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苦豆子響應(yīng)鹽脅迫的轉(zhuǎn)錄組分析和SaLDC亞細(xì)胞定位、原核表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2025-05-28 00:45
  賴氨酸脫羧酶(Lysine decarboxylase,LDC)主要功能是催化賴氨酸脫羧生成尸胺,是苦豆子(Sophora alopecuroidesL.)中苦參堿(matrine,MA)和氧化苦參堿(oxymatrine,OMA)生物合成途徑的第一個(gè)關(guān)鍵酶,在其生化代謝過程中起著重要的作用。本研究以中藥材苦豆子為材料,對鹽脅迫處理下的苦豆子植株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析,研究苦豆子響應(yīng)鹽脅迫的防御機(jī)制,為深入了解苦豆子的耐鹽調(diào)控機(jī)理提供理論依據(jù);在已經(jīng)克隆獲得賴氨酸脫羧酶基因(SaLDC)全長序列的基礎(chǔ)上,通過苦豆子SaLDC亞細(xì)胞定位、基因表達(dá)量與其直接產(chǎn)物尸胺含量的關(guān)系及原核表達(dá)研究,初步探討賴氨酸脫羧酶基因的功能。研究結(jié)果如下:(1)用150 mmol/LNaCl溶液脅迫生長50d的苦豆子植株,分別于脅迫前(0 d)、脅迫后3d和7d采集葉片,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序拼接得到415804個(gè)Unigene,有44177個(gè)unigene映射到KEGG代謝通路;兩兩比較不同NaCl溶液脅迫天數(shù)的基因表達(dá)量,分別發(fā)現(xiàn)了 4229(3 dvs 0 d)、2119(7 dvs 0 d)3953(3 dvs 7...

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1轉(zhuǎn)錄本(A)和Unigene?(B)長度分布圖??

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圖2-2?NR比對物種分布圖??2.3.3.3?GO?分類??

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寧夏大學(xué)碩士學(xué)位論文?第二章鹽脅迫下苦豆子轉(zhuǎn)錄組測序分析??2.3.3.2NR注釋結(jié)果??將轉(zhuǎn)錄組獲得的Unigene與NR數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(圖2-2),共有10個(gè)同源性較高的物種,??其中有6個(gè)屬于顯科,分別是狹葉羽扇顯妨yb/如)、木豆、大??泛(G7vc/"emox)、紅三葉....


圖2-3?GO功能注釋分類圖(Level?2)??2.3.3.4KEGG?分類??

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轉(zhuǎn)錄組測序分析??35000?r60.0???mim?分f功能?細(xì)胞祖計(jì)??30000'?-50.0??25000????I?-40.0??〇?20000|??IL?1??11111114?I?i?i?I?i?§?11!?111111?11?If?fill?111。妫?ill!....


圖2-4?KEGG分類圖??注:縱坐標(biāo)為KEGG二級分類代謝通路的名稱,橫坐標(biāo)為注釋到該通路F的*因個(gè)數(shù)

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本文編號:4047810

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