調(diào)查發(fā)現(xiàn),在北京多地的棗樹及百合植株上出現(xiàn)了花葉、卷葉、黃化等病毒病癥狀,經(jīng)濟價值、觀賞價值受到了影響。查閱文獻后發(fā)現(xiàn),關(guān)于棗樹及百合病毒病的研究相對較少,本研究擬利用深度測序技術(shù),對表現(xiàn)病毒病癥狀的棗樹及百合進行病毒檢測,從而明確病毒種類,豐富棗樹及百合的病毒數(shù)據(jù)庫,為棗樹及百合病毒病的防治工作打下基礎(chǔ)。實驗結(jié)果如下:1、在棗樹植株上發(fā)現(xiàn)了四種從未報道的病毒,以及一種新的分離物,分別為:①棗樹黃化斑駁相關(guān)病毒(Jujube yellow mottle-associated virus,JYMaV)北京分離物,屬于無花果花葉病毒科、歐洲山梣環(huán)斑病毒屬,該病毒由6條RNA鏈構(gòu)成,每條RNA只編碼一個蛋白,它們依次編碼了 RNA依賴的RNA聚合酶、糖蛋白前體、核衣殼蛋白、運動蛋白和未知功能蛋白。②棗樹花葉相關(guān)病毒(Jujube mosaic-associated Badnavirus,JaBV),是花椰菜花葉病毒科、桿狀DNA病毒屬的新病毒,該病毒為環(huán)狀DNA病毒,由4個開讀框組成,分別編碼了一個未知蛋白、病毒相關(guān)蛋白、復(fù)制酶和未知蛋白。③中國棗樹卷葉伴隨病毒(Chinese jujube...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－２�。遥危辽疃葴y序數(shù)據(jù)分析流程??Ｆｉｇ．?２－２?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ?ｄｅｅｐ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄａｔａ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｐｒｏｃｅｓｓ??

北Ｍ農(nóng)７院碩丨：７位論文?策深度測屮鑒記忪染北Ａ地Ｋ電樹的�。�??２．２．１Ｊ數(shù)據(jù)處理和分析??對深度測印樣品進行建庫測序，對測序后原始數(shù)據(jù)，進行數(shù)據(jù)的處理和分析（圖２－２）。??（１）質(zhì)＿控制和數(shù)據(jù)評估：對得到的原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)量控制和數(shù)據(jù)評估。將測序質(zhì)量較低的小片??段進彳ｆ上....

圖３－１?ＪＹＭａＶ北京分離物基因組結(jié)構(gòu)??Ｆｉｇ．?３－１?Ｇｅｎｏｍｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＪＹＭａＶ?Ｊｕｊｕｂｅ?ｉｓｏｌａｔｅ??：，，，，５，＝??

北京農(nóng)￥院碩Ｉ：嗲位論文?第力棗樹候選�。５牧校两导佰悖祖桑商匦匝芯�??ＧＰ?ＮＰ??Ｉ?４３?７０４２／７１４３?１?１９０?２２８７／２３６４?１?１２０?１０３５?／１３２５??ＲＮＡ１?ＲＮＡ２?ＲＮＡ３??ＭＰ?????Ｌ＿?—??１?３２０?１４５９／１５５２?１?....

圖３－２?ＪａＢＶ棗樹分離株基因組結(jié)構(gòu)??２１??

：院碩丨：７位論義?第棗樹候選�。５呢辏毫锌私导佰悖黠|特ｎ研究??３．３．２棗樹相關(guān)桿狀ＤＮＡ病毒（ＪａＢＶ）棗樹分離株的分子特性研究??３．３．２．１?ＪａＢＶ棗樹分離株基因組結(jié)構(gòu)??根據(jù)病苺的分類地位和結(jié)構(gòu)，將病毒暫時命名為棗樹相關(guān)桿狀ＤＮＡ病毒（Ｊｕｊｕｂｅ?ａｓｓｏｃ....

圖３－６?ＡＳＧＶ棗樹分離株基因組結(jié)構(gòu)??

｜／｜丨１１〇丫６丨批１１１卩１＇（＾４１１（州）），５’－和３’－１＿１丁１＜氏分別力１９手丨丨１６３個核：？１：酸，??３’?－ＵＴＲ尾部無Ｐ〇ｌｙ（Ａ）尾巴。通過數(shù)據(jù)和結(jié)構(gòu)示意圖，可以看得出，０ＲＦ２內(nèi)嵌與０ＲＦ１，??這是線形病棉屬的結(jié)構(gòu)特點。??ＯＲＫ２??１?ｍｔ丨．....

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