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基于線粒體基因組探討紫貂種群遺傳結(jié)構(gòu)與進化歷史

發(fā)布時間:2024-03-24 05:22
  紫貂(Martes zibellina)曾是一種廣泛分布的鼬科動物,現(xiàn)僅在6個國家有分布。由于人類經(jīng)濟活動的干擾,棲息地環(huán)境破壞以及生境分布呈斑塊狀,國內(nèi)野外種群數(shù)量急劇減少,被中國列為國家Ⅰ級保護動物。紫貂物種起源中心地區(qū)一直是紫貂研究的熱點問題,俄羅斯南部遠東地區(qū)及中國東北部多次被認定為紫貂起源的中心地帶,目前的研究中,研究的種群多局限于該物種的局部分布區(qū),而缺乏從全局角度的研究,或所研究紫貂種群涉及的分布區(qū)域比較廣泛,但所用的標記比較單一。鑒于此,本研究通過測定國內(nèi)大興安嶺、小興安嶺、長白山地區(qū)和蒙古以及鄰近俄羅斯多個地區(qū)44只個體的紫貂種群完整線粒體基因組(除去D-loop)序列及43只個體線粒體部分控制區(qū)序列,結(jié)合GenBank公布的俄羅斯地區(qū)27條紫貂種群完整線粒體基因組(除去D-loop)序列數(shù)據(jù),通過對線粒體基因組序列分析來探討紫貂遺傳結(jié)構(gòu)及進化歷史。主要研究結(jié)果如下:1.紫貂的種內(nèi)差異主要表現(xiàn)在ND2、ND3、ND5和CYTB以及控制區(qū)基因,線粒體基因A+T含量明顯大于G+C含量,表明出現(xiàn)了明顯的AT偏好。2.中國大興安嶺和小興安嶺地理種群遺傳多樣性較高且遺傳分化較小...

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
1 緒論
    1.1 紫貂種群
    1.2 動物線粒體基因組
        1.2.1 概述
        1.2.2 遺傳特點
        1.2.3 紫貂線粒體基因組
    1.3 線粒體基因組在野生動物遺傳學(xué)中的應(yīng)用
    1.4 紫貂種群遺傳與進化研究現(xiàn)狀
        1.4.1 種群遺傳結(jié)構(gòu)
        1.4.2 進化歷史
    1.5 本論文的研究目的及意義
2 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 樣品信息
        2.1.2 實驗儀器設(shè)備與試劑
    2.2 實驗方法
        2.2.1 基因組DNA提取
        2.2.2 紫貂線粒體全基因組測序
        2.2.3 紫貂線粒體D-loop區(qū)的克隆與測序
    2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 實驗結(jié)果
        3.1.1 DNA提取
        3.1.2 PCR擴增
        3.1.3 控制區(qū)克隆
    3.2 序列特征與分析
        3.2.1 線粒體基因組(除去D-loop)
        3.2.2 控制區(qū)序列
    3.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)及進化歷史的分析
        3.3.1 線粒體基因組(除去D-loop)
        3.3.2 線粒體DNA控制區(qū)
4 討論
    4.1 種群遺傳結(jié)構(gòu)
    4.2 種群進化歷史
    4.3 中國紫貂種群保護建議
5 結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝



本文編號:3937031

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