【摘要】：大黃魚在我國海水魚類養(yǎng)殖業(yè)中占有重要的地位。進(jìn)行品質(zhì)遺傳改良一直以來是遺傳育種的主要目標(biāo)。本文綜合采用連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析對大黃魚LG家系和隨機(jī)群體的表型性狀進(jìn)行了QTL定位。主要研究結(jié)果如下:1.表型數(shù)據(jù)分析LG家系群體的12個表型性狀(體重、全長、體長、體高、體厚、頭長、吻長、眼徑、尾鰭長、尾柄長、尾柄高和軀干長)都服從正態(tài)分布,顯示出連續(xù)變異的特點(diǎn)。隨機(jī)群體的7個性狀指標(biāo)(胴體重、全長、體長、尾柄長、尾柄高、肥滿度和凈重率)之間相關(guān)程度均達(dá)到極顯著水平(P0.01),且都服從正態(tài)分布。2.LG家系形態(tài)性狀QTL定位采用MapQTL6.0軟件對形態(tài)性狀進(jìn)行定位分析。在19月齡中,共定位到17個QTL,分布在2、3、5、9、18、20、22和23連鎖群上,單個QTL可解釋的表型變異率為22.2%-36.8%在24月齡中,共定位到25個QTL,分布在1、13、14和24連鎖群上,單個QTL可解釋的表型變異率為13.2%-37.1%,未定位到眼徑和尾鰭長相關(guān)的QTL。觀察發(fā)現(xiàn),控制不同性狀的QTL被定位在同一連鎖群相同或相鄰位置。這一現(xiàn)象暗示著同一個QTL可能同時控制著多個表型性狀,并且這些表型性狀可能具有共同的遺傳基礎(chǔ)。另外,控制同一性狀的QTL在不同時期會發(fā)生遷移。3.LG家系形態(tài)性狀GWAS分析采用單標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析對LG家系群體表型性狀進(jìn)行定位,19月齡共檢測到16個與性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),分布在2、3、9、13、18、21、22和23連鎖群。24月齡共檢測到31個關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),分布在1、5、7、13、14、18和24連鎖群。其中,體重、全長、體長、體高、體厚、頭長、吻長、眼徑、尾柄長、尾鰭長、尾柄高和軀干長在19月齡和24月齡關(guān)聯(lián)的SNP數(shù)目分別為1(5)、1(4)、1(4)、1(2)、1(4)、3(1)、1(1)、2(1)、1(3)、1(1)、1(3)、2(2),括號內(nèi)為24月齡SNP數(shù)目。4.隨機(jī)群體大黃魚表型性狀GWAS分析通過GBS測序技術(shù)挖掘SNP標(biāo)記,經(jīng)質(zhì)控后,最終500個體和24645個SNPs用于關(guān)聯(lián)分析。在全基因組范圍內(nèi)共檢測到68個SNPs與7個生長性狀顯著相關(guān)(P10~(-6)),其中與胴體重、全長、體厚、尾柄長、肥滿度和凈重率顯著關(guān)聯(lián)的SNP數(shù)目分別為9、6、7、9、12、2和23。觀察發(fā)現(xiàn),控制不同性狀的位點(diǎn)被定位在相同染色體相同位置。以1號染色體為例,位于1號染色體19.9Mb和24.4Mb位置的位點(diǎn)同時與胴體重、全長、尾柄長和尾柄高顯著關(guān)聯(lián),說明這兩個位點(diǎn)可能同時影響著這4個性狀,并在這兩個位點(diǎn)附近發(fā)現(xiàn)SGCZ、XPNPEP1、PNPLA6等基因,這些基因可能緊密連鎖并同時影響大黃魚生長相關(guān)性狀。
【圖文】：

28尾柄高/mm 肥滿度 g/cm3凈重率%圖 3-1 各形態(tài)數(shù)據(jù)頻率分布圖Fig.3-1 The normal distribution of morphometric body measurements

/g 1mm 0.940** 1/mm 0.872** 0.825** 1/mm 0.873** 0.898** 0.761** 1/mm 0.833** 0.830** 0.735** 0.777** 1/cm30.529** 0.331** 0.601** 0.330** 0.408** 1R% -0.171** -0.149** -0.286** -0.156** -0.122** -0.516** 因組 DNA 檢測的大黃魚 DNA 經(jīng) 1%的瓊脂糖凝膠電泳后清晰見到基因組 DNA 條帶，，只選取部分個體的 DNA 電泳圖見圖 3-2。由圖可見，DNA 片段完整蛋白存在，無明顯降解及 RNA 存在，說明提取的 DNA 質(zhì)量較高，滿足。取 1.5ulDNA 在 NanoDrop 核酸分析儀測定其濃度和純度，絕大多部分ng-500ng/ul 之間，，OD260/280和 OD260/230值均介于 1.8-2.1 之間，樣品純度
【學(xué)位授予單位】：集美大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2679680