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大黃魚源殺香魚假單胞菌外膜蛋白的預(yù)測、克隆表達(dá)及免疫原性初步分析

發(fā)布時間:2020-04-19 01:09
【摘要】:大黃魚(Larimichthys crocea)源殺香魚假單胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)是引起大黃魚內(nèi)臟白點(diǎn)病的主要致病菌,該病每年在我國沿海網(wǎng)箱養(yǎng)殖的大黃魚上均有不同程度的爆發(fā),發(fā)病后致死率高、危害嚴(yán)重,目前尚無有效防治措施,給大黃魚養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大損失。本研究根據(jù)NCBI收錄的殺香魚假單胞菌NB2011株全基因組序列(GenBank Accession:NZ_ASJX00000000),基于反向疫苗的開發(fā)思路,通過生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫從基因組中預(yù)測、篩選菌體的外膜蛋白作為候選免疫原,將其克隆后在大腸桿菌中重組表達(dá),并對獲得的重組蛋白進(jìn)行免疫原性分析,研究結(jié)果如下:一、本研究從NB2011株基因組中共預(yù)測、篩選出28個外膜蛋白基因作為候選免疫原,其中10個為外膜結(jié)構(gòu)蛋白,10個為毒力分泌相關(guān)蛋白,3個脂蛋白,2個孔蛋白,其他外膜蛋白3個。二、通過設(shè)計(jì)基因擴(kuò)增引物,成功克隆出28個外膜蛋白的基因,經(jīng)測序比對,其中27個基因的序列與NB2011株100%吻合,其中1個編號P10(EPB95217)的基因與NB2011株存在1個堿基的差異,多次重復(fù)試驗(yàn)均證實(shí)差異的存在,分析表明,該處堿基差異不會終止翻譯,應(yīng)為有效的編碼序列。三、本研究成功構(gòu)建了28個外膜蛋白的原核表達(dá)載體(pET-30(a)-n),通過優(yōu)化誘導(dǎo)表達(dá)條件,共有18個重組蛋白在大腸桿菌中成功表達(dá),經(jīng)包涵體檢測,其中2個蛋白為可溶性表達(dá),其余16個為包涵體形式。四、制備了效價為1∶6400的新西蘭兔抗殺香魚假單胞菌多克隆抗體,應(yīng)用抗體對重組表達(dá)的18個外膜蛋白進(jìn)行了免疫原性的Western Blot分析,結(jié)果表明,與有10個重組蛋白與多抗結(jié)合較強(qiáng),有8重組蛋白與多抗結(jié)合稍弱。五、從兔抗檢測具有較強(qiáng)免疫原性的重組外膜蛋白中,選取了P15、P16、A6、B6四個外膜蛋白進(jìn)行了魚體免疫攻毒試驗(yàn),結(jié)果表明,大黃魚攻毒后第6天開始出現(xiàn)死亡,檢剖內(nèi)臟有明顯白點(diǎn),至第14天時,統(tǒng)計(jì)得到免疫組中P15、P16的相對保護(hù)率分別為15.79%和5.26%,A6和B6的相對保護(hù)率分別為68.42%和52.63%。綜上,本研究運(yùn)用反向疫苗原理開展了大黃魚源殺香魚假單胞菌外膜蛋白亞單位疫苗抗原的預(yù)測、制備和初步篩選等工作,研究結(jié)果為大黃魚內(nèi)臟白點(diǎn)病的疫苗防治提供了有益的借鑒。
【圖文】:

香魚,全基因組,假單胞菌,DNA電泳


胞菌基因組 DNA 濃度及條帶分所用的材料菌株 ZS1306003,是由大黃魚內(nèi)臟。菌株經(jīng)平板劃線復(fù)蘇養(yǎng),,使用試劑盒抽提全基因組 D凝膠電泳結(jié)果如圖 1 所示,條帶度高,說明基因組提取完整,降解程。

照片,外膜蛋白基因,照片,退火溫度


圖 2.候選外膜蛋白基因 PCR 產(chǎn)物膠照片F(xiàn)ig 2. Photo of candidate outer membrane protein gene PCR product gel編號引物Tm 值(F/R)退火溫度(℃)片段長度72℃延伸時間編號引物Tm 值(F/R)退火溫度(℃)片段長度72℃延伸時間A1 61/71 61 1149bp 65s P28 62/62 62 1191bp 75sA2 60/64 61 1269bp 70s P29 61/63 62 636bp 45sA3 69/81 69 1239bp 75s P30 66/64 65 675bp 45sA5 61/79 62 1239bp 75s P3 55/63 54 840bp 50sA6 58/59 59 1335bp 80s P7 51/72 51 774bp 45sB1 79/61 61 762bp 50s P9 68/72 65 1338bp 80sB4 59/63 59 768bp 50s P10 67/64 64 1020bp 60sB6 61/64 61 594bp 40s P11 64/69 64 501bp 30sB10 73/75 73 717bp 45s P12 52/53 53 693bp 45s
【學(xué)位授予單位】:浙江海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S943

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本文編號:2632753

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