DNA甲基化作為表觀遺傳的主要修飾方式之一,參與細(xì)胞的許多生物學(xué)過程,在植物生長發(fā)育、基因組印記和對逆境脅迫的應(yīng)答等方面發(fā)揮重要作用。本試驗(yàn)利用玉米甲基化免疫共沉淀(MeDIP-seq)技術(shù)對玉米雜交種鄭單958吸脹0h和24h果穗上部、中部種子全基因組DNA甲基化進(jìn)行了研究,利用McrBC-PCR對部分差異甲基化基因進(jìn)行驗(yàn)證,將MeDIP-seq數(shù)據(jù)和RNA-seq數(shù)據(jù)結(jié)合,對部分差異甲基化基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測,從DNA甲基化角度研究影響玉米果穗不同部位種子萌發(fā)的調(diào)控機(jī)理。主要研究結(jié)果如下:1.通過MeDIP-seq技術(shù)對玉米果穗不同吸脹時間、不同部位種子的全基因組DNA甲基化進(jìn)行分析,吸脹0h種子的差異甲基化基因數(shù)量遠(yuǎn)多于吸脹24h種子;吸脹0h中部與上部種子相比,甲基化上調(diào)基因的數(shù)量多于下調(diào)基因的數(shù)量,而吸脹24h中部與上部的種子比較,甲基化下調(diào)基因的數(shù)量多于上調(diào)基因的數(shù)量。2.MeDIP-seq結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)啟動子區(qū)的甲基化修飾要多于基因區(qū),基因區(qū)內(nèi)含子的甲基化修飾多于外顯子。通過對吸脹0h和24h中部和上部種子的差異甲基化基因進(jìn)行分析,在吸脹0h種子中共檢測到7264個差異甲基...

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學(xué)位級別】：碩士

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圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布

圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize圖3Peaks在基因不同區(qū)域上的分布統(tǒng)計(jì)Figure3Distr....

圖4Peaks差異甲基化統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果

圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize圖3Peaks在基因不同區(qū)域上的分布統(tǒng)計(jì)Figure3Distr....

圖7吸脹0h、24h種子差異基因的DNA甲基化水平驗(yàn)證D表示DNA經(jīng)過McrBC酶切N表示DNA未經(jīng)過McrBC酶切

圖7吸脹0h、24h種子差異基因的DNA甲基化水平驗(yàn)證D表示DNA經(jīng)過McrBC酶切N表示DNA未經(jīng)過McrBC酶切Figure7Estimationofthemethylationleveloftheseedgerminat....

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