發(fā)布時間：2024-11-24 22:06

　　黃萎病菌是侵染棉花造成產(chǎn)量和品質損失的重要病害,棉花抗黃萎病以往的研究進展都是在編碼蛋白基因層面上對抗病機制進行的分析。本課題對棉花基因組中的非編碼RNA和編碼蛋白的基因同時進行研究,以鑒定和分析參與棉花黃萎病抗性相關的長鏈非編碼RNA和與黃萎病抗性有密切關系的類受體蛋白基因家族。另外,我們利用三代測序,完成了黃萎病菌基因組組裝,擬從黃萎病菌基因組變異的角度考察黃萎病菌與棉花的互作關系。取得主要結果如下:首先,該研究從全基因組水平描述了lncRNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)響應黃萎病菌入侵的概貌,闡述了lncRNA在棉花與大麗輪枝菌互作中的作用。研究發(fā)現(xiàn)lncRNA在不同棉種中響應病原侵染具有保守特性和特異性,但被病原誘導的lncRNA在海島棉和陸地棉兩個棉種中都具有在Dt亞基因組優(yōu)勢表達的特點。這表明異源四倍體棉花中共存的兩個亞基因組在響應病原侵染時存在偏向性誘導表達,這與前人認為棉花對黃萎病的抗性可能源于D亞基因組相符。研究還發(fā)現(xiàn),物種保守的核心lncRNA和物種特異lncRNA在基因組變異和表達上存在明顯差異。物種特異lncRNA具有更多SNP變異...

【文章頁數(shù)】：132 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１．１植物免疫系統(tǒng)的示意圖（引自Ｄａｎｇｌ?ｅｔ?ａｌ?２０１３）

第二層防御系統(tǒng)ＰＴＩ作為誘導性抗性的其中一種，是一個被植物細胞膜表面??的病程相關分子模式（Ｐａｔｈｏｇｅｎ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ?ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｐａｔｔｅｒｎ，ＰＡＭＰｓ）所誘導的??機制（圖１．１）。這個機制可以識別在多種類型病原菌中進化上相對保守的結構，??如細菌的鞭....

圖１．２常見模式識別受體及其所招募的調控受體激酶和胞質類受體激酶（引自Ｃｏｕｔｏ?ａｎｄ??Ｚｉｐｆｅｌ?２０１６）〇??

（ｆｒｏｍ?Ｃｏｕｔｏ?ａｎｄ?Ｚｉｐｆｅｌ?２０１６）．??病原與寄主之間存在共進化關系。當植物ＰＴＩ被激活后，病原體會進化出效??應子（Ｅｆｆｅｃｔｏｒ）來破壞依賴ＰＲＲ的免疫機制（圖１．１）。不同的效應子可能會針??對特定的亞細胞位置或結構，促進自身獲取植物的營養(yǎng)物質，并促....

圖１．４模式圖示棉花黃萎�。ǎ耍祝幔祝鳎恚颍妫幔停妫欤澹⿲е碌奈�，發(fā)育遲緩和葉萎黃化

棉花黃萎�。ǎ郑澹颍簦椋悖椋欤椋酰恚鳎椋欤簦┦怯纱罅妮喼鸬�??一種真菌性病害。我國棉花生產(chǎn)經(jīng)常受到黃萎病為害，導致棉花萎蔫，發(fā)育遲緩，??葉萎黃化和壞死，從而導致棉花產(chǎn)量減產(chǎn)和纖維品質下降（圖１．４）。??Ｍ??圖１．４模式圖示棉花黃萎�。ǎ耍祝幔祝鳎恚颍妫幔停妫欤澹⿲е碌�....

圖２．１用于構建ＶＩＧＳ的ＩｎｃＲＮＡ和蛋白質編碼基因的引物位置和設計方案

基因的位置不能重疊。ＩｎｃＮＡＴｓ及其配對的蛋白質編碼基因總是存在彼此重疊的??一些區(qū)域，因此我們設計了特異性引物（避免重疊和保守區(qū)域）去擴増?zhí)禺惼??來構建ＶＩＧＳ載體，如方案設計中所示，以確保每個基因的沉默特異性（圖２．１?）。??Ｌ２／Ｐ２?Ｇｅｎｏｍｉｃ?Ｌｏｃａｔｉｏ....

本文編號：4012535