水稻干尖線蟲（Aphelenchoides besseyi Christie,1942）和菊花滑刃線蟲（Aphelenchoides ritzemabosi（Schwartz,1911）Steiner&Buhrer,l932）屬于線蟲門（Nematoda）、側(cè)尾腺口綱（Secernentea）、滑刃目（Aphelenchida）、滑刃亞目（Aphelenchina）、滑刃科（Aphelenchoididae）。這兩種線蟲均是寄生危害植物地上部分的重要植物病原線蟲,又被稱為葉線蟲,分布廣泛,危害許多植物。轉(zhuǎn)錄組de novo測序是指在不需要物種基因組序列信息的情況下,用新一代高通量測序技術(shù)對某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的轉(zhuǎn)錄本進行測序、組裝得到轉(zhuǎn)錄本序列信息。維生素和脂肪酸結(jié)合蛋白（FAR）是一種線蟲特有的蛋白,參與了線蟲中許多重要的生物過程。為了從分子水平上了解水稻干尖線蟲和菊花葉枯線蟲的發(fā)育繁殖和寄生特性,深入解析這兩種線蟲與寄主相互作用的機制,本論文利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù),通過Illumina HiSeq?2000平臺,首次對水稻干尖線蟲兩個致病力不同的混合蟲態(tài)種群和菊花葉枯... 

【文章來源】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：166 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

水稻干尖線蟲Contig的長度分布統(tǒng)計

26圖 2.2 水稻干尖線蟲 Unigene 的長度分布統(tǒng)計A：水稻干尖線蟲 N10 種群的 Unigene 長度分布；B：水稻干尖線蟲 S24 種群的 Unigene 長度分布；C：水稻干尖線蟲兩個種群的 Unigene 長度分布；橫坐標(biāo)是組裝出來的 Unigene 的長度，縱坐標(biāo)是對應(yīng)長度的 Unigene 的數(shù)目。Figure 2.2 Unigene length distribution of Aphelenchoides besseyiA: Unigene length distribution of N10 A. besseyi, B: Unigene length distribution of S24 A. besseyi, C:Unigene length distribution of two populations of A.besseyi, the horizontal coordinates are Unigene lengthsand the vertical coordinates are numbers of Unigene

圖 2.3 水稻干尖線蟲兩個混合蟲態(tài)種群的 NR 分類圖R 注釋的 e-value 分布；B：NR 注釋的相似度分布；C： NR 注釋的物種分布re 2.3 The NR classification of unigenes in two mixed-stage populations ofAphelenchoides besseyihe E-value distribution of the result of NR annotation; B: The similarity distribution of the result nnotation; C: The species distribution of the result of NR annotation（3）GO 分類和 KEGG 注釋在 GO 注釋中，9896 個 unigenes 注釋到 3 個大類別（生物過程、細(xì)胞定位和分子）中的 55 個小類別中，在生物過程、細(xì)胞定位和分子功能類別中注釋到最多enes 的分別是單有機體過程類別（single-organism processes）、細(xì)胞中（cell）和結(jié)性（binding activity）（圖 2.5）。水稻干尖線蟲的 unigenes 注釋在 KEGG 數(shù)據(jù)庫的

【參考文獻】：
期刊論文
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