邋,>‘.I邋?*??!??邋1!邋.邋1ft邋ii:邋.邋-邋>邋r邋>.#.邋i邋\邋?邋)、.&?:、.逡逑—邋一邐一邐?4-M邋??邋C一一邐■-戶-邋gw邋-邋-邋一-邋?-一邐?一*?.一《邋.逡逑Q00邋'邐.一《邋-邋一邋-邋V,,邐kJ邐一邋一》4-*>"?,邋??邋一,1邐.逡逑k_逡逑皂々巧邐—逡逑5邋400邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐-??"?,…逡逑巳邋550-

譜圖,蛋白質(zhì),蛋白,橫坐標(biāo)


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【學(xué)位授予單位】:南京師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S945

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本文編號:2679632

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