鐮孢菌是真菌界一類重要的植物病原菌,它可侵染誘發(fā)多種植物病害。山西氣候獨(dú)特,作物種類多樣,鐮孢菌引起的病害發(fā)生普遍,其種類亦多。由于鐮孢菌的多型性與易變異等特點(diǎn),使得其被認(rèn)為是所有真菌類群中在形態(tài)分類上最難鑒定的屬之一。因此,篩選適宜的基因序列作為鐮刀菌鑒定的分子標(biāo)記,對準(zhǔn)確鑒定鐮刀菌具有重要的理論和實(shí)踐價(jià)值。DNA條形碼技術(shù)是利用一個(gè)短而通用的DNA片段對物種快速識別和鑒定的技術(shù),與動(dòng)物、植物相比,真菌DNA條形碼技術(shù)的研究進(jìn)展相對緩慢,ITS序列作為真菌DNA條形碼的基本序列,在一些屬內(nèi)的適用性不高,對近緣種的分辨率較低。因此,本研究對適用于鐮孢菌的DNA條形碼進(jìn)行了篩選,并以所篩選的條形碼分析了鐮孢菌種內(nèi)及種間遺傳多樣性,并對山西省植物病原鐮孢菌種群多樣性進(jìn)行了分析,以便為鐮孢菌的分類鑒定、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析、檢驗(yàn)檢疫及相關(guān)病害的綜合防治等提供理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1、本研究以ITS、EF-1α和ββ-tubulin序列為候選DNA條形碼,通過對概念清晰的23種50株鐮孢菌的150條序列進(jìn)行適用于鐮孢菌的DNA條形碼的篩選,結(jié)果表明,EF-1a基因序列是3個(gè)候選基因...

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖2鐮抱菌屬各候選基因序列種內(nèi)及種間遺傳距離的頻率分布(使用MEGAandExcel)，種內(nèi)與種間遺傳距離分別由白色條帶和黑色條帶表示

Ｆｉｇ．?２?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｉｎｔｒａ－?ａｎｄ?ｉｎｔｅｒ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ?ｐａｉｒｗｉｓｅ?ｄｉｓｔａｎｃｅｓ?ｆｏｒ?ｅａｃｈ?ｃａｎｄｉｄａｔｅ?ｇｅｎｅ??ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?ｏｆ?Ｆｕｓａｒｉｕｍ?ｓｐｅｃｉｅｓ?ｇｅｎｅｒａｔ....

圖２鐮孢菌種類鑒定候選基因序列種內(nèi)及種間遺傳距離的頻率分布（使用ＭＥＧＡ?ａｎｄ?Ｅｘｃｅｌ），種內(nèi)??與種間遺傳距離分別由白色條帶和黑色條帶表示

ｗｗ／７ｐａｒｗｓｅｓｔａｎｃｅ??圖２鐮孢菌種類鑒定候選基因序列種內(nèi)及種間遺傳距離的頻率分布（使用ＭＥＧＡ?ａｎｄ?Ｅｘｃｅｌ），種內(nèi)??與種間遺傳距離分別由白色條帶和黑色條帶表示。??Ｆｉｇ．?２?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｉｎｔｒａ－?ａｎｄ?ｉｎ....

圖３ａ構(gòu)建基于序列的鄰接系?

Ｃｌａｄｅｌ－ＩＶ的支持率依次為８８％、９９％、９７％和１００％；除了與圖３ａ中??相同的Ａ未表現(xiàn)出單系性，還包括Ｆ加Ｍ和廠??／ａｆｅｒｚＹ／ｗｗ，其中廠ｚ＿？ｃｒａｍａ；？ｗｍ的兩株菌株分別分布在了?Ｃｌａｄｅ?ＩＩ和Ｃｌａｄｅ?ＩＩＩ中；物種鑒??定率為?７３°／。（１１／....

圖３ｂ構(gòu)建基于／序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育?

—Ｉ??０．０２??圖３ａ構(gòu)建基于序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹，自展檢驗(yàn)重復(fù)１０００次，僅標(biāo)注支持率大于等于５０％的分支，以??Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ?ｒａｍｕｌａｒｉａｅ?為外群?〇??Ｆｉｇ．?３ａ?Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ?（ＮＪ）?ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?ｉｎｆ....

本文編號：3976006