泡桐是一種經(jīng)濟(jì)價(jià)值較大的樹種,對(duì)改善生態(tài)環(huán)境、提高農(nóng)民生活水平等方面都有很重要的作用,而泡桐易受植原體入侵而患叢枝病,病害危害極其嚴(yán)重,給我國林業(yè)、經(jīng)濟(jì)、環(huán)境等方面造成巨大的損失。為了有效預(yù)防和防治這種病害,目前雖然做了很多研究,但其發(fā)病機(jī)制仍不清楚。為深入了解泡桐叢枝病發(fā)病過程蛋白質(zhì)變化的情況,采用同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量（i TRAQ）技術(shù)鑒定白花泡桐和毛泡桐健康幼苗、患叢枝病幼苗及不同濃度（分別為15 mg·L-1和75 mg·L-1）硫酸二甲酯（DMS）處理后恢復(fù)健康形態(tài)的患病幼苗的蛋白質(zhì),并對(duì)其進(jìn)行功能注釋和差異表達(dá)分析,得出以下結(jié)果:（1）白花泡桐4個(gè)樣品中共鑒定到2 969個(gè)蛋白。2 959個(gè)、2 692個(gè)、2 928個(gè)蛋白質(zhì)分別注釋到NCBI蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫和tr EMBL數(shù)據(jù)庫。由功能分類結(jié)果可知,共有2 640個(gè)蛋白質(zhì)比對(duì)到GO數(shù)據(jù)庫中,共注釋到51種功能類別。2 581個(gè)蛋白比對(duì)到COG數(shù)據(jù)庫中,共分為23個(gè)功能類別。KEGG數(shù)據(jù)庫比對(duì)結(jié)果中,2 324個(gè)蛋白質(zhì)參與121條代謝通路,主要參與代謝途徑、次生代謝產(chǎn)物生物合成和光合作用等途徑。在... 

【文章頁數(shù)】：52 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
        1.1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)產(chǎn)生背景和相關(guān)概念
        1.1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法
        1.1.3 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究進(jìn)展
    1.2 植原體病害研究
        1.2.1 植原體概述
        1.2.2 植原體侵入后寄主癥狀及致病機(jī)制
        1.2.3 植原體檢測(cè)、診斷及病害防治
    1.3 泡桐叢枝病研究
        1.3.1 泡桐叢枝病
        1.3.2 泡桐叢枝病研究現(xiàn)狀
    1.4 本文研究的目的和意義
2 引言
3 材料和方法
    3.1 試驗(yàn)材料及處理
    3.2 主要試劑和儀器設(shè)備
        3.2.1 主要試劑
        3.2.2 主要儀器設(shè)備
    3.3 實(shí)驗(yàn)過程
        3.3.1 蛋白質(zhì)提取
        3.3.2 蛋白質(zhì)酶解
        3.3.3 iTRAQ標(biāo)記
        3.3.4 SCX分離
        3.3.5 肽段分離和液相串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)分析
    3.4 生物信息學(xué)分析
        3.4.1 蛋白質(zhì)鑒定及定量分析
        3.4.2 蛋白功能注釋分析
    3.5 qRT-PCR驗(yàn)證試驗(yàn)
        3.5.1 總RNA的提取
        3.5.2 qRT-PCR驗(yàn)證
4 結(jié)果與分析
    4.1 白花泡桐蛋白質(zhì)鑒定及功能注釋
        4.1.1 白花泡桐蛋白質(zhì)含量測(cè)定
        4.1.2 白花泡桐蛋白質(zhì)鑒定質(zhì)量評(píng)估
        4.1.3 白花泡桐蛋白質(zhì)基本鑒定信息
        4.1.4 白花泡桐蛋白質(zhì)整體分布情況
        4.1.5 白花泡桐蛋白質(zhì)功能注釋統(tǒng)計(jì)
        4.1.6 白花泡桐總蛋白的GO功能分析
        4.1.7 白花泡桐蛋白質(zhì)的COG分析
        4.1.8 白花泡桐蛋白質(zhì)KEGG分析
        4.1.9 白花泡桐差異蛋白統(tǒng)計(jì)
    4.2 毛泡桐蛋白質(zhì)鑒定及功能注釋
        4.2.1 毛泡桐蛋白質(zhì)含量測(cè)定
        4.2.2 毛泡桐蛋白質(zhì)鑒定質(zhì)量評(píng)估
        4.2.3 毛泡桐蛋白質(zhì)基本鑒定信息
        4.2.4 毛泡桐蛋白質(zhì)整體分布情況
        4.2.5 毛泡桐蛋白質(zhì)功能注釋統(tǒng)計(jì)
        4.2.6 毛泡桐總蛋白的GO功能分析
        4.2.7 毛泡桐蛋白質(zhì)的COG分析
        4.2.8 毛泡桐總蛋白的KEGG分析
        4.2.9 毛泡桐差異蛋白統(tǒng)計(jì)
    4.3 差異表達(dá)蛋白質(zhì)統(tǒng)計(jì)及功能分析
        4.3.1 與叢枝病相關(guān)差異蛋白篩選
        4.3.2 與叢枝病發(fā)生相關(guān)的差異蛋白統(tǒng)計(jì)
        4.3.3 與叢枝病發(fā)生相關(guān)的差異蛋白功能分析
    4.4 qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果
5 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
攻讀碩士期間發(fā)表論文和獲獎(jiǎng)情況


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]iTRAQ技術(shù)及其在水稻蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 陳凌華,程祖鋅,許明,鄭金貴.  中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2017(12)
[2]植原體侵染對(duì)甜櫻桃葉片結(jié)構(gòu)功能的影響[J]. 譚鉞,朱東姿,魏海蓉,王甲威,宗曉娟,陳新,徐麗,劉慶忠.  植物生理學(xué)報(bào). 2017(07)
[3]泡桐叢枝病發(fā)生與代謝組變化的關(guān)系（英文）[J]. 曹亞兵,翟曉巧,鄧敏捷,趙振利,范國強(qiáng).  林業(yè)科學(xué). 2017(06)
[4]植物質(zhì)膜蛋白質(zhì)組的逆境應(yīng)答研究進(jìn)展[J]. 邱麗麗,趙琪,張玉紅,戴紹軍.  植物學(xué)報(bào). 2017(02)
[5]周年溫度變化對(duì)泡桐叢枝病植原體分布和消長的影響[J]. 曹亞兵,翟曉巧,介大委,范國強(qiáng).  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(10)
[6]花生核糖體蛋白L29-1（RPL29-1）基因克隆表達(dá)分析及載體構(gòu)建[J]. 曹廣英,吳琪,唐月異,王秀貞,孫全喜,關(guān)淑艷,王傳堂.  分子植物育種. 2016(07)
[7]利用轉(zhuǎn)錄組及iTRAQ技術(shù)篩選高油酸油菜抗病相關(guān)基因[J]. 張振乾,肖鋼,官春云,鄔賢夢(mèng),熊興華,李云昌,胡瓊,陳社員.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(05)
[8]水稻響應(yīng)稻瘟病菌侵染的差異表達(dá)蛋白分析[J]. 陳默,宋吉強(qiáng),馬洪雨.  中國科技論文. 2015(12)
[9]馬尾松鈣調(diào)素基因的克隆及響應(yīng)松材線蟲侵染的表達(dá)特征[J]. 徐亮,劉振宇,呂全,梁軍,張星耀.  林業(yè)科學(xué)研究. 2014(03)
[10]甲基磺酸甲酯對(duì)毛泡桐叢枝病苗DNA甲基化的影響[J]. 曹喜兵,趙振利,范國強(qiáng),鄧敏捷,董焱鵬.  林業(yè)科學(xué). 2014(03)

博士論文
[1]Candidatus liberibacter asiaticus誘導(dǎo)的柑橘轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白組學(xué)研究[D]. 鐘云.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012

碩士論文
[1]番茄鈣調(diào)蛋白和類鈣調(diào)蛋白的抗病調(diào)控功能分析[D]. 劉維.浙江大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3667044