為進(jìn)一步獲取煙草甲線粒體基因組信息,以期為煙草甲分類鑒定、系統(tǒng)發(fā)育和種群遺傳等方面的深入研究奠定基礎(chǔ),采用二代測(cè)序技術(shù)測(cè)定了煙草甲線粒體基因組序列。結(jié)果表明:煙草甲線粒體基因組全長(zhǎng)15 009 bp,包含13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)核糖體RNA基因、22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因和1個(gè)控制區(qū),基因組排列的順序和組成與鞘翅目?jī)?chǔ)糧害蟲(chóng)線粒體基因組相似。煙草甲線粒體基因組的A+T含量為78.7%,13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因除cox2基因的起始密碼子是TTG外,其余蛋白質(zhì)編碼基因的起始密碼子均為通用密碼子ATN;典型的TAA或TAG為9個(gè)基因的終止密碼子,而cox3、nad5、nad4以不完全的T作為終止密碼。煙草甲的22個(gè)tRNA均能折疊成三葉草結(jié)構(gòu),但tRNA^Asp、tRNA^Leu和tRNA^His的二級(jí)結(jié)構(gòu)中缺少TψC環(huán),tRNA⁽ser(AGN))的DHU(Dihydorouridine,二氫尿嘧啶)臂缺失,因而不能形成典型的三葉草式二級(jí)結(jié)構(gòu)。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品及DNA提取
    1.2 序列測(cè)定及組裝
    1.3 序列注釋和分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)
    2.2 線粒體基因組堿基組成及分析
    2.3 線粒體基因組PCGs基因
    2.4 線粒體基因組t RNA基因及r RNA基因
3 討論
4 結(jié)論



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