馬鈴薯,屬茄科多年生草本植物,塊莖可供食用,是全球第四大重要的糧食作物,僅次于小麥、稻谷和玉米。中國是世界上馬鈴薯總產(chǎn)最多的國家,其次為俄羅斯,印度和烏克蘭。2015年,中國開始啟動馬鈴薯主糧化戰(zhàn)略,推進(jìn)把馬鈴薯加工成饅頭、面條、米粉等主食,馬鈴薯將成稻米、小麥、玉米外的又一主糧。但在馬鈴薯生產(chǎn)過程中,卻面臨著很多病害的威脅,比如馬鈴薯瘡痂病、青枯病、干腐病、早疫病和晚疫病等。其中,馬鈴薯瘡痂病對馬鈴薯的種植的危害最為嚴(yán)重,患有該病的馬鈴薯嚴(yán)重影響馬鈴薯的外觀形象,甚至?xí)瘃R鈴薯產(chǎn)量的降低,嚴(yán)重阻礙馬鈴薯的商業(yè)市場化。該病是由鏈霉菌引起的一種土傳病害,由致病性鏈霉菌產(chǎn)生毒害植物的次級代謝產(chǎn)物thaxtomins引起。通常,瘡痂病害可以導(dǎo)致馬鈴薯表面產(chǎn)生深棕色、木栓質(zhì)的突起瘡痂、凹陷瘡痂或網(wǎng)狀瘡痂。S.scabies,S.turgidiscabies和S.acidiscabies是三種最主要的馬鈴薯瘡痂病致病菌。微生物多樣性是研究中的基礎(chǔ)性研究。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,以16S r DNA為基礎(chǔ)的分子生物學(xué)技術(shù),如DGGE,T-RFLP等在微生物多樣性的研究中起了非常重要的作用,尤其是以... 

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 馬鈴薯及馬鈴薯瘡痂病介紹
        1.1.1 馬鈴薯介紹
        1.1.2 馬鈴薯瘡痂病介紹
        1.1.3 中國馬鈴薯瘡痂病的微生物防治方法
    1.2 微生物多樣性的研究方法
        1.2.1 傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法
        1.2.2 基于分子生物學(xué)技術(shù)的非培養(yǎng)方法
        1.2.3 末端限制性片段長度多態(tài)性分析(T-RFLP)
        1.2.4 變性/溫度梯度凝膠電泳(DGGE/TGGE)
        1.2.5 熒光原位雜交技術(shù)(FISH)
        1.2.6 高通量測序技術(shù)(High-thought put sequencing)
    1.3 致病性鏈霉菌的檢測
    1.4 菌株相互關(guān)系
    1.5 研究目的
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 培養(yǎng)基
        2.1.3 主要試劑及酶
        2.1.4 引物序列
        2.1.5 主要儀器設(shè)備
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 樣品的采集及處理
        2.2.2 高通量測序方法
            2.2.2.1 提取細(xì)菌總DNA
            2.2.2.2 DNA質(zhì)量檢測
            2.2.2.3 16S rDNA文庫制備和庫檢
            2.2.2.4 庫檢
            2.2.2.5 測序
            2.2.2.6 信息分析流程
            2.2.2.7 數(shù)據(jù)過濾統(tǒng)計(jì)
            2.2.2.8 序列拼接
            2.2.2.9 OTU統(tǒng)計(jì)分析
            2.2.2.10 數(shù)據(jù)計(jì)算方法
        2.2.3 傳統(tǒng)可培養(yǎng)方法
            2.2.3.1 可培養(yǎng)微生物的分離程序
            2.2.3.2 可培養(yǎng)微生物DNA的提取
            2.2.3.3 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)PCR擴(kuò)增
            2.2.3.4 同源性比對與系統(tǒng)發(fā)育樹的建立
            2.2.3.5 致病基因擴(kuò)增
        2.2.4 相互作用關(guān)系(十字劃線法)
3 結(jié)果與分析
    3.1 高通量測序結(jié)果
        3.1.1 數(shù)據(jù)過濾統(tǒng)計(jì)
        3.1.2 稀釋曲線分析
        3.1.3 細(xì)菌多樣性分析
        3.1.4 物種相關(guān)性分析
        3.1.5 真菌多樣性分析
    3.2 可培養(yǎng)方法結(jié)果
        3.2.1 可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性
            3.2.1.1 可培養(yǎng)細(xì)菌的分離情況
            3.2.1.2 可培養(yǎng)放線菌的分離情況
        3.2.2 可培養(yǎng)真菌多樣性
    3.3 菌株間抑制作用關(guān)系
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]土傳病害生物防治研究進(jìn)展[J]. 李興龍,李彥忠.  草業(yè)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]四川松茸內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與多樣性[J]. 李強(qiáng),李小林,黃文麗,熊川,楊陽,楊志榮,鄭林用.  應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2014(11)
[3]植物病害生物防治概述[J]. 李凱,袁鶴.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[4]環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)與功能多樣性研究方法[J]. 劉開朗,王加啟,卜登攀,李旦,于萍,趙圣國.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(04)
[5]一種簡單、有效的適于PCR操作的放線菌DNA提取方法[J]. 姜淑梅,張龍,戴世鯤,李翔.  生物技術(shù). 2007(01)
[6]中國馬鈴薯瘡痂病研究初報(bào)[J]. 趙偉全,楊文香,劉大群,張汀,孟慶芳,張麗蕊.  河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(06)
[7]拮抗細(xì)菌的研究進(jìn)展[J]. 程亮,游春平,肖愛萍.  江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(05)
[8]熒光原位雜交在環(huán)境微生物學(xué)中的應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 邢德峰,任南琪,李建政.  環(huán)境科學(xué)研究. 2003(03)



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