茶樹CsAAPs和CsLHTs亞家族基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-24 06:43
茶樹是重要的葉用經(jīng)濟(jì)作物,對(duì)氮素的需求量較大,因此了解氮素的吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)及其分布規(guī)律對(duì)于提高茶葉產(chǎn)量、提升茶葉品質(zhì)均有重要作用。氨基酸是茶葉的重要品質(zhì)成分,也是茶樹體內(nèi)核酸、葉綠素、線粒體以及次生代謝等物質(zhì)的氮素來源,參與植物體內(nèi)的多種生理過程,氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在這些過程中發(fā)揮著極其重要的作用。本研究對(duì)茶樹氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族中的兩個(gè)關(guān)鍵亞家族氨基酸通透酶(Amino acid permeases,AAPs)和賴氨酸組氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(Lysine-histidine transporters,LHTs)的基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析,并對(duì)這兩個(gè)家族基因在不同品種、組織部位、氮素水平以及氮素處理時(shí)間下的表達(dá)模式進(jìn)行探究,以期發(fā)現(xiàn)受氮素水平調(diào)控表達(dá)的重要的茶樹氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因,為進(jìn)一步研究茶樹中氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)規(guī)律及氮高效品種選育提供研究基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)論如下:1.根據(jù)茶樹轉(zhuǎn)錄組信息,克隆得到5個(gè)茶樹CsAAPs亞家族基因,即CsAAP3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7和CsAAP8,并將序列提交至NCBI數(shù)據(jù)庫中。氨基酸序列比對(duì)結(jié)果表明5個(gè)CsAAPs基因的序列同源性較高,均含有9-10...
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)線路圖
圖 2-1 茶樹 CsAAPs 基因克隆電泳圖Fig.2-1 The electrophoresis results of the clone of CsAAPs in tea plants注:A:CsAAP3,B:CsAAP4,C:CsAAP6,D:CsAAP7,E:CsAAP8Note: A: CsAAP3, B: CsAAP4, C: CsAAP6, D: CsAAP7, E: CsAAP8序,發(fā)現(xiàn)克隆得到的序列與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中的 ORF 序列大小一致表 2-1 所示的 CsAAPs 序列功能預(yù)測(cè)的基本信息及 Blast 結(jié)果,將P3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7 和 CsAAP8,并將序列提交至 N號(hào)分別為 CsAAP3(MK532959)、CsAAP4(MK532960)、CsAAP32962)和 CsAAP8(MK532963)。組(Wei. et al., 2018)中以“amino acid permease”為條件進(jìn)行搜酸通透酶的序列,其中 63 條注釋信息為 amino acid permease 7,ease 2,1 條注釋信息為 amino acid permease 8,2 條注釋信息為 ami族與 CSS 基因組序列(Wei et al., 2018)進(jìn)行了比對(duì)驗(yàn)證,各基編 號(hào) 分 別 為 Scaffold3879:394084:396743 、 Scaffold4449:317697:219993、Scaffold694:1372452:1390756 和 Scaffold2943:104、CsAAP7 和 CsAAP8 比對(duì)到的序列片段長(zhǎng)度分別為 1452、1467、及以上。同時(shí)發(fā)現(xiàn)在 CSS 基因組中,CsAAP6 序列比對(duì)上的片段
CsAAPs親/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物吸收運(yùn)轉(zhuǎn)氨基酸的分子機(jī)制進(jìn)展[J]. 陳展宇,陳天鵬,李慧杰,崔喜艷. 分子植物育種. 2017(12)
[2]植物氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的研究進(jìn)展[J]. 彭波,孫艷芳,龐瑞華,宋曉華,李慧龍,周棋贏,袁紅雨,宋世枝. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]擬南芥AAP基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 范貝,劉明曉,李慧杰,張雪,王曉梅,崔喜艷. 生命的化學(xué). 2016(03)
[4]擬南芥無機(jī)氮素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白及其磷酸化調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 張曦,林金星,單曉昳. 植物學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]松陽茶園土壤酸化狀況及其改良措施[J]. 錢園鳳,鄭得林,周斌,張紹珊. 中國(guó)茶葉加工. 2015(02)
[6]高等植物氮素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 馬清,管超,夏曾潤(rùn),王茜,王鎖民. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(02)
[7]逆境脅迫條件下脯氨酸對(duì)植物生長(zhǎng)的影響[J]. 朱虹,祖元?jiǎng)?王文杰,閻永慶. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J]. 姜錚,王芳,何湘,劉大偉,陳宣男,趙紅慶,黃留玉,袁靜. 生物技術(shù)通訊. 2009(02)
[9]外源GABA對(duì)NaCl脅迫下中間錦雞兒幼苗乙烯生成的調(diào)控作用[J]. 史勝青,齊力旺,肖文發(fā),李春秀,林萍,張守攻. 林業(yè)科學(xué). 2008(09)
[10]信陽毛尖茶的化學(xué)成分[J]. 郭桂義,胡孔鋒,袁丁. 食品科技. 2006(09)
碩士論文
[1]不同氮效率茶樹品種氮素吸收利用相關(guān)基因表達(dá)模式探究[D]. 劉圓.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]γ-氨基丁酸對(duì)煙草乙烯合成基因及乙烯信號(hào)組分基因表達(dá)的調(diào)節(jié)[D]. 馬兆武.中南民族大學(xué) 2009
[3]不同品種茶樹氮素營(yíng)養(yǎng)差異及其機(jī)制的研究[D]. 王新超.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號(hào):2996780
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)線路圖
圖 2-1 茶樹 CsAAPs 基因克隆電泳圖Fig.2-1 The electrophoresis results of the clone of CsAAPs in tea plants注:A:CsAAP3,B:CsAAP4,C:CsAAP6,D:CsAAP7,E:CsAAP8Note: A: CsAAP3, B: CsAAP4, C: CsAAP6, D: CsAAP7, E: CsAAP8序,發(fā)現(xiàn)克隆得到的序列與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中的 ORF 序列大小一致表 2-1 所示的 CsAAPs 序列功能預(yù)測(cè)的基本信息及 Blast 結(jié)果,將P3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7 和 CsAAP8,并將序列提交至 N號(hào)分別為 CsAAP3(MK532959)、CsAAP4(MK532960)、CsAAP32962)和 CsAAP8(MK532963)。組(Wei. et al., 2018)中以“amino acid permease”為條件進(jìn)行搜酸通透酶的序列,其中 63 條注釋信息為 amino acid permease 7,ease 2,1 條注釋信息為 amino acid permease 8,2 條注釋信息為 ami族與 CSS 基因組序列(Wei et al., 2018)進(jìn)行了比對(duì)驗(yàn)證,各基編 號(hào) 分 別 為 Scaffold3879:394084:396743 、 Scaffold4449:317697:219993、Scaffold694:1372452:1390756 和 Scaffold2943:104、CsAAP7 和 CsAAP8 比對(duì)到的序列片段長(zhǎng)度分別為 1452、1467、及以上。同時(shí)發(fā)現(xiàn)在 CSS 基因組中,CsAAP6 序列比對(duì)上的片段
CsAAPs親/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物吸收運(yùn)轉(zhuǎn)氨基酸的分子機(jī)制進(jìn)展[J]. 陳展宇,陳天鵬,李慧杰,崔喜艷. 分子植物育種. 2017(12)
[2]植物氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的研究進(jìn)展[J]. 彭波,孫艷芳,龐瑞華,宋曉華,李慧龍,周棋贏,袁紅雨,宋世枝. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]擬南芥AAP基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 范貝,劉明曉,李慧杰,張雪,王曉梅,崔喜艷. 生命的化學(xué). 2016(03)
[4]擬南芥無機(jī)氮素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白及其磷酸化調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 張曦,林金星,單曉昳. 植物學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]松陽茶園土壤酸化狀況及其改良措施[J]. 錢園鳳,鄭得林,周斌,張紹珊. 中國(guó)茶葉加工. 2015(02)
[6]高等植物氮素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 馬清,管超,夏曾潤(rùn),王茜,王鎖民. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(02)
[7]逆境脅迫條件下脯氨酸對(duì)植物生長(zhǎng)的影響[J]. 朱虹,祖元?jiǎng)?王文杰,閻永慶. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J]. 姜錚,王芳,何湘,劉大偉,陳宣男,趙紅慶,黃留玉,袁靜. 生物技術(shù)通訊. 2009(02)
[9]外源GABA對(duì)NaCl脅迫下中間錦雞兒幼苗乙烯生成的調(diào)控作用[J]. 史勝青,齊力旺,肖文發(fā),李春秀,林萍,張守攻. 林業(yè)科學(xué). 2008(09)
[10]信陽毛尖茶的化學(xué)成分[J]. 郭桂義,胡孔鋒,袁丁. 食品科技. 2006(09)
碩士論文
[1]不同氮效率茶樹品種氮素吸收利用相關(guān)基因表達(dá)模式探究[D]. 劉圓.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]γ-氨基丁酸對(duì)煙草乙烯合成基因及乙烯信號(hào)組分基因表達(dá)的調(diào)節(jié)[D]. 馬兆武.中南民族大學(xué) 2009
[3]不同品種茶樹氮素營(yíng)養(yǎng)差異及其機(jī)制的研究[D]. 王新超.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號(hào):2996780
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