苦瓜(Mmordica charantiaL.)為葫蘆科蔬菜之一,適合在熱帶和溫帶地區(qū)栽培,白粉病是一種廣泛發(fā)生的世界性病害,發(fā)病時(shí)會(huì)導(dǎo)致苦瓜產(chǎn)量和品質(zhì)受到嚴(yán)重影響,因此苦瓜抗病育種研究是非常重要的科學(xué)問題。本研究首先利用苦瓜簡化基因組測序開發(fā)SSR引物,利用正交設(shè)計(jì)L16(44)的方法對(duì)苦瓜SSR-PCR反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化,并以4種表型差異較大的苦瓜材料DNA為模板,利用優(yōu)化的體系對(duì)本實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的SSR引物進(jìn)行篩選,并利用篩選出來的多態(tài)性引物對(duì)黃瓜、甜瓜、西瓜、絲瓜、冬瓜、南瓜這6種瓜類進(jìn)行PCR擴(kuò)增,研究苦瓜SSR引物在這6種瓜類作物中通用性;其次以高抗白粉病野生型苦瓜高代自交系04-17與高感白粉病栽培種高代自交系25作為親本,利用F2分離群體,構(gòu)建了 SSR遺傳圖譜,并對(duì)F2:3代家系白粉病病情指數(shù)進(jìn)行了初步定位。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:1、本次測序獲得Clean base 3.133G,總計(jì)Clean reads 12,533,97 條,有效率 99.02%,堿基的錯(cuò)誤率為0.04%,堿基GC含量35.61%。根據(jù)測序質(zhì)量分析結(jié)果,Q20≥94.69%,Q30≥90.28%,可知測序的質(zhì)...

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 引言
    1.2 SSR引物開發(fā)
        1.2.1 文庫篩選法
        1.2.2 富集法
        1.2.3 STMP和SAM
        1.2.4 EST-SSR
    1.3 苦瓜SSR引物開發(fā)
    1.4 遺傳圖譜的構(gòu)建
        1.4.1 作圖群體的構(gòu)建
        1.4.2 葫蘆科作物遺傳圖譜的研究進(jìn)展
    1.5 瓜類白粉病抗性的遺傳研究
        1.5.1 白粉病病原菌及癥狀
        1.5.2 白粉病的發(fā)病規(guī)律
        1.5.3 苦瓜白粉病抗性的遺傳規(guī)律研究
        1.5.4 瓜類抗白粉病分子標(biāo)記輔助育種的研究進(jìn)展
    1.6 研究的目的和意義
2 苦瓜SSR引物開發(fā)及其引物在瓜類作物中的穿梭性研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 苦瓜DNA的提取及DNA質(zhì)量檢測
        2.1.3 RAD-seq技術(shù)開發(fā)苦瓜SSR引物
        2.1.4 苦瓜SSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
        2.1.5 SSR-PCR擴(kuò)增及檢測
        2.1.6 篩選最佳的退火溫度
        2.1.7 多態(tài)性引物的篩選
        2.1.8 苦瓜SSR多態(tài)性引物對(duì)六種瓜類作物的通用性及多態(tài)性
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 DNA檢測
        2.2.2 苦瓜SSR引物開發(fā)
        2.2.3 SSR-PCR基本反應(yīng)體系的建立
        2.2.4 篩選最佳退火溫度
        2.2.5 多態(tài)性引物的篩選及其多態(tài)性分析
        2.2.6 苦瓜SSR多態(tài)性引物對(duì)六種瓜類作物擴(kuò)增的通用性及多態(tài)性分析
    2.3 討論
3 苦瓜SSR遺傳圖譜的構(gòu)建
    3.1 材料與方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 基因組DNA的提取
        3.1.3 SSR分子標(biāo)記實(shí)驗(yàn)步驟
        3.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 多態(tài)性引物的篩選
        3.2.2 分子標(biāo)記的偏分離
        3.2.3 苦瓜SSR遺傳圖譜的構(gòu)建
    3.3 結(jié)論與討論
4 苦瓜F_2:3代白粉病QTL定位
    4.1 材料與方法
        4.1.1 材料
        4.1.2 方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 不同測量時(shí)間F_2:3家系的白粉病抗性差異顯著性分析
        4.2.2 苦瓜白粉病抗性QTL定位
    4.3 結(jié)論與討論
5 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮寫詞組
附錄
    附錄1 非變性聚丙烯酰胺凝膠的制備及電泳
    附錄2 論文發(fā)表
致謝



本文編號(hào)：3807699