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家蠶BmSpatzle4新剪接異構(gòu)體的發(fā)現(xiàn)及其在體壁中對不同微生物的免疫響應(yīng)

發(fā)布時間:2022-02-19 04:25
  在本研究中,我們克隆了1567bp的BmSpatzle4(BmSpz4)cDNA,其中包含一個完整的1386 bp開放閱讀框,編碼461個氨基酸,克隆所得序列其ORF比家蠶基因組數(shù)據(jù)庫中預(yù)測的BmSpz4(BGIBMGA008841-TA)的ORF長108 bp,在5’端多編碼36個氨基酸,其前19個氨基酸為信號肽。信號肽是一種存在于大部分的新合成的蛋白質(zhì)的N端的短肽,信號肽引導(dǎo)新合成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移,在分泌蛋白質(zhì)的過程中起著非常重要的作用。BmSpz4基因位于3號染色體的Bmscaf174上,在基因組中只有1個拷貝。BmSpz4基因共有6個外顯子、5個內(nèi)含子,BmSpz4包含了一個Spatzle域。ExPASy預(yù)測BmSpz4蛋白的分子量為53.19 kDa,等電點為5.56。ProtScale氨基酸序列的疏水性分析表明,BmSpz4蛋白的最大疏水性為3.333,最小值為-3.011,蛋白質(zhì)序列的疏水和親水區(qū)交錯。BmSpz4的氨基酸序列與岡比亞按蚊、大蜜蜂、果蠅、麗蠅蛹集金小蜂、赤擬谷盜Spz有著較近的親緣關(guān)系。從初步的研究結(jié)果判斷BmSpz4存在著兩種... 

【文章來源】:江蘇科技大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.1 物理防御
        1.2.2 免疫識別
        1.2.3 細(xì)胞免疫
        1.2.4 體液免疫
    1.3 研究內(nèi)容
    1.4 研究意義
第2章 家蠶BmSpz4基因的克隆及序列分析
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 引物設(shè)計
        2.2.3 提取家蠶表皮總RNA
        2.2.4 反轉(zhuǎn)錄PCR
        2.2.5 瓊脂糖凝膠電泳
        2.2.6 PCR產(chǎn)物切膠回收
        2.2.7 目的片段與pMD18-T載體的連接
        2.2.8 質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化
        2.2.9 抽提重組質(zhì)粒DNA
        2.2.10 重組質(zhì)粒DNA的酶切鑒定
        2.2.11 BmSpz4生物信息學(xué)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 BmSpz4基因的克隆及測序
        2.3.2 信號肽
        2.3.3 選擇性剪接
        2.3.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.4 本章小結(jié)與討論
第3章 家蠶BmSpz4基因在組織中的表達(dá)情況
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 實驗材料
        3.2.2 引物設(shè)計
        3.2.3 提取家蠶各組織總RNA
        3.2.4 半定量反轉(zhuǎn)錄PCR
        3.2.5 瓊脂糖凝膠電泳
    3.3 結(jié)果與分析
    3.4 本章小結(jié)與討論
第4章 BmSpz4基因經(jīng)不同微生物誘導(dǎo)后的表達(dá)情況
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 實驗材料
        4.2.2 引物設(shè)計
        4.2.3 注射微生物
        4.2.4 提取家蠶體壁總RNA
        4.2.5 半定量反轉(zhuǎn)錄PCR
        4.2.6 瓊脂糖凝膠電泳
    4.3 結(jié)果與分析
    4.4 本章小結(jié)與討論
第5章 對BmSpz4基因進(jìn)行RNA干擾后抗菌肽的表達(dá)情況
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 實驗材料
        5.2.2 引物設(shè)計
        5.2.3 制備雙鏈RNA
        5.2.4 注射 dsRNA
        5.2.5 提取總RNA
        5.2.6 半定量反轉(zhuǎn)錄PCR
        5.2.7 瓊脂糖凝膠電泳
    5.3 結(jié)果與分析
    5.4 本章小結(jié)與討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
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致謝



本文編號:3632213

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