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水稻直立短穗突變體esp的轉(zhuǎn)錄組研究

發(fā)布時間:2023-04-20 03:03
  【目的】克隆水稻直立短穗基因Erect and Short Panicle(ESP),分析其參與的基因調(diào)控途徑,解析ESP控制株型、穗長等農(nóng)藝性狀的分子機理!痉椒ā恳灾绷⒍趟胪蛔凅wesp及其野生型為材料,成熟期進行株高、穗長、粒長等表型測定;構(gòu)建秈粳雜交F2定位群體,挑選與突變表型一致的F2單株,利用與突變性狀連鎖的分子標記對目的基因進行定位;對野生型和突變體進行基因組測序,結(jié)合定位結(jié)果,找到突變位點,克隆ESP;利用生物信息學軟件進行進化樹和基因表達分析;提取野生型和突變體幼穗中的RNA并建庫,GO(gene ontology)聚類分析表達差異基因,同時根據(jù)KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)數(shù)據(jù)庫,分析野生型和突變體中植物激素信號轉(zhuǎn)導和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白加工相關(guān)基因的表達變化,并通過qRT-PCR驗證。【結(jié)果】通過表型觀察和農(nóng)藝性狀調(diào)查,與野生型相比,直立短穗突變體esp株高降低,穗長變短,穗型由彎曲變?yōu)橹绷?每穗粒數(shù)減少,粒長變短,粒寬和千粒重增加;有效穗數(shù)無顯著差異。利用突變體esp與PA64構(gòu)建秈粳F(xiàn)2定位群體,將目的基因定位于...

【文章頁數(shù)】:14 頁

【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 農(nóng)藝性狀調(diào)查
    1.3 基因定位與克隆
    1.4 生物信息學分析
    1.5 轉(zhuǎn)錄組分析
    1.6 RNA提取、反轉(zhuǎn)錄以及q RT-PCR分析
2 結(jié)果
    2.1 直立短穗突變體esp的表型分析
    2.2 ESP的克隆
    2.3 ESP及其同源蛋白的序列分析
    2.4 ESP組織表達分析
    2.5 突變體esp和野生型幼穗的轉(zhuǎn)錄組分析
    2.6 ESP突變對植物激素信號轉(zhuǎn)導和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)代謝途徑的調(diào)控
    2.7 轉(zhuǎn)錄組驗證
3 討論
4 結(jié)論



本文編號:3794757

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