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鐮孢菌DNA條形碼及多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2024-05-17 21:32
  鐮孢菌是真菌界一類(lèi)重要的植物病原菌,它可侵染誘發(fā)多種植物病害。山西氣候獨(dú)特,作物種類(lèi)多樣,鐮孢菌引起的病害發(fā)生普遍,其種類(lèi)亦多。由于鐮孢菌的多型性與易變異等特點(diǎn),使得其被認(rèn)為是所有真菌類(lèi)群中在形態(tài)分類(lèi)上最難鑒定的屬之一。因此,篩選適宜的基因序列作為鐮刀菌鑒定的分子標(biāo)記,對(duì)準(zhǔn)確鑒定鐮刀菌具有重要的理論和實(shí)踐價(jià)值。DNA條形碼技術(shù)是利用一個(gè)短而通用的DNA片段對(duì)物種快速識(shí)別和鑒定的技術(shù),與動(dòng)物、植物相比,真菌DNA條形碼技術(shù)的研究進(jìn)展相對(duì)緩慢,ITS序列作為真菌DNA條形碼的基本序列,在一些屬內(nèi)的適用性不高,對(duì)近緣種的分辨率較低。因此,本研究對(duì)適用于鐮孢菌的DNA條形碼進(jìn)行了篩選,并以所篩選的條形碼分析了鐮孢菌種內(nèi)及種間遺傳多樣性,并對(duì)山西省植物病原鐮孢菌種群多樣性進(jìn)行了分析,以便為鐮孢菌的分類(lèi)鑒定、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析、檢驗(yàn)檢疫及相關(guān)病害的綜合防治等提供理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1、本研究以ITS、EF-1α和ββ-tubulin序列為候選DNA條形碼,通過(guò)對(duì)概念清晰的23種50株鐮孢菌的150條序列進(jìn)行適用于鐮孢菌的DNA條形碼的篩選,結(jié)果表明,EF-1a基因序列是3個(gè)候選基因...

【文章頁(yè)數(shù)】:122 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖2鐮抱菌屬各候選基因序列種內(nèi)及種間遺傳距離的頻率分布(使用MEGAandExcel),種內(nèi)與種間遺傳距離分別由白色條帶和黑色條帶表示

圖2鐮抱菌屬各候選基因序列種內(nèi)及種間遺傳距離的頻率分布(使用MEGAandExcel),種內(nèi)與種間遺傳距離分別由白色條帶和黑色條帶表示

Fig.?2?Frequency?distribution?of?intra-?and?inter-specific?pairwise?distances?for?each?candidate?gene??sequences?of?Fusarium?species?generat....


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圖3a構(gòu)建基于序列的鄰接系?

圖3a構(gòu)建基于序列的鄰接系?

Cladel-IV的支持率依次為88%、99%、97%和100%;除了與圖3a中??相同的A未表現(xiàn)出單系性,還包括F加M和廠??/aferzY/ww,其中廠z_?crama;?wm的兩株菌株分別分布在了?Clade?II和Clade?III中;物種鑒??定率為?73°/。(11/....


圖3b構(gòu)建基于/序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育?

圖3b構(gòu)建基于/序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育?

—I??0.02??圖3a構(gòu)建基于序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),自展檢驗(yàn)重復(fù)1000次,僅標(biāo)注支持率大于等于50%的分支,以??Neonectria?ramulariae?為外群?〇??Fig.?3a?Neighbor-joining?(NJ)?phylogenetic?tree?inf....



本文編號(hào):3976006

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