中國五省荔枝蝽共生菌多樣性及差異性研究
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1不同樣品的OTUs和Tags數(shù)量統(tǒng)計圖??Fig.?3-1?Statistics?of?OTUs?clustering?and?comments?of?total?bacteri?
3.1.1高通量測序結(jié)果可靠性分析??為了全面了解各樣品OTUs聚類及注釋情況,我們對實驗樣品OTUs聚類及??注釋結(jié)果進行統(tǒng)計(圖3-1),由圖可以看出各樣品之間測序得到的數(shù)據(jù)(Unique??Tags,?Taxon?Tags.?Otus)沒有很大出入,可以進行物種注釋、多樣性....
圖3一不同地區(qū)樣品稀釋曲線
圖3-3不同地區(qū)樣品Shannon稀釋曲線??Fig.?3-3?Shannon?index?of?bacteria?species?of?different?samples?from?different?zones??11??
圖3-4不同地區(qū)樣品中代表性OTUs系統(tǒng)發(fā)育樹??Fig.?3-4??
?98??使用臨近相接法(N-J法)對荔枝蝽樣品中具有代表性的OTUs及其經(jīng)過比??對相似性最高的序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,如下(
圖3-5不同地區(qū)樣品門水平細菌占比??Fig.?3-5?The?composition?of?symbiosis?in?different?zones?in?phylum?level??-
??從不同地區(qū)樣品中代表性OTUs系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-4虛線框)可以看出,研??究樣品的共生菌主要集中在腸桿菌科(Enterobacteriacea)下的泛菌屬(Paotoeo)??及其他屬;鏈霉菌科(Streptomycetaceae)下的鏈霉菌屬(iSyep/owycessp.....
本文編號:3976083
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