【摘要】：細菌間協(xié)同相互作用和菌群組成對生態(tài)系統(tǒng)功能有決定作用。腸道菌群被認為具有維持腸道微生態(tài)的功能,包括刺激免疫、競爭營養(yǎng)、競爭病原菌結(jié)合位點、產(chǎn)生抗菌物質(zhì)以及促進有益物種生長等來維持腸道微生態(tài)穩(wěn)定。刺參(Apostichopus japonicus)是一種常見的海水經(jīng)濟物種,并同時具有一定的科學研究價值。但關(guān)于刺參腸道定殖菌群的研究較為少見。本課題選取15頭來自不同地點、不同生長模式的健康刺參(每處3頭),取出腸道內(nèi)容物后,進行了16S rDNA高通量測序分析,所選用的刺參分別來自于黃海海域的獐子島(ZZD)、丹東(DD)和莊河(ZH),來自于渤海海域的葫蘆島(HLD)和來自于黃渤海交界處的旅順(LS),其中,獐子島和旅順附近海域刺參生長模式為野生,其余三組為養(yǎng)殖。經(jīng)測序分析,共獲得952 005條有效數(shù)據(jù),并聚類成27 117個可操作分類單元(OTUs);經(jīng)物種注釋得到,五組中豐度最高的門均是變形菌門(Proteobacteria),但在屬水平上有差異:樣品組DD、ZZD、ZH和HLD組中優(yōu)勢菌為變形菌門鹽單胞菌屬(Halomonas),具體含量為DD,36.97%,ZZD,42.66%,ZH,31.73%,HLD,31.96%,其次為希瓦氏菌屬(Shewanella),具體含量為DD,9.13%,ZZD,14.34%,ZH,9.56%,HLD,8.95%;而LS組為擬桿菌門(Bacteroidetes)擬桿菌屬(Bacteroides),含量為3.72%;根據(jù)Alpha多樣性結(jié)果,樣品組LS觀察到的物種數(shù)最多,菌群多樣性最高;樣品組ZZD菌群多樣性最低;樣品組DD菌群豐富度最低;根據(jù)Beta多樣性分析,樣品組LS與其他四組之間有很大差別,樣品組ZZD與HLD之間較為相似。通過比較不同地理環(huán)境來源的刺參腸道菌群,發(fā)現(xiàn)黃渤海交界處組(LS)的刺參腸道樣品中變形菌門、鹽單胞菌屬和希瓦氏菌屬含量顯著低于另外兩組(黃海組包括ZZD、DD和ZH,渤海組包括HLD)(P0.05),而酸桿菌門、擬桿菌門、芽單胞菌、疣微菌門、浮霉菌門和擬桿菌屬含量顯著高于其他組(P0.05);黃渤海交界處組刺參腸道菌群的shannon指數(shù)、chao1指數(shù)和ACE指數(shù)均顯著高于其他兩組(P0.05)。以上結(jié)果說明地理環(huán)境影響刺參腸道菌群。乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB)和雙歧桿菌(Bifidobacterium)在所有組中均有發(fā)現(xiàn),總含量為0.58%到4.66%,乳酸菌平均含量為1.01%,雙歧桿菌平均含量為0.99%,可作為潛在益生菌進行開發(fā)。通過比較野生和養(yǎng)殖刺參腸道菌群,發(fā)現(xiàn)野生組刺參腸道菌群中,酸桿菌門、放線菌門、芽單胞菌門、疣微菌門和浮霉菌門的含量顯著高于養(yǎng)殖組。證明生長方式能夠影響刺參腸道菌群。本課題中發(fā)現(xiàn)刺參腸道固有菌、優(yōu)勢菌可以作為潛在益生菌進行后續(xù)開發(fā),而生長方式和生長環(huán)境對刺參腸道菌群影響的比較,可以為刺參用微生物制劑的開發(fā)提供參考,為刺參差異化養(yǎng)殖提供技術(shù)支持。
【圖文】：

注：樣品名與對應樣品來源見表 2-1Notes: group names and their represented habitats are in Tab. 2-1圖 2-2 以抽取的測序數(shù)據(jù)量與對應的物種數(shù)（OTUs 數(shù)目）構(gòu)建的物種多樣性稀釋曲線Fig.2-2 Rarefaction curves of observed species of A. japonicus at 97% similarity bason OTUs

注：樣品名與對應樣品來源見表 2-1Notes: group names and their represented habitats are in Tab. 2-1圖 2-3 以樣品中的OTUs按相對豐度由大到小排序的編號與OTUs中的相對豐度獲得的點連接繪制的等級豐度曲線Fig. 2-3 Rank Abundance curves of observed species of A. japonicus at 97% similaritybased on OTUs2.2.3 物種分布2.2.3.1 物種相對豐度在所有的刺參腸道樣品中，，共鑒定到 45 門、105 綱、207 目、385 科和 811 屬。超過 89.3%的 Tags 能夠被鑒定到門水平，DD、ZZD、LS、ZH 和 HLD 分別鑒定到 26.3±6.6、26.6±3.2、34.0±1.0、32.3±4.0 和 29.0±2.6 個門類。在門水平上，豐度 Top10 的門類在樣品組 DD、ZZD、ZH 和 HLD 中是一致的，樣品組 LS 與其它四組不同。是樣品組 DD、ZZD、ZH 和 HLD 的豐度 Top10 的門類依次為變形菌門
【學位授予單位】：大連海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：S917.4

【參考文獻】

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本文編號：2607757