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棉花黃萎病菌株間病毒種類差異及生物防治潛力分析

發(fā)布時間:2022-01-14 15:52
  棉花黃萎。╒erticillium wilt)是典型的土傳、維管束真菌病害,但該病害防治難度大,故又被稱為棉花上的“癌癥”。防治棉花黃萎病的方法主要有選育抗病品種、化學(xué)防治、農(nóng)業(yè)防治和生物防治等措施,而利用生物防治方法防治棉花黃萎病越來越受到人們的關(guān)注。弱毒相關(guān)真菌病毒的發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用為生物防治提供了有益補充,利用真菌病毒治療板栗疫病和油菜菌核病取得了成功。因此,從棉花黃萎病菌中篩選可引起致病力衰退的相關(guān)病毒,可望為棉花黃萎病的生物防治提供新的病毒資源。發(fā)現(xiàn)大麗輪枝菌強毒力菌株和低毒力菌株間攜帶病毒的種類存在明顯差異。本研究以10株強致病力和弱致病力的單孢后代菌株為研究材料,在明確菌株致病力的基礎(chǔ)上,分別進行高通量宏病毒組測序,結(jié)果表明棉花黃萎病菌中攜帶豐富的病毒種類,多數(shù)為未曾報道或分類地位不明確的病毒。10株弱致病力菌株中總共攜帶42種病毒,按核酸類型可分為正單鏈RNA病毒、負單鏈RNA病毒、雙鏈RNA病毒及尚未進行分類的病毒;其中單鏈RNA病毒占52%,dsRNA病毒占19%,未分類的病毒占29%。強致病力菌株中總共攜帶1種病毒,為負單鏈RNA病毒。通過兩種不同致病力菌株所含病毒類... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

棉花黃萎病菌株間病毒種類差異及生物防治潛力分析


菌株的生長培養(yǎng)性狀(12天,25℃)

瓊脂糖,凝膠電泳,病毒,菌株


中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章棉花黃萎病菌中病毒多樣性17圖2-4菌株總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測Fig.2-4DetectionoftotalRNAofstrainsbyagarosegelelectrophoresis注:左圖為強致病力菌株總RNA;右圖為弱致病力菌株總RNANote:ThepictureontheleftshowsthetotalRNAofvirulentstrains;ThepictureontherightshowsthetotalRNAofweaklypathogenicstrains.OD260/OD280比值是區(qū)別RNA好壞的一個重要參數(shù),通常好的RNAOD260/OD280比值在1.9-2.1之間,最低濃度高于120ng/μl,經(jīng)過檢測提取的樣品都符合標準,也符合高通量測序的要求。2.3.6高通量測序結(jié)果分析通過高通量測序得到病毒遺傳信息后,利用NCBI在GenBank上進行同源性比對,通過比對10株弱致病力菌株的測序結(jié)果,按核酸類型的分類將獲得的病毒可分為正單鏈RNA病毒、負單鏈RNA病毒、雙鏈RNA病毒和尚未進行分類的病毒(圖2-5A),其中ssRNA病毒占52%,dsRNA病毒占19%,通過數(shù)據(jù)對比發(fā)現(xiàn)ssRNA病毒占據(jù)的比例較大,但是根據(jù)相關(guān)的資料顯示目前dsRNA病毒是發(fā)現(xiàn)數(shù)量最多的,ssRNA只占1/3(PEARSONetal.,2009)。正單鏈RNA病毒主要有番茄叢矮病毒科(Tombusviridae)、歐爾密病毒屬(Ourmiavirus)、裸露RNA病毒(Narnaviridae)和未分類的病毒(圖2-5B)。其中歐爾密病毒屬和番茄叢矮病毒科各占59%和29%,裸露RNA病毒科占6%,未分類的病毒占6%。以上比對得到的病毒宿主大多數(shù)為植物類,從另一面表現(xiàn)出真菌病毒分化于植物病毒,植物病毒通過植物病原菌進入到真菌,經(jīng)過長時間不停地演變進化,進而成為了真菌病毒。負單鏈RNA病毒主要是一些未分類的病毒。雙鏈RNA病毒主要有雙分體病毒(Partitiviridae)和產(chǎn)黃青霉病毒科(Chrysoviridae),2種病毒在數(shù)量上各占一半。另外還有許多分類地位不明確的病?

病毒,黃萎病,棉花,核酸


中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章棉花黃萎病菌中病毒多樣性18圖2-5棉花黃萎病菌病毒種類呈現(xiàn)多樣性A病毒核酸類型分類;B正單鏈RNA病毒分類Fig.2-5ThediversityofmycovirusesisolatedfromVerticilliumA:Classificationoftheviralnucleicacidtype;B:ClassificationofthePositivesingle-strandedRNAvirus表2-4弱致病力菌株測序獲得的病毒信息Table2-4ClassificationofvirusfromweaklypathogenicstrainsTypeFamilyNumberExamplePositive-strandedRNAvirusTombusviridaeNarnaviridaeOurmiavirusUnassigned51101Sclerotiniasclerotiorumumbra-likevirus3Sclerotiniasclerotiorummitovirus6Erysiphenecatorassociatedourmia-likevirus7Trichodermaharzianumambiguivirus1Negative-strandedRNAvirusUnassigned5Fusariumpoaenegative-strandedvirus2Double-strandedRNAvirusPartitiviridaeChrysoviridae44VerticilliumdahliaepartitivirusMacrophominaphaseolinachrysovirus1強致病力菌株的測序結(jié)果通過NCBI在GenBank上進行同源性比對,根據(jù)核酸類型的分類可以將得到的病毒信息分為負單鏈RNA病毒。負單鏈RNA病毒有布尼亞病毒科(Bunyaviridae)(表2-5)。表2-5強致病力菌株測序獲得的病毒信息Table2-5ClassificationofvirusfromvirμlentstrainsTypeFamilyNumberExampleNegative-strandedRNAvirusBunyaviridae1Plasmoparaassociatedmycobunyavirales-likevirus1

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]腹瀉兒童及靈長類動物腸道病毒宏基因組學(xué)研究[D]. 周成林.江蘇大學(xué) 2015
[2]我國棉花黃萎病菌的致病力分化及致病相關(guān)基因的克隆與分析[D]. 朱荷琴.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013



本文編號:3588785

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