石斑魚APC相關(guān)基因在刺激隱核蟲感染后的表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2020-04-05 19:43
【摘要】:抗原遞呈細(xì)胞(Antigen-presenting cell,APC)是一類可在其細(xì)胞表面表達(dá)主要組織相容性復(fù)合體(Major histocompatibility complexes,MHCs)并將加工后的抗原信息通過T細(xì)胞受體(T cell receptors,TCR)遞呈給T細(xì)胞的細(xì)胞。專職抗原遞呈細(xì)胞包括:樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和B細(xì)胞。這些細(xì)胞通過多種方式獲得抗原后,可對抗原進(jìn)行加工并與MHC II類分子結(jié)合后激活T細(xì)胞,啟動(dòng)適應(yīng)性免疫反應(yīng)。刺激隱核蟲作為一種寄生性海水纖毛蟲,對熱帶和亞熱帶海水魚類危害極其嚴(yán)重。大量實(shí)驗(yàn)證明了刺激隱核蟲的感染可引起海水魚類的適應(yīng)性免疫應(yīng)答。為揭示抗原遞呈細(xì)胞在刺激隱核蟲感染過程中可能發(fā)揮的作用,本文基于刺激隱核蟲感染斜帶石斑魚后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,克隆獲得了7個(gè)APC相關(guān)基因(EcIL-34、EcMCSF2、EcMCSFR2、EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208)的ORF序列。其中巨噬細(xì)胞相關(guān)基因EcIL-34、EcMCSF2和EcMCSFR2等分子的ORF分別為657 bp、804 bp和3141 bp,分別編碼218、267和1046個(gè)氨基酸,理論原子質(zhì)量為25.50 kDa、31.02 kDa和117.72 kDa。樹突狀細(xì)胞相關(guān)基因EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208等分子的ORF分別為1134 bp、1089 bp、675 bp和771 bp分別編碼377、362、224和256個(gè)氨基酸,理論原子質(zhì)量為43.03 kDa、40.81 kDa、24.78 kDa和28.12kDa。序列的結(jié)構(gòu),同源性和進(jìn)化樹分析結(jié)果認(rèn)為這7個(gè)基因均與在其他物種上報(bào)道的同源基因相似。組織分布結(jié)果顯示APC相關(guān)基因雖然存在不同的表達(dá)模式,但主要在免疫組織中表達(dá)。EcIL-34主要在腦組織表達(dá),緊接著在鰓、脾臟、皮膚和肌肉等部位均有表達(dá),而在肝臟和胸腺則表達(dá)較少;EcMCSF2則在頭腎和中腎表達(dá)量最高,在鰓和胸腺表達(dá)量較少;EcMCSFR2在脾臟,頭腎和鰓中高表達(dá),而在肌肉、胸腺和心臟中低表達(dá)。兩個(gè)EcCCR6均在鰓上表達(dá)量最高,而在心臟、肝臟和肌肉中均沒有檢測到表達(dá)量;在腦中主要表達(dá)EcCCR6A而在頭腎和中腎中則主要表達(dá)EcCCR6B,兩者在其余組織中表達(dá)量相近。EcCD83在胸腺上表達(dá)量最高,在非淋巴組織表達(dá)較低;EcCD208在中腎表達(dá)量最高,緊接是在鰓、皮膚、腦和心臟表達(dá),而在其余組織表達(dá)量很低。對APC相關(guān)基因在刺激隱核蟲感染后的表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn),所有6個(gè)表面分子(EcMCSFR1、EcMCSFR2、EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208)均在感染后的皮膚上顯著上調(diào),一方面可能是這6個(gè)表面分子在其陽性細(xì)胞上的表達(dá)量上調(diào),另一方面可能是更多該分子的陽性細(xì)胞聚積到感染部位的皮膚上。而在感染后的其余部位,雖然各個(gè)分子間的表達(dá)存在差異,但總體上,在鰓和頭腎上也是上調(diào)表達(dá)較多,而在脾臟上則是普遍下調(diào)表達(dá),推測可能是抗原遞呈細(xì)胞從系統(tǒng)免疫器官遷移到感染部位進(jìn)行免疫反應(yīng)的結(jié)果。綜上所述,初步推測石斑魚APC相關(guān)基因可能參與了抗刺激隱核蟲免疫應(yīng)答過程。
【圖文】:
圖 1 EcIL-34 氨基酸序列比對“·”表示該處氨基酸缺失,黑色陰影表示蛋白質(zhì)序列保守部位;灰色陰影表示該位置發(fā)現(xiàn)信號肽或結(jié)構(gòu)域序列; “%肌,
本文編號:2615449
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圖 1 EcIL-34 氨基酸序列比對“·”表示該處氨基酸缺失,黑色陰影表示蛋白質(zhì)序列保守部位;灰色陰影表示該位置發(fā)現(xiàn)信號肽或結(jié)構(gòu)域序列; “%肌,
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