菘藍(lán)（Isatisindigotica Fort.）為十字花科（Cruciferae）菘藍(lán)屬（Isatis）兩年生草本植物,富含靛藍(lán)、靛玉紅、表告依春、色胺酮、谷甾醇、腺苷及芥子油苷等有效成分。其中芥子油苷在抗腫瘤和植物防御性反應(yīng)方面發(fā)揮重要作用。細(xì)胞色素P450（CYP450）超家族中的CYP79s和CYP83s是芥子油苷核心結(jié)構(gòu)形成過程中的關(guān)鍵酶基因。目前對菘藍(lán)芥子油苷的研究主要集中在成分鑒定和種類分析上,對其生物合成途徑的研究相對較少。本研究建立了不同誘導(dǎo)子（MeJA、YE、Ag+）處理和對照的菘藍(lán)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,對菘藍(lán)CYP450基因家族成員進行分析,鑒定出芥子油苷合成相關(guān)的CYP450基因（IiCYP79B2、IiCYP79F1、IiCYP83A1、IiCYP83B1）,并對其進行克隆、生物信息學(xué)分析、表達模式探究及原核表達研究。相關(guān)結(jié)果對于探討菘藍(lán)CYP450基因功能多樣性、進化地位提供分子依據(jù)。同時,為深入認(rèn)識芥子油苷代謝途徑和分子調(diào)控機制奠定了一定的研究基礎(chǔ)。本論文獲得的主要研究結(jié)果如下:（1）通過RNA-seq技術(shù)獲得了經(jīng)MeJA、YE、Ag+3種誘導(dǎo)子處理和對照菘藍(lán)葉... 

【文章來源】：陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：110 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

ICYP450Unigene長度分布

ＫＥＧＧ是有關(guān)基因代謝途徑的公共數(shù)據(jù)庫，ＫＥＧＧ注釋結(jié)果表明（表２－５），??被注釋到的５３個ＣＹＰ４５０?Ｕｎｉｇｅｎｅ全部屬于一級通路（Ｐａｔｈｗａｙ?Ｈｉｅｒａｒｃｈｙ〗）中的??“代謝（Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）?”這一功能類別。在二級通路（Ｐａｔｈｗａｙ?Ｈｉｅｒａｒｃｈｙ２）層次??上，“其他次生代謝產(chǎn)物的生物合成（Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｏｆ?ｏｔｈｅｒ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ）?”??和“ＩＳ類和酮類化合物代謝（Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ?ｏｆ?ｔｅｒｐｅｎｏｉｄｓ?ａｎｄ?ｐｏｌｙｋｅｔｉｄｅｓ）?”被注釋的??ＣＹＰ４５０?Ｕｎｉｇｅｎｅ數(shù)目最多，分別為５１個和３９個，這表明ＣＹＰ４５０基因主要參與??次生代謝產(chǎn)物的生物合成。另外，“氨基酸代謝（Ａｍｉｎｏ?ａｃｉｄ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）?”和“脂??質(zhì)代謝（Ｌｉｐｉｄ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）”分別獲得７個和２個ＣＹＰ４５０?Ｕｎｉｇｅｎｅ的注釋信息。在??三級通路（Ｐａｔｈｗａｙ?Ｈｉｅｒａｒｃｈｙ〗）中，“芪類化合物，二芳基庚醇化合物和姜辣素??的生物合成（Ｓｔｉｌｂｅｎｏｉｄ，ｄｉａｒｙｌｈｅｐｔａｎｏｉｄ?ａｎｄ?ｇｉｎｇｅｒｏｌ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ）?”、“抒檬稀和??蕆稀降解（Ｌｉｍｏｎｅｎｅ?ａｎｄ?ｐｉｎｅｎｅ?ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ）?”?注釋到的?ＣＹＰ４５０?Ｕｎｉｇｅｎｅ?數(shù)目最??多，分別為３５個和３１個�！敖孀佑蛙蘸铣桑ǎ牵欤酰悖铮螅椋睿铮欤幔簦�?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ）?”注釋到??６?個?ＣＹＰ４５０?Ｕｎｉｇｅｎｅ，分別是?ＣＹＰ７９Ｂ２、ＣＹＰ７９Ｂ３、ＣＹＰ７９Ｆ１、ＣＹＰ７９Ａ２、ＣＹＰ８３Ａ１??和ＣＹＰ８３

利用ＭＥＧＡ７對１７８個擬南芥ＣＹＰ４５０蛋白氨序列和４２個菘藍(lán)ＣＹＰ４５０蛋白??序列進行多序列比對，并分別構(gòu)建Ａ－ｔｙｐｅ和ｎｏｎ－Ａ－ｔｙｐｅＣＹＰ４５０系統(tǒng)發(fā)育樹，結(jié)??果如圖２－６、圖２－７所示。由圖可知，２５個菘藍(lán)ＣＹＰ４５０蛋白屬于Ａ－ｔｙｐｅ，分布在??１１個家族中。１７個務(wù)藍(lán)ＣＹＰ４５０蛋白屬于ｎｏｎ－Ａ－ｔｙｐｅ，分布在１２家族。Ａ－ｔｙｐｅ??ＣＹＰ４５０僅包括ＣＹＰ７１?Ｃｌａｎ，主要參與次級代謝物或天然產(chǎn)物的合成。ｎｏｎ－Ａ－ｔｙｐｅ??ＣＹＰ４５０?包括?７?個?Ｃｌａｎ，分別是?ＣＹＰ８５?Ｃｌａｎ、ＣＹＰ８６?Ｃｌａｎ、ＣＹＰ９７?Ｃｌａｎ、ＣＹＰ７２?Ｃｌａｎ、??ＣＹＰ７４Ｃｌａｎ、ＣＹＰ５１Ｃｌａｎ和ＣＹＰ７１０Ｃｌａｎ，主要參與甾醇，類胡蘿卜素，月旨肪酸??和激素的代謝過程。??、為?§??ＨＣＹＰ７９Ｆ１?Ｔ—．?Ｊ?Ｉ一Ｌ?Ｉ?Ｐｉ?????灣樣ｉ＇！爾ｗ??々＾?＾?＾??圖２－６菘藍(lán)和擬南芥Ａ－ｔｙｐｅ?ＣＹＰ４５０系統(tǒng)進化分析??三角符號表示菘藍(lán)ＣＹＰ４５０??Ｆｉｇ．?２－６?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｅｓ?ｏｆ?Ａ－ｔｙｐｅ?ＣＹＰ４５０ｓ?ｆｒｏｍ?Ｉｓａｔｉｓ?ｉｎｄｉｇｏｔｉｃａ?Ｆｏｒｔ，?ａｎｄ?Ａｒ

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]芥藍(lán)蘿卜硫苷生物合成主要基因表達特性及功能鑒定[D]. 尹玲.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
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碩士論文
[1]不結(jié)球白菜晚抽薹基因BcFLC1，BcFLC3的克隆及表達分析[D]. 榮子龍.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號：3109039